198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA0002 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0002  phage integrase family protein  100 
 
 		 347 aa  699    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1507  phage integrase family protein  99.42 
 
 		 347 aa  697    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0506287  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0002  phage integrase family protein  95.97 
 
 		 347 aa  667    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1148  phage integrase family protein  100 
 
 		 347 aa  699    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0330275  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1428  phage integrase family protein  99.71 
 
 		 347 aa  697    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310189  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0002  integrase  99.42 
 
 		 347 aa  696    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.66685  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0002  phage integrase family site specific recombinase  99.42 
 
 		 347 aa  696    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0003  phage integrase family site specific recombinase  99.71 
 
 		 347 aa  697    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0001  Phage integrase  72.57 
 
 		 339 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5161  phage integrase  72.67 
 
 		 339 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5698  phage integrase family protein  72.67 
 
 		 339 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  hitchhiker  0.00119848 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4539  integrase family protein  72.67 
 
 		 339 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4969  phage integrase family protein  73.25 
 
 		 337 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.188705  normal  0.373928 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3112  integrase family protein  73.56 
 
 		 337 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.295128 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3158  integrase family protein  76.38 
 
 		 337 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7007  integrase family protein  67.56 
 
 		 360 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.436087 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4156  integrase family protein  67.29 
 
 		 354 aa  431  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3024  putative phage integrase  67.26 
 
 		 360 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5594  integrase/recombinase protein  42.14 
 
 		 341 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727948  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3675  phage integrase / Tyr recombinase protein  37.54 
 
 		 358 aa  176  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4234  integrase family protein  38.78 
 
 		 326 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4344  integrase/recombinase protein  38.78 
 
 		 326 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.509087 
 
 
-
 
NC_003296  RS02608  integrase/recombinase protein  37.58 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  0.0976015 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6006  tyr recombinase activity site-specific recombination  30.1 
 
 		 391 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4939  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 305 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.267668  normal  0.379493 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5154  integrase family protein  26.76 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.471019 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6298  integrase family protein  29.38 
 
 		 340 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1729  integrase family protein  26.76 
 
 		 297 aa  92.8  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.873688  normal  0.924027 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7390  integrase family protein  26.73 
 
 		 313 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.335502 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5993  Phage integrase  32.75 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6690  integrase family protein  29.97 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.254504 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6618  Phage integrase  29.58 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.821698 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5847  phage integrase  28.76 
 
 		 311 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.687418  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6214  phage integrase family protein  28.76 
 
 		 311 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.419719  hitchhiker  0.00629138 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5334  integrase family protein  29.84 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.70643  normal  0.0475719 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0405  hypothetical protein  25 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000315128  hitchhiker  0.0000725469 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4618  integrase family protein  30.67 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4462  integrase family protein  30 
 
 		 311 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5041  hypothetical protein  24.77 
 
 		 328 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.283113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6779  integrase family protein  25.58 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0370  integrase family protein  29.58 
 
 		 332 aa  57  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5937  phage integrase family protein  28.25 
 
 		 329 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  25.15 
 
 		 301 aa  55.5  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  29.19 
 
 		 373 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.15 
 
 		 298 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1273  phage integrase  28.57 
 
 		 331 aa  53.9  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010146 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4243  phage integrase  28.87 
 
 		 309 aa  53.9  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000426285 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5348  integrase family protein  28.57 
 
 		 330 aa  53.5  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464558 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2228  integrase family protein  28.57 
 
 		 330 aa  53.5  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.763924 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  25.71 
 
 		 299 aa  53.5  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2008  integrase family protein  28.57 
 
 		 330 aa  53.5  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 293 aa  53.5  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.21 
 
 		 298 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  23.69 
 
 		 293 aa  52.8  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.25 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0012  Phage integrase  27.31 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0600  phage integrase family protein  30.11 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3580  tyrosine recombinase XerC  24.14 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.5 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  22.5 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.5 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.5 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0421  integrase family protein  27.27 
 
 		 329 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.86 
 
 		 298 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.5 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.86 
 
 		 298 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.86 
 
 		 298 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.86 
 
 		 298 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.5 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.5 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.4 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  22.5 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  24.66 
 
 		 298 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 302 aa  50.4  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5582  integrase family protein  28 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  27.38 
 
 		 298 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  26.95 
 
 		 290 aa  50.1  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  26.95 
 
 		 290 aa  50.1  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3505  phage integrase family protein  28 
 
 		 330 aa  49.7  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431904  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2413  integrase family protein  26.95 
 
 		 182 aa  49.7  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  24.64 
 
 		 299 aa  49.7  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  24.64 
 
 		 299 aa  49.7  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  24.64 
 
 		 299 aa  49.7  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5408  phage integrase family protein  29.14 
 
 		 330 aa  49.7  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.123433 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.52 
 
 		 299 aa  49.3  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.97 
 
 		 298 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  25.58 
 
 		 332 aa  49.3  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  27.33 
 
 		 295 aa  49.3  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.52 
 
 		 299 aa  49.3  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  24.48 
 
 		 302 aa  49.3  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.52 
 
 		 299 aa  49.3  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3221  integrase family protein  29.56 
 
 		 337 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  hitchhiker  0.000000474252 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3266  phage integrase family protein  27.7 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119927  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  22.68 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  23.66 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4591  integrase family protein  26.67 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000000427706  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  25.68 
 
 		 289 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  22.62 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2544  tyrosine recombinase XerC  23.57 
 
 		 318 aa  47.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774585  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.42 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>