More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4156 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4156  integrase family protein  100 
 
 		 354 aa  712    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7007  integrase family protein  75.81 
 
 		 360 aa  487  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.436087 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3024  putative phage integrase  77.17 
 
 		 360 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0002  phage integrase family protein  68.99 
 
 		 347 aa  431  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0002  phage integrase family protein  69.38 
 
 		 347 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1507  phage integrase family protein  69.38 
 
 		 347 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0506287  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0002  phage integrase family site specific recombinase  69.38 
 
 		 347 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0002  integrase  69.38 
 
 		 347 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.66685  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0003  phage integrase family site specific recombinase  69.06 
 
 		 347 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1148  phage integrase family protein  69.38 
 
 		 347 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0330275  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1428  phage integrase family protein  69.06 
 
 		 347 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310189  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0001  Phage integrase  64.52 
 
 		 339 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4539  integrase family protein  63.55 
 
 		 339 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3112  integrase family protein  64.52 
 
 		 337 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.295128 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5161  phage integrase  63.96 
 
 		 339 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4969  phage integrase family protein  64.19 
 
 		 337 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.188705  normal  0.373928 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5698  phage integrase family protein  63.96 
 
 		 339 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  hitchhiker  0.00119848 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3158  integrase family protein  64.61 
 
 		 337 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5594  integrase/recombinase protein  38.49 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727948  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4234  integrase family protein  36.66 
 
 		 326 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4344  integrase/recombinase protein  36.66 
 
 		 326 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.509087 
 
 
-
 
NC_003296  RS02608  integrase/recombinase protein  35.65 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  0.0976015 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6006  tyr recombinase activity site-specific recombination  30.75 
 
 		 391 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3675  phage integrase / Tyr recombinase protein  35.31 
 
 		 358 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4939  phage integrase family protein  33.22 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.267668  normal  0.379493 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6298  integrase family protein  31.75 
 
 		 340 aa  99.4  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5993  Phage integrase  28.05 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0405  hypothetical protein  26.39 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000315128  hitchhiker  0.0000725469 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5154  integrase family protein  25.67 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.471019 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7390  integrase family protein  26.23 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.335502 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1729  integrase family protein  25.67 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.873688  normal  0.924027 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  24.92 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6690  integrase family protein  28.48 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.254504 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5847  phage integrase  28.38 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.687418  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6214  phage integrase family protein  28.38 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.419719  hitchhiker  0.00629138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5937  phage integrase family protein  31.46 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  29.79 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6618  Phage integrase  27.21 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.821698 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  27.3 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  30.58 
 
 		 373 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5041  hypothetical protein  24.09 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.283113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  23.87 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  23.29 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4618  integrase family protein  28.67 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4462  integrase family protein  28.67 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  28.76 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5334  integrase family protein  27.96 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.70643  normal  0.0475719 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  27.46 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  27.46 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  27.46 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.03 
 
 		 324 aa  55.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4306  integrase/recombinase XerC  26.76 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3971  tyrosine recombinase XerC  27.78 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  25 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  29.5 
 
 		 289 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6779  integrase family protein  25.33 
 
 		 309 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  24.43 
 
 		 311 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3894  tyrosine recombinase XerC  27.78 
 
 		 306 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533729 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  24.67 
 
 		 297 aa  54.3  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3993  tyrosine recombinase XerC  27.78 
 
 		 306 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4087  tyrosine recombinase XerC  27.78 
 
 		 306 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0169707 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0421  integrase family protein  30.61 
 
 		 329 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  27.33 
 
 		 291 aa  53.1  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1273  phage integrase  28.28 
 
 		 331 aa  53.1  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010146 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0163  integrase family protein  28.72 
 
 		 342 aa  53.1  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  26.57 
 
 		 297 aa  53.1  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.25 
 
 		 311 aa  52.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3407  integrase family protein  26.32 
 
 		 325 aa  52.8  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  29.08 
 
 		 290 aa  52.8  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  29.08 
 
 		 290 aa  52.8  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1241  phage integrase  31.85 
 
 		 336 aa  52.8  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  26.35 
 
 		 311 aa  52.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1163  phage integrase family protein  31.76 
 
 		 472 aa  52.8  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.562087  normal  0.524123 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  26.39 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  23.51 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.59 
 
 		 351 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  24.91 
 
 		 313 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_004310  BR1916  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.59 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.391518  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1844  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.59 
 
 		 315 aa  51.2  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.104424  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0370  integrase family protein  28.97 
 
 		 332 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  22.76 
 
 		 284 aa  51.2  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00956  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.18 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  25.17 
 
 		 299 aa  50.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7575  tyrosine recombinase XerD subunit  22.26 
 
 		 308 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3580  tyrosine recombinase XerC  27.08 
 
 		 302 aa  50.4  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  26.53 
 
 		 296 aa  50.8  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.85 
 
 		 302 aa  50.8  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  22.15 
 
 		 295 aa  50.4  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  27.03 
 
 		 311 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  22.99 
 
 		 298 aa  50.1  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0222  phage integrase family protein  28.1 
 
 		 308 aa  50.4  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  23.29 
 
 		 302 aa  50.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  23.49 
 
 		 304 aa  50.1  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2008  integrase family protein  29.73 
 
 		 330 aa  49.7  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0380  tyrosine recombinase XerC  23.78 
 
 		 304 aa  49.7  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5348  integrase family protein  29.73 
 
 		 330 aa  49.7  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.44 
 
 		 329 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2228  integrase family protein  29.73 
 
 		 330 aa  49.7  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.763924 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0131  integrase family protein  25.85 
 
 		 312 aa  49.7  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.144823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>