81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3158 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3158  integrase family protein  100 
 
 		 337 aa  681    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4969  phage integrase family protein  88.43 
 
 		 337 aa  613  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.188705  normal  0.373928 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3112  integrase family protein  87.83 
 
 		 337 aa  610  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.295128 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0001  Phage integrase  86.73 
 
 		 339 aa  599  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4539  integrase family protein  84.5 
 
 		 339 aa  584  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5698  phage integrase family protein  84.8 
 
 		 339 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  hitchhiker  0.00119848 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5161  phage integrase  84.8 
 
 		 339 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1148  phage integrase family protein  76.3 
 
 		 347 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0330275  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0002  integrase  76.3 
 
 		 347 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.66685  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0002  phage integrase family site specific recombinase  76.3 
 
 		 347 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0002  phage integrase family protein  73.39 
 
 		 347 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0002  phage integrase family protein  76.3 
 
 		 347 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1428  phage integrase family protein  75.97 
 
 		 347 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310189  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1507  phage integrase family protein  76.3 
 
 		 347 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0506287  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0003  phage integrase family site specific recombinase  75.97 
 
 		 347 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4156  integrase family protein  64.61 
 
 		 354 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7007  integrase family protein  62.54 
 
 		 360 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.436087 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3024  putative phage integrase  62.85 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5594  integrase/recombinase protein  38.6 
 
 		 341 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727948  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3675  phage integrase / Tyr recombinase protein  37.12 
 
 		 358 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_003296  RS02608  integrase/recombinase protein  37.27 
 
 		 323 aa  169  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  0.0976015 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4344  integrase/recombinase protein  37.3 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.509087 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4234  integrase family protein  37.3 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6006  tyr recombinase activity site-specific recombination  28.91 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4939  phage integrase family protein  33.9 
 
 		 305 aa  112  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.267668  normal  0.379493 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6298  integrase family protein  29.19 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7390  integrase family protein  29.28 
 
 		 313 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.335502 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5993  Phage integrase  30.87 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5154  integrase family protein  24.41 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.471019 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1729  integrase family protein  24.41 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.873688  normal  0.924027 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6690  integrase family protein  30.29 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.254504 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6618  Phage integrase  28.76 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.821698 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6214  phage integrase family protein  29.56 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.419719  hitchhiker  0.00629138 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5847  phage integrase  29.56 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.687418  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0405  hypothetical protein  23.61 
 
 		 380 aa  62.8  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000315128  hitchhiker  0.0000725469 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5041  hypothetical protein  24.18 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.283113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4618  integrase family protein  28.67 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0012  Phage integrase  26.37 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4462  integrase family protein  27.33 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  26.81 
 
 		 301 aa  54.7  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5334  integrase family protein  28.2 
 
 		 313 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.70643  normal  0.0475719 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1273  phage integrase  26.44 
 
 		 331 aa  52.8  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010146 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6779  integrase family protein  25.17 
 
 		 309 aa  49.7  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4243  phage integrase  24.69 
 
 		 309 aa  49.3  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000426285 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  26.53 
 
 		 373 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  26.04 
 
 		 291 aa  46.6  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5937  phage integrase family protein  27.84 
 
 		 329 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  20.4 
 
 		 301 aa  46.2  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1914  integrase/recombinase  27.27 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00100079  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1730  integrase family protein  28.97 
 
 		 317 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3505  phage integrase family protein  27.15 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431904  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.46 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  27.27 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3012  tyrosine recombinase XerD subunit  28.57 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.26 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2347  phage integrase family protein  24.38 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.01871 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.61 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  22.26 
 
 		 298 aa  44.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  22.26 
 
 		 298 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.26 
 
 		 298 aa  44.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.61 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.61 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.26 
 
 		 298 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.61 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.61 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.26 
 
 		 298 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.26 
 
 		 298 aa  44.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.26 
 
 		 298 aa  44.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  24.63 
 
 		 298 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0261  site-specific tyrosine recombinase XerS  28.03 
 
 		 361 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  23.36 
 
 		 361 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5530  site-specific tyrosine recombinase XerS  25.5 
 
 		 357 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.267916  hitchhiker  0.00142122 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  25.36 
 
 		 299 aa  43.1  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.66 
 
 		 298 aa  43.1  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3558  phage integrase family protein  25.17 
 
 		 311 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5348  integrase family protein  26.7 
 
 		 330 aa  42.7  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464558 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  27.21 
 
 		 444 aa  42.7  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0768  integrase family protein  25.81 
 
 		 337 aa  42.7  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000101801 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2008  integrase family protein  26.7 
 
 		 330 aa  42.7  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2228  integrase family protein  26.7 
 
 		 330 aa  42.7  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.763924 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>