34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6006 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_6006  tyr recombinase activity site-specific recombination  100 
 
 		 391 aa  804    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7007  integrase family protein  32.38 
 
 		 360 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.436087 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4156  integrase family protein  30.75 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3024  putative phage integrase  32.38 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3112  integrase family protein  31.17 
 
 		 337 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.295128 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0002  phage integrase family protein  30.37 
 
 		 347 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4969  phage integrase family protein  31.17 
 
 		 337 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.188705  normal  0.373928 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4539  integrase family protein  29.43 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5161  phage integrase  29.43 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5698  phage integrase family protein  29.43 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  hitchhiker  0.00119848 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1507  phage integrase family protein  30.18 
 
 		 347 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0506287  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0002  phage integrase family protein  30.18 
 
 		 347 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0003  phage integrase family site specific recombinase  30.18 
 
 		 347 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0002  integrase  30.18 
 
 		 347 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.66685  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1428  phage integrase family protein  30.18 
 
 		 347 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310189  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1148  phage integrase family protein  30.18 
 
 		 347 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0330275  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0001  Phage integrase  30.03 
 
 		 339 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0002  phage integrase family site specific recombinase  30.18 
 
 		 347 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3158  integrase family protein  28.91 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5594  integrase/recombinase protein  27.32 
 
 		 341 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727948  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02608  integrase/recombinase protein  27.27 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  0.0976015 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3675  phage integrase / Tyr recombinase protein  26.33 
 
 		 358 aa  89.7  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4344  integrase/recombinase protein  26.67 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.509087 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4234  integrase family protein  26.67 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5993  Phage integrase  24.26 
 
 		 342 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4939  phage integrase family protein  26.48 
 
 		 305 aa  55.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.267668  normal  0.379493 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5847  phage integrase  27.62 
 
 		 311 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.687418  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6214  phage integrase family protein  27.62 
 
 		 311 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.419719  hitchhiker  0.00629138 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5041  hypothetical protein  24.1 
 
 		 328 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.283113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6690  integrase family protein  27.62 
 
 		 333 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.254504 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6618  Phage integrase  28.8 
 
 		 312 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.821698 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1729  integrase family protein  23.32 
 
 		 297 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.873688  normal  0.924027 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5154  integrase family protein  23.32 
 
 		 297 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.471019 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7390  integrase family protein  25.11 
 
 		 313 aa  47  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.335502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>