175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1505 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_1505  ISSod11, transposase  100 
 
 
193 aa  398  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000861665  hitchhiker  0.00324548 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0819  ISSod11, transposase  44.63 
 
 
318 aa  169  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1282  ISSod11, transposase  44.63 
 
 
318 aa  169  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1394  ISSod11, transposase  44.63 
 
 
318 aa  169  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1436  ISSod11, transposase  44.63 
 
 
318 aa  169  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1456  ISSod11, transposase  44.63 
 
 
318 aa  169  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1950  ISSod11, transposase  44.63 
 
 
318 aa  169  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2187  ISSod11, transposase  44.63 
 
 
318 aa  169  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2210  ISSod11, transposase  44.63 
 
 
318 aa  169  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2819  ISSod11, transposase  44.63 
 
 
318 aa  169  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3321  ISSod11, transposase  44.63 
 
 
318 aa  169  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2284  ISSod11, transposase  44.63 
 
 
306 aa  169  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4436  ISSod11, transposase  44.63 
 
 
306 aa  169  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3166  hypothetical protein  48.59 
 
 
345 aa  167  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3136  hypothetical protein  48.59 
 
 
323 aa  167  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.491071  normal  0.0566917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1543  hypothetical protein  47.22 
 
 
359 aa  161  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.165042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3230  hypothetical protein  47.22 
 
 
356 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3177  hypothetical protein  47.22 
 
 
366 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0357941  normal  0.042708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3779  hypothetical protein  47.22 
 
 
334 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5775  hypothetical protein  47.22 
 
 
334 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0230783 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5545  hypothetical protein  46.67 
 
 
334 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.040244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5066  hypothetical protein  46.67 
 
 
334 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2507  hypothetical protein  46.67 
 
 
333 aa  155  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5836  hypothetical protein  45.03 
 
 
329 aa  147  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1964  hypothetical protein  48.75 
 
 
333 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2430  hypothetical protein  48.75 
 
 
333 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.762343 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2804  hypothetical protein  48.75 
 
 
333 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.323871 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4157  hypothetical protein  48.75 
 
 
333 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0069  hypothetical protein  38.18 
 
 
318 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2509  hypothetical protein  38.18 
 
 
318 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000139438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3178  hypothetical protein  38.18 
 
 
318 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1109  hypothetical protein  40.28 
 
 
341 aa  102  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2666  hypothetical protein  39.6 
 
 
319 aa  99.4  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0915  hypothetical protein  39.6 
 
 
319 aa  99.4  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2134  hypothetical protein  39.6 
 
 
319 aa  99.4  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3333  hypothetical protein  38.02 
 
 
338 aa  97.1  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.664615  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3539  hypothetical protein  38.02 
 
 
338 aa  97.1  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0781  hypothetical protein  38.02 
 
 
338 aa  97.1  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2206  hypothetical protein  38.02 
 
 
338 aa  97.1  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48827  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1156  ISSpo8, transposase  30.48 
 
 
312 aa  92.4  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0302963  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00484  ISXo5 transposase  37.84 
 
 
338 aa  91.3  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.741552  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01857  ISXo5 transposase  37.84 
 
 
338 aa  91.3  9e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03442  ISXo2 putative transposase  37.14 
 
 
362 aa  90.9  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03653  ISXo2 putative transposase  37.14 
 
 
360 aa  90.5  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03202  ISXo2 putative transposase  36.49 
 
 
350 aa  90.5  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03600  ISXo2 putative transposase  36.49 
 
 
333 aa  90.5  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01966  ISXo2 putative transposase  37.14 
 
 
353 aa  90.5  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000253564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06214  ISXo2 putative transposase  36.49 
 
 
333 aa  90.1  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03560  ISXo5 transposase  37.16 
 
 
341 aa  89.7  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.81013  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00277  ISXo2 putative transposase  37.14 
 
 
484 aa  90.1  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00952  ISXo2 putative transposase  36.49 
 
 
333 aa  90.1  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170926  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01827  putative transposase  36.49 
 
 
448 aa  90.1  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.586106  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02759  ISXo5 transposase  37.16 
 
 
338 aa  89.7  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.890391  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01473  ISXo5 transposase  37.16 
 
 
338 aa  89.7  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01494  ISXo2 putative transposase  37.14 
 
 
333 aa  89.4  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01617  ISXo2 putative transposase  36.49 
 
 
380 aa  89.7  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.6149  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03894  ISXo2 putative transposase  36.43 
 
 
418 aa  89  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01725  ISXo5 transposase  37.16 
 
 
338 aa  89  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05468  hypothetical protein  36.43 
 
 
367 aa  89  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04440  ISXo2 putative transposase  35.81 
 
 
333 aa  89  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06219  ISXo5 transposase  37.16 
 
 
338 aa  88.6  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0124141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03664  ISXo5 transposase  37.16 
 
 
338 aa  88.6  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00429  ISXo5 transposase  37.16 
 
 
338 aa  88.6  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.901373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00947  ISXo5 transposase  37.16 
 
 
338 aa  88.6  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000842303  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02567  transposase  37.16 
 
 
277 aa  88.6  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02578  ISXo5 transposase  37.01 
 
 
338 aa  88.6  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02591  ISXo5 transposase  37.16 
 
 
338 aa  88.6  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.317416  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03976  ISXo5 transposase  37.16 
 
 
338 aa  88.6  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.84431  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06250  ISXo5 transposase  37.16 
 
 
338 aa  88.6  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00625171  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05836  ISXo5 transposase  37.16 
 
 
338 aa  88.6  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.979452  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04330  ISXo5 transposase  37.16 
 
 
338 aa  88.6  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000810616  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03780  ISXo5 transposase  37.16 
 
 
338 aa  88.6  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03228  ISXo5 transposase  37.16 
 
 
338 aa  88.2  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04081  ISXo5 transposase  37.16 
 
 
338 aa  88.6  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02993  ISXo5 transposase  37.16 
 
 
338 aa  88.2  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528498  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04634  ISXo5 transposase  37.16 
 
 
338 aa  88.6  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03214  ISXo5 transposase  37.16 
 
 
338 aa  88.6  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01069  ISXo5 transposase  37.16 
 
 
338 aa  88.6  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.168183  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01807  ISXo5 transposase  37.16 
 
 
338 aa  88.6  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.156782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03695  ISXo5 transposase  37.16 
 
 
338 aa  88.6  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01861  ISXo5 transposase  37.01 
 
 
338 aa  88.2  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.485604  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06092  ISXo5 transposase  37.16 
 
 
338 aa  88.6  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06032  ISXo5 transposase  37.16 
 
 
338 aa  88.2  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.978605  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03338  ISXo5 transposase  37.16 
 
 
338 aa  88.2  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02455  ISXo5 transposase  37.16 
 
 
338 aa  88.6  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04595  ISXo5 transposase  37.16 
 
 
338 aa  88.6  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02971  ISXo5 transposase  37.16 
 
 
338 aa  88.2  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03315  ISXo5 transposase  36.49 
 
 
338 aa  88.2  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04109  ISXo2 putative transposase  35.81 
 
 
320 aa  88.2  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.933255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03012  ISXo5 transposase  36.49 
 
 
338 aa  88.2  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01491  transposase  37.16 
 
 
277 aa  88.2  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01870  ISXo5 transposase  36.49 
 
 
338 aa  88.2  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01918  ISXo5 transposase  37.16 
 
 
338 aa  88.2  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.684506  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02593  ISXo5 transposase  37.16 
 
 
338 aa  88.2  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02617  ISXo5 transposase  37.16 
 
 
338 aa  88.2  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00331  ISXo5 transposase  37.16 
 
 
338 aa  87.8  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02306  ISXo5 transposase  37.01 
 
 
338 aa  87.8  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00592  ISXo5 transposase  36.49 
 
 
338 aa  87.8  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820948  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00040  ISXo5 transposase  36.49 
 
 
338 aa  87  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.765513  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02827  ISXo5 transposase  37.16 
 
 
338 aa  87.4  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>