70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6214 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6214  phage integrase family protein  100 
 
 		 311 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.419719  hitchhiker  0.00629138 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5847  phage integrase  100 
 
 		 311 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.687418  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6690  integrase family protein  96.46 
 
 		 333 aa  550  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.254504 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6618  Phage integrase  87.78 
 
 		 312 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.821698 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5334  integrase family protein  80.13 
 
 		 313 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.70643  normal  0.0475719 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6779  integrase family protein  51.86 
 
 		 309 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7390  integrase family protein  45.67 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.335502 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5993  Phage integrase  48.99 
 
 		 342 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5154  integrase family protein  43 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.471019 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1729  integrase family protein  43 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.873688  normal  0.924027 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5041  hypothetical protein  29.62 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.283113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0153  hypothetical protein  48.98 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0002  phage integrase family protein  29.08 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0002  integrase  28.76 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.66685  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0002  phage integrase family site specific recombinase  28.76 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1507  phage integrase family protein  28.76 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0506287  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1148  phage integrase family protein  28.76 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0330275  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0002  phage integrase family protein  28.76 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5594  integrase/recombinase protein  28.43 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727948  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1428  phage integrase family protein  28.76 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310189  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0003  phage integrase family site specific recombinase  28.76 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7007  integrase family protein  29.7 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.436087 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4156  integrase family protein  28.38 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3112  integrase family protein  29.56 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.295128 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4969  phage integrase family protein  29.2 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.188705  normal  0.373928 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5698  phage integrase family protein  28.42 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  hitchhiker  0.00119848 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5161  phage integrase  28.42 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4539  integrase family protein  28.42 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3158  integrase family protein  29.56 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0001  Phage integrase  29.54 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0405  hypothetical protein  26.44 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000315128  hitchhiker  0.0000725469 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3024  putative phage integrase  29.28 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02608  integrase/recombinase protein  29.07 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  0.0976015 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4234  integrase family protein  28.1 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4344  integrase/recombinase protein  28.1 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.509087 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6298  integrase family protein  27.33 
 
 		 340 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4939  phage integrase family protein  28.14 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.267668  normal  0.379493 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3675  phage integrase / Tyr recombinase protein  27.53 
 
 		 358 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  19.59 
 
 		 319 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  26.16 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1145  tyrosine recombinase, phage integrase family  25.64 
 
 		 301 aa  50.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00135559  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  26.28 
 
 		 308 aa  49.7  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6006  tyr recombinase activity site-specific recombination  23.67 
 
 		 391 aa  49.7  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  25.44 
 
 		 293 aa  49.7  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  25.09 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  29.45 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4306  integrase/recombinase XerC  22.81 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3580  tyrosine recombinase XerC  26.67 
 
 		 302 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  27.06 
 
 		 301 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0037  integrase-recombinase protein  21.98 
 
 		 285 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.491877  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  25.93 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  25.28 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  25.28 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  25.28 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5582  integrase family protein  29.3 
 
 		 313 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1279  phage integrase family protein  27.34 
 
 		 323 aa  46.2  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0644752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  24.74 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1001  integrase family protein  31.61 
 
 		 333 aa  44.3  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  26.55 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.54 
 
 		 313 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  26.09 
 
 		 332 aa  43.9  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  24.08 
 
 		 314 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04122  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.68 
 
 		 305 aa  43.5  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  22.3 
 
 		 307 aa  43.5  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  28.52 
 
 		 298 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  37.89 
 
 		 411 aa  42.7  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  23.72 
 
 		 295 aa  42.7  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  24.87 
 
 		 283 aa  42.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14190  tyrosine recombinase XerD  28.63 
 
 		 321 aa  42.7  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.127512  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.81 
 
 		 298 aa  42.4  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>