135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3308 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3308  putative transposase  100 
 
 		 238 aa  489  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3136  hypothetical protein  40.85 
 
 		 323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.491071  normal  0.0566917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3166  hypothetical protein  40.85 
 
 		 345 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3333  hypothetical protein  39.06 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.664615  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3539  hypothetical protein  39.06 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0781  hypothetical protein  39.06 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2206  hypothetical protein  39.06 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48827  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5836  hypothetical protein  38.78 
 
 		 329 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2804  hypothetical protein  39.75 
 
 		 333 aa  148  9e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.323871 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1964  hypothetical protein  39.75 
 
 		 333 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2430  hypothetical protein  39.75 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.762343 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4157  hypothetical protein  39.75 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0819  ISSod11, transposase  37.71 
 
 		 318 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1282  ISSod11, transposase  37.71 
 
 		 318 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1394  ISSod11, transposase  37.71 
 
 		 318 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1436  ISSod11, transposase  37.71 
 
 		 318 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1456  ISSod11, transposase  37.71 
 
 		 318 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1950  ISSod11, transposase  37.71 
 
 		 318 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2187  ISSod11, transposase  37.71 
 
 		 318 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2210  ISSod11, transposase  37.71 
 
 		 318 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2819  ISSod11, transposase  37.71 
 
 		 318 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3321  ISSod11, transposase  37.71 
 
 		 318 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5545  hypothetical protein  39.55 
 
 		 334 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.040244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5066  hypothetical protein  39.55 
 
 		 334 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2284  ISSod11, transposase  39.34 
 
 		 306 aa  138  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4436  ISSod11, transposase  39.34 
 
 		 306 aa  138  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1543  hypothetical protein  39.55 
 
 		 359 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3177  hypothetical protein  39.55 
 
 		 366 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0357941  normal  0.042708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3230  hypothetical protein  39.55 
 
 		 356 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3779  hypothetical protein  39.55 
 
 		 334 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5775  hypothetical protein  39.55 
 
 		 334 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2507  hypothetical protein  39.09 
 
 		 333 aa  132  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1956  hypothetical protein  39.71 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1109  hypothetical protein  31.63 
 
 		 341 aa  96.7  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0069  hypothetical protein  31.63 
 
 		 318 aa  96.3  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2509  hypothetical protein  31.63 
 
 		 318 aa  96.3  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000139438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3178  hypothetical protein  31.63 
 
 		 318 aa  96.3  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0919  hypothetical protein  30.36 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.299986  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2077  hypothetical protein  34.12 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0131  ISSpo8, transposase  34.1 
 
 		 313 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0235265 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01870  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 338 aa  87  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0915  hypothetical protein  29.44 
 
 		 319 aa  86.7  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2134  hypothetical protein  29.44 
 
 		 319 aa  86.7  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2666  hypothetical protein  29.44 
 
 		 319 aa  86.7  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00331  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 338 aa  86.3  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01725  ISXo5 transposase  32.08 
 
 		 338 aa  85.9  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03315  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 338 aa  85.9  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1505  ISSod11, transposase  40.94 
 
 		 193 aa  85.5  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000861665  hitchhiker  0.00324548 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02971  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 338 aa  85.5  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03012  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 338 aa  85.9  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04330  ISXo5 transposase  32.24 
 
 		 338 aa  85.5  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000810616  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03976  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 338 aa  85.1  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.84431  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00592  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 338 aa  85.1  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820948  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04224  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 338 aa  85.1  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0733056  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01861  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 338 aa  85.1  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.485604  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05707  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 245 aa  85.1  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.874649  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02455  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 338 aa  85.1  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03560  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 341 aa  85.5  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.81013  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02593  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 338 aa  85.1  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02617  ISXo5 transposase  32.24 
 
 		 338 aa  85.1  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05836  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.979452  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03695  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00429  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.901373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00484  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.741552  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00947  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000842303  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06092  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01069  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.168183  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04595  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03780  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01807  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.156782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01857  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04081  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01918  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.684506  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02578  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02591  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.317416  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03664  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03119  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06250  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00625171  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03214  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03367  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06219  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0124141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00040  ISXo5 transposase  31.13 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.765513  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03353  ISXo5 transposase  31.13 
 
 		 338 aa  82.8  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03597  ISXo5 transposase  31.13 
 
 		 338 aa  82.8  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03228  ISXo5 transposase  31.6 
 
 		 338 aa  82.4  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02827  ISXo5 transposase  31.13 
 
 		 338 aa  82.4  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03974  ISXo5 transposase  31.13 
 
 		 338 aa  81.6  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02306  ISXo5 transposase  31.13 
 
 		 338 aa  81.6  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3478  ISSpo8, transposase  29.82 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04014  ISXo5 transposase  31.13 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01473  ISXo5 transposase  31.13 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04634  ISXo5 transposase  31.13 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02023  ISXo5 transposase  31.31 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.273323  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02759  ISXo5 transposase  31.13 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.890391  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02993  ISXo5 transposase  31.13 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528498  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03338  ISXo5 transposase  31.13 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06032  ISXo5 transposase  31.13 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.978605  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02702  ISXo5 transposase  31.13 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.222301  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06059  ISXo5 transposase  30.19 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000704128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00868  ISXo5 transposase  30.19 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.16246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>