17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4959 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4959  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  501  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07643  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5047  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  501  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.713313  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5340  hypothetical protein  99.6 
 
 
253 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236442  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3512  hypothetical protein  41.27 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3807  hypothetical protein  40.48 
 
 
254 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18849  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2992  putative transmembrane protein  38.72 
 
 
236 aa  181  9.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0809  hypothetical protein  45.24 
 
 
253 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6348  hypothetical protein  36.22 
 
 
253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.291018 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0051  hypothetical protein  30.8 
 
 
252 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2455  hypothetical protein  34.17 
 
 
261 aa  146  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.928532  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0619  hypothetical protein  31.84 
 
 
266 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0794565 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4081  hypothetical protein  31.2 
 
 
267 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0344  hypothetical protein  30.04 
 
 
267 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123778  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0153  hypothetical protein  35.11 
 
 
309 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2130  hypothetical protein  25.79 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128783  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0576  hypothetical protein  23.36 
 
 
260 aa  61.2  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0221  hypothetical protein  22.92 
 
 
263 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0032159  normal  0.0532211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>