215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2267 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2267  hypothetical protein  100 
 
 		 590 aa  1207    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.22249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1654  chromosome segregation ATPase; intracellular signalling protein  34.4 
 
 		 596 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.353113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3338  hypothetical protein  33.45 
 
 		 641 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0108944 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3587  Diverse 7TM receptor transmembrane region  28.36 
 
 		 642 aa  248  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361331  hitchhiker  0.0015887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4358  Diverse 7TM receptor transmembrane region  26.48 
 
 		 600 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934126  normal  0.0321305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5597  Diverse 7TM receptor transmembrane region  26.47 
 
 		 634 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1222  signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 650 aa  157  6e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3468  sensor histidine kinase  28.38 
 
 		 651 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2391  Diverse 7TM receptor transmembrane region  26.88 
 
 		 726 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0529  diguanylate cyclase  25.42 
 
 		 614 aa  128  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1988  sensor protein for response regulator AtoC  26.46 
 
 		 715 aa  126  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.431904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0255  sensor protein  29.61 
 
 		 631 aa  123  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  24.53 
 
 		 565 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.4 
 
 		 802 aa  117  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4339  sensor histidine kinase  24.8 
 
 		 677 aa  117  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.691571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0992  two-component sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 696 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0439814  normal  0.153335 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2730  diguanylate cyclase  24.41 
 
 		 638 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.814579  normal  0.595433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.07 
 
 		 662 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00238573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.07 
 
 		 663 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2109  diguanylate cyclase  26.86 
 
 		 630 aa  112  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.843932  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4796  sensor histidine kinase  23.73 
 
 		 668 aa  110  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1456  diguanylate cyclase  24.69 
 
 		 636 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.07 
 
 		 662 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475165 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2799  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  25.46 
 
 		 716 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000869  normal  0.160664 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3844  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.24 
 
 		 867 aa  107  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.38 
 
 		 662 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  25.07 
 
 		 795 aa  107  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4944  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.31 
 
 		 782 aa  106  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.947631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  23.39 
 
 		 611 aa  100  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1062  diguanylate cyclase  24.42 
 
 		 566 aa  99  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0191664  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3589  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.04 
 
 		 853 aa  98.6  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.33 
 
 		 914 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  30.31 
 
 		 730 aa  97.4  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2797  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  26.65 
 
 		 707 aa  95.9  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000203115  normal  0.0370017 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3939  response regulator receiver domain-containing protein  23.89 
 
 		 588 aa  93.6  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.238688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.38 
 
 		 644 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00181069  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  25.13 
 
 		 708 aa  92.8  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2800  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  28.84 
 
 		 696 aa  92.4  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120614  normal  0.163305 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4218  diguanylate cyclase  20.8 
 
 		 631 aa  89.7  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  26.75 
 
 		 724 aa  88.6  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2954  diguanylate cyclase  21.62 
 
 		 612 aa  87.4  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0512853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  23.2 
 
 		 918 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1906  response regulator receiver domain-containing protein  21.91 
 
 		 603 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3414  diverse 7TM receptor, extracellular region 2  21.61 
 
 		 560 aa  82.4  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2871  response regulator  24.74 
 
 		 564 aa  82  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  23.62 
 
 		 918 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0651  diguanylate cyclase  23.39 
 
 		 627 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.605256  hitchhiker  0.0000117316 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.6 
 
 		 749 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0141753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0469  diguanylate cyclase  24.21 
 
 		 601 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6429  response regulator receiver protein  21.83 
 
 		 553 aa  77.4  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2507  hypothetical protein  32.48 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0845  diguanylate cyclase  23.19 
 
 		 578 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0467  diguanylate cyclase  24.48 
 
 		 641 aa  77  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1596  Diverse 7TM receptor transmembrane region  23.76 
 
 		 660 aa  75.5  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0100  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.8 
 
 		 1182 aa  75.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3210  GGDEF domain-containing protein  21.58 
 
 		 624 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65090  hypothetical protein  22.46 
 
 		 673 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3230  hypothetical protein  31.9 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1543  hypothetical protein  32.2 
 
 		 359 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3177  hypothetical protein  32.2 
 
 		 366 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0357941  normal  0.042708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3779  hypothetical protein  32.2 
 
 		 334 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5775  hypothetical protein  32.2 
 
 		 334 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230783 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05790  transmembrane signal transduction protein  22.31 
 
 		 634 aa  71.2  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5545  hypothetical protein  31.03 
 
 		 334 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.040244 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3381  diguanylate cyclase  20.73 
 
 		 622 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5066  hypothetical protein  31.03 
 
 		 334 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00565  Signaling protein with a acyltransferase and GGDEF domains  24.63 
 
 		 628 aa  68.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5656  GGDEF domain-containing protein  23.5 
 
 		 629 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3800  diguanylate cyclase  22.7 
 
 		 621 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6490  ATP-binding region ATPase domain protein  21.87 
 
 		 636 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.15 
 
 		 686 aa  66.6  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000161382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  30.29 
 
 		 1042 aa  65.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1301  diguanylate cyclase  21.71 
 
 		 561 aa  65.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2990  diverse 7TM receptor extracellular region 2  23.56 
 
 		 765 aa  66.2  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.908538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0453  GGDEF domain-containing protein  23.83 
 
 		 641 aa  65.1  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0069  hypothetical protein  28.91 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2509  hypothetical protein  28.91 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000139438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3178  hypothetical protein  28.91 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1782  diguanylate cyclase  20.51 
 
 		 629 aa  64.3  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0507  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.51 
 
 		 1045 aa  63.9  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0519  diguanylate cyclase  21.96 
 
 		 631 aa  63.9  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.447681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1007  signal transduction histidine kinase, LytS  18.93 
 
 		 684 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4607  histidine kinase  20.78 
 
 		 696 aa  63.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.998833  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2666  hypothetical protein  31.09 
 
 		 319 aa  63.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0915  hypothetical protein  31.09 
 
 		 319 aa  63.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2134  hypothetical protein  31.09 
 
 		 319 aa  63.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4207  GGDEF domain-containing protein  23.02 
 
 		 625 aa  62.4  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3166  hypothetical protein  31.71 
 
 		 345 aa  62  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3136  hypothetical protein  31.71 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.491071  normal  0.0566917 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5836  hypothetical protein  34.02 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  23.32 
 
 		 914 aa  61.2  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1964  hypothetical protein  33.33 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2430  hypothetical protein  33.33 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.762343 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2804  hypothetical protein  31.96 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.323871 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4157  hypothetical protein  33.33 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1637  sensor histidine kinase  23.92 
 
 		 656 aa  60.1  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0556277  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3708  ISSpo8, transposase  26.67 
 
 		 329 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2693  diguanylate cyclase  18.87 
 
 		 570 aa  58.9  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5543  histidine kinase  21.59 
 
 		 637 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.88701  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0498  diguanylate cyclase  22.04 
 
 		 624 aa  56.6  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>