182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5836 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5836  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  682    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2430  hypothetical protein  81.19 
 
 		 333 aa  541  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.762343 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2804  hypothetical protein  81.19 
 
 		 333 aa  542  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.323871 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4157  hypothetical protein  81.19 
 
 		 333 aa  541  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1964  hypothetical protein  81.19 
 
 		 333 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3136  hypothetical protein  79.1 
 
 		 323 aa  527  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.491071  normal  0.0566917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3166  hypothetical protein  78.34 
 
 		 345 aa  529  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0819  ISSod11, transposase  55.02 
 
 		 318 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1282  ISSod11, transposase  55.02 
 
 		 318 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1394  ISSod11, transposase  55.02 
 
 		 318 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1436  ISSod11, transposase  55.02 
 
 		 318 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1456  ISSod11, transposase  55.02 
 
 		 318 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1950  ISSod11, transposase  55.02 
 
 		 318 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2187  ISSod11, transposase  55.02 
 
 		 318 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2210  ISSod11, transposase  55.02 
 
 		 318 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2819  ISSod11, transposase  55.02 
 
 		 318 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3321  ISSod11, transposase  55.02 
 
 		 318 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2284  ISSod11, transposase  55.52 
 
 		 306 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4436  ISSod11, transposase  55.52 
 
 		 306 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1543  hypothetical protein  47.84 
 
 		 359 aa  297  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3177  hypothetical protein  47.84 
 
 		 366 aa  297  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0357941  normal  0.042708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3230  hypothetical protein  47.84 
 
 		 356 aa  297  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3779  hypothetical protein  47.66 
 
 		 334 aa  293  3e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5775  hypothetical protein  47.66 
 
 		 334 aa  293  3e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230783 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5545  hypothetical protein  47 
 
 		 334 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.040244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2507  hypothetical protein  47.35 
 
 		 333 aa  287  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5066  hypothetical protein  47 
 
 		 334 aa  286  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1956  hypothetical protein  46.98 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3333  hypothetical protein  39.86 
 
 		 338 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.664615  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3539  hypothetical protein  39.86 
 
 		 338 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0781  hypothetical protein  39.86 
 
 		 338 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2206  hypothetical protein  39.86 
 
 		 338 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48827  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3308  putative transposase  39.92 
 
 		 238 aa  163  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1505  ISSod11, transposase  45.03 
 
 		 193 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000861665  hitchhiker  0.00324548 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0069  hypothetical protein  36.15 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2509  hypothetical protein  36.15 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000139438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3178  hypothetical protein  36.15 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03600  ISXo2 putative transposase  33.57 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03894  ISXo2 putative transposase  33.33 
 
 		 418 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01494  ISXo2 putative transposase  33.21 
 
 		 333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04109  ISXo2 putative transposase  33.57 
 
 		 320 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.933255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05468  hypothetical protein  33.57 
 
 		 367 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04440  ISXo2 putative transposase  33.57 
 
 		 333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03653  ISXo2 putative transposase  33.21 
 
 		 360 aa  146  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00952  ISXo2 putative transposase  33.21 
 
 		 333 aa  146  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170926  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06214  ISXo2 putative transposase  33.21 
 
 		 333 aa  146  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00277  ISXo2 putative transposase  33.21 
 
 		 484 aa  146  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03442  ISXo2 putative transposase  33.21 
 
 		 362 aa  145  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01966  ISXo2 putative transposase  33.21 
 
 		 353 aa  145  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000253564  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1109  hypothetical protein  35.82 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03202  ISXo2 putative transposase  32.85 
 
 		 350 aa  142  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03119  ISXo5 transposase  32.15 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01861  ISXo5 transposase  32.15 
 
 		 338 aa  140  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.485604  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01857  ISXo5 transposase  33.81 
 
 		 338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02578  ISXo5 transposase  32.15 
 
 		 338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05836  ISXo5 transposase  33.81 
 
 		 338 aa  139  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.979452  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06092  ISXo5 transposase  33.81 
 
 		 338 aa  139  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01725  ISXo5 transposase  32.15 
 
 		 338 aa  139  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00484  ISXo5 transposase  32.15 
 
 		 338 aa  139  7e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.741552  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00331  ISXo5 transposase  33.45 
 
 		 338 aa  139  8.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02971  ISXo5 transposase  33.45 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03976  ISXo5 transposase  31.83 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.84431  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02455  ISXo5 transposase  33.45 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04595  ISXo5 transposase  31.83 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03560  ISXo5 transposase  31.83 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.81013  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06219  ISXo5 transposase  33.45 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0124141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03780  ISXo5 transposase  31.83 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03214  ISXo5 transposase  31.83 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03695  ISXo5 transposase  31.83 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03664  ISXo5 transposase  33.45 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04081  ISXo5 transposase  31.83 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00429  ISXo5 transposase  33.45 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.901373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00947  ISXo5 transposase  33.45 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000842303  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01069  ISXo5 transposase  31.83 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.168183  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01807  ISXo5 transposase  31.83 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.156782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01918  ISXo5 transposase  33.45 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.684506  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02591  ISXo5 transposase  33.45 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.317416  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06250  ISXo5 transposase  31.83 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00625171  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04224  ISXo5 transposase  33.45 
 
 		 338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0733056  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03012  ISXo5 transposase  31.83 
 
 		 338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03315  ISXo5 transposase  32.05 
 
 		 338 aa  136  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06059  ISXo5 transposase  31.19 
 
 		 338 aa  136  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000704128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03367  ISXo5 transposase  31.83 
 
 		 338 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00040  ISXo5 transposase  31.51 
 
 		 338 aa  136  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.765513  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00868  ISXo5 transposase  32.66 
 
 		 338 aa  136  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.16246  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04330  ISXo5 transposase  33.45 
 
 		 338 aa  136  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000810616  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03353  ISXo5 transposase  33.1 
 
 		 338 aa  135  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02593  ISXo5 transposase  32.76 
 
 		 338 aa  135  8e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03597  ISXo5 transposase  33.1 
 
 		 338 aa  135  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03228  ISXo5 transposase  33.45 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03338  ISXo5 transposase  31.5 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00592  ISXo5 transposase  33.1 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820948  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02306  ISXo5 transposase  32.05 
 
 		 338 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02827  ISXo5 transposase  33.1 
 
 		 338 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02486  ISXo5 transposase  31.51 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02993  ISXo5 transposase  33.1 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528498  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04634  ISXo5 transposase  33.1 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06032  ISXo5 transposase  31.51 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.978605  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02023  ISXo5 transposase  33.1 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.273323  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04014  ISXo5 transposase  33.1 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>