20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0344 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0344  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  545  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123778  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4081  hypothetical protein  66.67 
 
 
267 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0619  hypothetical protein  67.29 
 
 
266 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0794565 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0051  hypothetical protein  35.47 
 
 
252 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0809  hypothetical protein  33.58 
 
 
253 aa  153  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3512  hypothetical protein  34.24 
 
 
254 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3807  hypothetical protein  32.05 
 
 
254 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18849  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2992  putative transmembrane protein  31.58 
 
 
236 aa  135  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2455  hypothetical protein  30.3 
 
 
261 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.928532  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6348  hypothetical protein  31.34 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.291018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5340  hypothetical protein  30.04 
 
 
253 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236442  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4959  hypothetical protein  30.04 
 
 
253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07643  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5047  hypothetical protein  30.04 
 
 
253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.713313  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0153  hypothetical protein  33.64 
 
 
309 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2130  hypothetical protein  27.27 
 
 
261 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128783  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0576  hypothetical protein  25.59 
 
 
260 aa  53.1  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0221  hypothetical protein  24.02 
 
 
263 aa  48.9  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0032159  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1837  hypothetical protein  22.58 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2950  hypothetical protein  24.55 
 
 
271 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0943  hypothetical protein  25.65 
 
 
260 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>