37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0576 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0576  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  523  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1148  hypothetical protein  27.13 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1275  hypothetical protein  23.36 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.298884  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0221  hypothetical protein  26.67 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0032159  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0538  hypothetical protein  23.32 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86943  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0051  hypothetical protein  28.23 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4120  hypothetical protein  25.24 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0192  hypothetical protein  22.43 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2097  hypothetical protein  21.37 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.206136 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1773  hypothetical protein  18.8 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.938201 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0714  hypothetical protein  28.26 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.570099  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0992  hypothetical protein  25.44 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.489151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0809  hypothetical protein  23.83 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3176  hypothetical protein  27.37 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.441176  hitchhiker  0.000145856 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2992  putative transmembrane protein  26.01 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5922  hypothetical protein  29.52 
 
 		 252 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235163  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3211  putative integral membrane protein  22.61 
 
 		 249 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  0.0103033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5340  hypothetical protein  23.56 
 
 		 253 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5047  hypothetical protein  23.56 
 
 		 253 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.713313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4959  hypothetical protein  23.56 
 
 		 253 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07643  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0943  hypothetical protein  20.97 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0153  hypothetical protein  26.4 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3303  hypothetical protein  26.18 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0655  hypothetical protein  24.05 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.214725  normal  0.0929318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0666  hypothetical protein  24.05 
 
 		 264 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  0.0354499 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2455  hypothetical protein  24.75 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.928532  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0344  hypothetical protein  25.29 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3391  hypothetical protein  23.08 
 
 		 278 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410479 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1999  hypothetical protein  23.71 
 
 		 278 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.783842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4045  hypothetical protein  26.29 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9307  hypothetical protein  27.66 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3512  hypothetical protein  24.86 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2130  hypothetical protein  21.05 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.133112 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1030  hypothetical protein  20.21 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.275581  normal  0.132673 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1721  hypothetical protein  19.02 
 
 		 224 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00456561  normal  0.931616 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0619  hypothetical protein  23.18 
 
 		 266 aa  42.7  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0794565 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3807  hypothetical protein  24.46 
 
 		 254 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18849  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>