233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1654 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1654  chromosome segregation ATPase; intracellular signalling protein  100 
 
 
596 aa  1215    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.353113  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2267  hypothetical protein  33.45 
 
 
590 aa  352  1e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.22249  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3338  hypothetical protein  35.13 
 
 
641 aa  323  6e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0108944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5597  Diverse 7TM receptor transmembrane region  32.35 
 
 
634 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3587  Diverse 7TM receptor transmembrane region  30.05 
 
 
642 aa  303  5.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361331  hitchhiker  0.0015887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4358  Diverse 7TM receptor transmembrane region  29.36 
 
 
600 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934126  normal  0.0321305 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3468  sensor histidine kinase  33.25 
 
 
651 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2391  Diverse 7TM receptor transmembrane region  28.54 
 
 
726 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1222  signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 
650 aa  161  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495402  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4796  sensor histidine kinase  25.39 
 
 
668 aa  160  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4339  sensor histidine kinase  25.73 
 
 
677 aa  160  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.691571  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1988  sensor protein for response regulator AtoC  28.54 
 
 
715 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.431904  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.75 
 
 
802 aa  153  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0255  sensor protein  28.74 
 
 
631 aa  151  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2799  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  27.66 
 
 
716 aa  150  6e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000869  normal  0.160664 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  27.69 
 
 
708 aa  150  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2797  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  26.95 
 
 
707 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000203115  normal  0.0370017 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3939  response regulator receiver domain-containing protein  25.37 
 
 
588 aa  146  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.238688  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4944  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.13 
 
 
782 aa  146  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.947631  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1456  diguanylate cyclase  26.58 
 
 
636 aa  144  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  30.62 
 
 
724 aa  142  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  25.72 
 
 
795 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.87 
 
 
662 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00238573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.06 
 
 
662 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.475165 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.52 
 
 
662 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203793  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0529  diguanylate cyclase  26.13 
 
 
614 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2800  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  27.68 
 
 
696 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120614  normal  0.163305 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  23.37 
 
 
565 aa  131  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.01 
 
 
663 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 
644 aa  124  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00181069  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2109  diguanylate cyclase  24.35 
 
 
630 aa  123  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.843932  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3844  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.33 
 
 
867 aa  123  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1906  response regulator receiver domain-containing protein  25.41 
 
 
603 aa  121  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  25.89 
 
 
611 aa  121  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2730  diguanylate cyclase  25.1 
 
 
638 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.814579  normal  0.595433 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.1 
 
 
749 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0141753  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4218  diguanylate cyclase  24.03 
 
 
631 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3589  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.32 
 
 
853 aa  114  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  29.79 
 
 
730 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2954  diguanylate cyclase  24.65 
 
 
612 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0512853  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6490  ATP-binding region ATPase domain protein  22.99 
 
 
636 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2871  response regulator  23.84 
 
 
564 aa  105  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0992  two-component sensor histidine kinase  23.13 
 
 
696 aa  99  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0439814  normal  0.153335 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05790  transmembrane signal transduction protein  22.27 
 
 
634 aa  97.8  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0651  diguanylate cyclase  22.55 
 
 
627 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.605256  hitchhiker  0.0000117316 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3210  GGDEF domain-containing protein  22.82 
 
 
624 aa  95.9  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0507  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 
1045 aa  95.5  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0469  diguanylate cyclase  22.98 
 
 
601 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912167  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0423  diguanylate cyclase  22.3 
 
 
621 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000679734 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1061  diguanylate cyclase  20.78 
 
 
632 aa  92.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.656983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0411  diguanylate cyclase  21.94 
 
 
628 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0437  periplasmic/7TM domain sensor diguanylate cyclase  22.74 
 
 
628 aa  91.7  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0211155 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3903  periplasmic/7TM domain sensor diguanylate cyclase  22.12 
 
 
628 aa  90.9  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0519  diguanylate cyclase  21.91 
 
 
631 aa  90.9  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.447681 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0845  diguanylate cyclase  26.7 
 
 
578 aa  90.1  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3800  diguanylate cyclase  21.81 
 
 
621 aa  89.7  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1637  sensor histidine kinase  24.89 
 
 
656 aa  88.6  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0556277  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2507  hypothetical protein  40.18 
 
 
333 aa  89  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3230  hypothetical protein  38.39 
 
 
356 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0453  GGDEF domain-containing protein  21.83 
 
 
641 aa  88.2  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1543  hypothetical protein  38.39 
 
 
359 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.165042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3177  hypothetical protein  38.39 
 
 
366 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0357941  normal  0.042708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3779  hypothetical protein  38.39 
 
 
334 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5775  hypothetical protein  38.39 
 
 
334 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0230783 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4207  GGDEF domain-containing protein  21.39 
 
 
625 aa  87.8  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1562  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.14 
 
 
680 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.327156  normal  0.581936 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0498  diguanylate cyclase  21.34 
 
 
624 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4607  histidine kinase  21.81 
 
 
696 aa  86.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.998833  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  24.94 
 
 
918 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5545  hypothetical protein  37.5 
 
 
334 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.040244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5066  hypothetical protein  37.5 
 
 
334 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.34 
 
 
914 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3381  diguanylate cyclase  22.37 
 
 
622 aa  84  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1062  diguanylate cyclase  24.07 
 
 
566 aa  82.4  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0191664  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6429  response regulator receiver protein  23.18 
 
 
553 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  24.11 
 
 
918 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0467  diguanylate cyclase  19.86 
 
 
641 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1596  Diverse 7TM receptor transmembrane region  24.2 
 
 
660 aa  80.9  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0100  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.54 
 
 
1182 aa  80.5  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  23.13 
 
 
1042 aa  79.7  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00565  Signaling protein with a acyltransferase and GGDEF domains  23.14 
 
 
628 aa  78.6  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1301  diguanylate cyclase  27.98 
 
 
561 aa  78.2  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4104  diguanylate cyclase  21.46 
 
 
610 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.147884 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3733  diguanylate cyclase  20 
 
 
625 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3559  diguanylate cyclase  20 
 
 
625 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0397  diguanylate cyclase  20 
 
 
625 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65090  hypothetical protein  22.25 
 
 
673 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5656  GGDEF domain-containing protein  23.16 
 
 
629 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1782  diguanylate cyclase  20.73 
 
 
629 aa  71.6  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0819  ISSod11, transposase  32.85 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1282  ISSod11, transposase  32.85 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1394  ISSod11, transposase  32.85 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1436  ISSod11, transposase  32.85 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1456  ISSod11, transposase  32.85 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1950  ISSod11, transposase  32.85 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2187  ISSod11, transposase  32.85 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2210  ISSod11, transposase  32.85 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2819  ISSod11, transposase  32.85 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3321  ISSod11, transposase  32.85 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2284  ISSod11, transposase  32.85 
 
 
306 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>