27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0153 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0153  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6348  hypothetical protein  55.98 
 
 
253 aa  245  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.291018 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7390  integrase family protein  81.63 
 
 
313 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.335502 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0809  hypothetical protein  47.15 
 
 
253 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2992  putative transmembrane protein  37.39 
 
 
236 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3512  hypothetical protein  37.62 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3807  hypothetical protein  36.41 
 
 
254 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18849  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0619  hypothetical protein  33.94 
 
 
266 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0794565 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4081  hypothetical protein  32.59 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2455  hypothetical protein  34.65 
 
 
261 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.928532  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6779  integrase family protein  53 
 
 
309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5047  hypothetical protein  35.11 
 
 
253 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.713313  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5340  hypothetical protein  35.11 
 
 
253 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236442  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4959  hypothetical protein  35.11 
 
 
253 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07643  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0051  hypothetical protein  32.52 
 
 
252 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0344  hypothetical protein  33.64 
 
 
267 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123778  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6618  Phage integrase  51.02 
 
 
312 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.821698 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6690  integrase family protein  50 
 
 
333 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.254504 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5334  integrase family protein  50 
 
 
313 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.70643  normal  0.0475719 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6214  phage integrase family protein  48.98 
 
 
311 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.419719  hitchhiker  0.00629138 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5847  phage integrase  48.98 
 
 
311 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.687418  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5993  Phage integrase  46.94 
 
 
342 aa  89.4  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1729  integrase family protein  45 
 
 
297 aa  85.9  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.873688  normal  0.924027 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5154  integrase family protein  45 
 
 
297 aa  86.3  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.471019 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2130  hypothetical protein  27.68 
 
 
261 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128783  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0576  hypothetical protein  25.35 
 
 
260 aa  52.8  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1837  hypothetical protein  24.41 
 
 
263 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.41587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>