More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1682 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
749 aa  1532    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0141753  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.71 
 
 
573 aa  257  4e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.49 
 
 
560 aa  253  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0163835  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1148  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  39.42 
 
 
650 aa  250  7e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.605213  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0026  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.16 
 
 
686 aa  249  9e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1511  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  44.48 
 
 
574 aa  243  9e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0260271  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2646  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.86 
 
 
625 aa  243  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1510  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  42.6 
 
 
574 aa  240  6.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00534894  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.19 
 
 
554 aa  235  3e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000234986  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0648  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.79 
 
 
425 aa  232  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000628943  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  40.53 
 
 
668 aa  229  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.481177  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.45 
 
 
687 aa  226  9e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.22 
 
 
802 aa  221  6e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.31 
 
 
558 aa  217  5e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  32.53 
 
 
795 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4944  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.59 
 
 
782 aa  213  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.947631  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.87 
 
 
739 aa  206  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000403913  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 
663 aa  204  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 
662 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.475165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 
662 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00238573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 
662 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203793  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2871  response regulator  31.47 
 
 
564 aa  189  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4796  sensor histidine kinase  30.42 
 
 
668 aa  185  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0205  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.18 
 
 
647 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.85 
 
 
1150 aa  181  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4339  sensor histidine kinase  28.43 
 
 
677 aa  178  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.691571  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2109  diguanylate cyclase  28.95 
 
 
630 aa  177  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.843932  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2391  Diverse 7TM receptor transmembrane region  31.09 
 
 
726 aa  174  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1909  chemotaxis sensory transducer  42.73 
 
 
965 aa  172  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1906  response regulator receiver domain-containing protein  30.56 
 
 
603 aa  169  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1141  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.7 
 
 
681 aa  169  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.766428  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.39 
 
 
567 aa  169  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.65 
 
 
731 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.63 
 
 
904 aa  167  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.4 
 
 
561 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.48 
 
 
730 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0529  diguanylate cyclase  28.03 
 
 
614 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3844  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.08 
 
 
867 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4791  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.48 
 
 
434 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.67 
 
 
563 aa  164  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.67 
 
 
670 aa  164  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.51 
 
 
741 aa  164  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.6 
 
 
562 aa  163  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.46 
 
 
675 aa  163  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.4 
 
 
572 aa  163  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.2 
 
 
566 aa  163  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.4 
 
 
560 aa  162  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196109  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2984  chemotaxis sensory transducer  36.64 
 
 
545 aa  162  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  40.73 
 
 
565 aa  162  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.21 
 
 
667 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.527831 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1456  diguanylate cyclase  27.03 
 
 
636 aa  162  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.4 
 
 
689 aa  161  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  42 
 
 
563 aa  161  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  41.06 
 
 
688 aa  161  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.34 
 
 
573 aa  160  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.66 
 
 
730 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.87 
 
 
563 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5110  hypothetical protein  44 
 
 
688 aa  160  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.791751 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.4 
 
 
688 aa  160  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3939  response regulator receiver domain-containing protein  26.05 
 
 
588 aa  160  7e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.238688  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  40.4 
 
 
688 aa  160  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.2 
 
 
672 aa  160  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.94 
 
 
688 aa  160  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  39.18 
 
 
691 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.63 
 
 
673 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.84 
 
 
563 aa  160  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3602  chemotaxis sensory transducer  38.01 
 
 
518 aa  160  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.94 
 
 
566 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.26 
 
 
561 aa  159  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.34 
 
 
716 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.34 
 
 
674 aa  159  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.06 
 
 
568 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.55655  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.83 
 
 
563 aa  158  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  37.88 
 
 
552 aa  158  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.18 
 
 
691 aa  158  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  34.18 
 
 
565 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0840  chemotaxis sensory transducer  40.49 
 
 
712 aa  158  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  37.74 
 
 
674 aa  157  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36630  methyl-accepting chemotaxis protein  35.74 
 
 
540 aa  157  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  42.92 
 
 
691 aa  157  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.33 
 
 
711 aa  157  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.32 
 
 
567 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.34 
 
 
718 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0242034  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.14 
 
 
655 aa  156  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.12 
 
 
656 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.29 
 
 
563 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.29 
 
 
561 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.58 
 
 
563 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  43.58 
 
 
561 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.5 
 
 
560 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.4 
 
 
563 aa  155  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.6 
 
 
586 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.783692  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.63 
 
 
702 aa  154  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105528  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.69 
 
 
587 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.7 
 
 
561 aa  154  7e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0644  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  44.7 
 
 
565 aa  154  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1313  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.56 
 
 
434 aa  154  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.204182 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0359  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.01 
 
 
542 aa  153  8.999999999999999e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  41.83 
 
 
656 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0336  chemotaxis sensory transducer  47.14 
 
 
563 aa  153  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>