11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6616 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6616  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  217  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  42.86 
 
 
366 aa  57  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  44.12 
 
 
321 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5506  twin-arginine translocation pathway signal  34.85 
 
 
363 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  45.31 
 
 
316 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03601  conserved hypothetical protein  43.28 
 
 
367 aa  50.4  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  39.39 
 
 
356 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  34.12 
 
 
316 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  38.81 
 
 
337 aa  44.7  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  40.91 
 
 
313 aa  44.3  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  37.5 
 
 
315 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>