202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3338 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3338  hypothetical protein  100 
 
 		 641 aa  1304    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0108944 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1654  chromosome segregation ATPase; intracellular signalling protein  35.13 
 
 		 596 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.353113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2267  hypothetical protein  33.45 
 
 		 590 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.22249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4358  Diverse 7TM receptor transmembrane region  28.71 
 
 		 600 aa  263  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934126  normal  0.0321305 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3587  Diverse 7TM receptor transmembrane region  27.69 
 
 		 642 aa  258  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361331  hitchhiker  0.0015887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5597  Diverse 7TM receptor transmembrane region  26.41 
 
 		 634 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1222  signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 650 aa  169  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2391  Diverse 7TM receptor transmembrane region  25.99 
 
 		 726 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3468  sensor histidine kinase  28.13 
 
 		 651 aa  144  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0255  sensor protein  26.47 
 
 		 631 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1988  sensor protein for response regulator AtoC  25.39 
 
 		 715 aa  137  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.431904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0529  diguanylate cyclase  25.57 
 
 		 614 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0651  diguanylate cyclase  25.27 
 
 		 627 aa  125  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.605256  hitchhiker  0.0000117316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.06 
 
 		 662 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3939  response regulator receiver domain-containing protein  26.41 
 
 		 588 aa  124  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.238688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  26.15 
 
 		 708 aa  123  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  27.11 
 
 		 724 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2797  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  27.48 
 
 		 707 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000203115  normal  0.0370017 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4796  sensor histidine kinase  22.78 
 
 		 668 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.73 
 
 		 663 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65090  hypothetical protein  23.64 
 
 		 673 aa  118  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.11 
 
 		 662 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00238573 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2871  response regulator  24.83 
 
 		 564 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3844  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.59 
 
 		 867 aa  116  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.34 
 
 		 662 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475165 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4944  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  23.44 
 
 		 782 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.947631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2954  diguanylate cyclase  22.66 
 
 		 612 aa  115  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0512853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2730  diguanylate cyclase  23.17 
 
 		 638 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.814579  normal  0.595433 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.36 
 
 		 644 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00181069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4339  sensor histidine kinase  21.82 
 
 		 677 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.691571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1456  diguanylate cyclase  24.37 
 
 		 636 aa  111  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5656  GGDEF domain-containing protein  23.67 
 
 		 629 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.53 
 
 		 749 aa  109  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0141753  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  22.86 
 
 		 611 aa  109  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  23.33 
 
 		 795 aa  107  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1906  response regulator receiver domain-containing protein  22.08 
 
 		 603 aa  105  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  23.32 
 
 		 802 aa  105  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  22.68 
 
 		 565 aa  103  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2799  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  25.93 
 
 		 716 aa  103  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000869  normal  0.160664 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0469  diguanylate cyclase  23.27 
 
 		 601 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2109  diguanylate cyclase  24.21 
 
 		 630 aa  102  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.843932  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4218  diguanylate cyclase  24.81 
 
 		 631 aa  100  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6490  ATP-binding region ATPase domain protein  22.62 
 
 		 636 aa  98.6  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3589  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  21.41 
 
 		 853 aa  97.1  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2800  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  26.78 
 
 		 696 aa  95.9  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120614  normal  0.163305 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  25.46 
 
 		 730 aa  93.2  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05790  transmembrane signal transduction protein  20.74 
 
 		 634 aa  90.1  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1062  diguanylate cyclase  34.1 
 
 		 566 aa  89.4  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0191664  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0467  diguanylate cyclase  25 
 
 		 641 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0992  two-component sensor histidine kinase  24.27 
 
 		 696 aa  79  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0439814  normal  0.153335 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6429  response regulator receiver protein  23.27 
 
 		 553 aa  78.2  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0223  sensor histidine kinase  23.87 
 
 		 655 aa  76.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.142406  normal  0.0289163 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1782  diguanylate cyclase  24.45 
 
 		 629 aa  76.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2693  diguanylate cyclase  26.62 
 
 		 570 aa  73.6  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0845  diguanylate cyclase  23.02 
 
 		 578 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.36 
 
 		 686 aa  71.2  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000161382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00565  Signaling protein with a acyltransferase and GGDEF domains  24.17 
 
 		 628 aa  69.3  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1562  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  20.77 
 
 		 680 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.327156  normal  0.581936 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0453  GGDEF domain-containing protein  23.81 
 
 		 641 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0519  diguanylate cyclase  23.22 
 
 		 631 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.447681 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1596  Diverse 7TM receptor transmembrane region  21.62 
 
 		 660 aa  67.4  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3210  GGDEF domain-containing protein  25.53 
 
 		 624 aa  66.6  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  22.34 
 
 		 918 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  23.33 
 
 		 918 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4607  histidine kinase  21.81 
 
 		 696 aa  64.7  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.998833  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3381  diguanylate cyclase  21.85 
 
 		 622 aa  64.3  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0675  aerobic respiration sensor-response protein; histidine protein kinase  21.04 
 
 		 646 aa  64.3  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.779748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3800  diguanylate cyclase  22.33 
 
 		 621 aa  64.3  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  19.95 
 
 		 914 aa  62.4  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1171  intracellular signalling protein  22.88 
 
 		 690 aa  63.2  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1007  signal transduction histidine kinase, LytS  21.12 
 
 		 684 aa  61.2  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3230  hypothetical protein  27.08 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1061  diguanylate cyclase  23.27 
 
 		 632 aa  60.1  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.656983 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1637  sensor histidine kinase  20.86 
 
 		 656 aa  60.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0556277  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1543  hypothetical protein  27.08 
 
 		 359 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3177  hypothetical protein  27.08 
 
 		 366 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0357941  normal  0.042708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3779  hypothetical protein  27.08 
 
 		 334 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5775  hypothetical protein  27.08 
 
 		 334 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230783 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0100  multi-sensor hybrid histidine kinase  23 
 
 		 1182 aa  60.1  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0378  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.02 
 
 		 686 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3414  diverse 7TM receptor, extracellular region 2  19.06 
 
 		 560 aa  59.7  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5545  hypothetical protein  27.08 
 
 		 334 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.040244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5066  hypothetical protein  27.08 
 
 		 334 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1301  diguanylate cyclase  23.68 
 
 		 561 aa  58.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0507  multi-sensor hybrid histidine kinase  19.52 
 
 		 1045 aa  57.4  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0069  hypothetical protein  23.85 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2509  hypothetical protein  23.85 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000139438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3178  hypothetical protein  23.85 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2134  hypothetical protein  24.81 
 
 		 319 aa  57  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2507  hypothetical protein  30.86 
 
 		 333 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05468  hypothetical protein  23.81 
 
 		 367 aa  56.6  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  20.26 
 
 		 914 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2666  hypothetical protein  24.81 
 
 		 319 aa  57  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0915  hypothetical protein  24.81 
 
 		 319 aa  57  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4104  diguanylate cyclase  23.67 
 
 		 610 aa  57  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.147884 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2920  sensor diguanylate cyclase  22.32 
 
 		 623 aa  56.2  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4207  GGDEF domain-containing protein  23.12 
 
 		 625 aa  55.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1876  histidine kinase  22.14 
 
 		 979 aa  56.2  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0246829  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0498  diguanylate cyclase  22.81 
 
 		 624 aa  55.8  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0397  diguanylate cyclase  22.97 
 
 		 625 aa  55.1  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>