16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2130 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2130  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3512  hypothetical protein  29.6 
 
 		 254 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3807  hypothetical protein  27.06 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2992  putative transmembrane protein  23.21 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0619  hypothetical protein  25.63 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0794565 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4081  hypothetical protein  23.66 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0344  hypothetical protein  26.34 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6348  hypothetical protein  27.7 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.291018 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0051  hypothetical protein  24.39 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4959  hypothetical protein  25.73 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07643  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5047  hypothetical protein  25.73 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.713313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5340  hypothetical protein  24.46 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0809  hypothetical protein  24.48 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0153  hypothetical protein  27.68 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2455  hypothetical protein  26.53 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.928532  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1837  hypothetical protein  27.35 
 
 		 263 aa  42  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>