93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6779 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6779  integrase family protein  100 
 
 		 309 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6690  integrase family protein  52.88 
 
 		 333 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.254504 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6214  phage integrase family protein  51.7 
 
 		 311 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.419719  hitchhiker  0.00629138 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5847  phage integrase  51.7 
 
 		 311 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.687418  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6618  Phage integrase  50.67 
 
 		 312 aa  264  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.821698 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7390  integrase family protein  47.3 
 
 		 313 aa  259  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.335502 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5334  integrase family protein  51 
 
 		 313 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.70643  normal  0.0475719 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5993  Phage integrase  51.83 
 
 		 342 aa  248  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1729  integrase family protein  44.15 
 
 		 297 aa  205  7e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.873688  normal  0.924027 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5154  integrase family protein  43.81 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.471019 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0153  hypothetical protein  53 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5041  hypothetical protein  30.91 
 
 		 328 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.283113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0405  hypothetical protein  29.81 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000315128  hitchhiker  0.0000725469 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4939  phage integrase family protein  29.12 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.267668  normal  0.379493 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0002  phage integrase family protein  25.58 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1148  phage integrase family protein  25.58 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0330275  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1428  phage integrase family protein  25.58 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310189  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0002  integrase  25.58 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.66685  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0002  phage integrase family site specific recombinase  25.58 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0002  phage integrase family protein  25.58 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0003  phage integrase family site specific recombinase  25.58 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  27.56 
 
 		 294 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1507  phage integrase family protein  25.58 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0506287  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02608  integrase/recombinase protein  25.4 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  0.0976015 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  26.39 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  24.26 
 
 		 319 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4156  integrase family protein  25.33 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7007  integrase family protein  26.44 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.436087 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.98 
 
 		 300 aa  53.5  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2840  integrase family protein  32 
 
 		 322 aa  53.1  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0238888  normal  0.278729 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5594  integrase/recombinase protein  24.37 
 
 		 341 aa  53.1  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727948  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  26.02 
 
 		 293 aa  52.8  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4234  integrase family protein  23.4 
 
 		 326 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4344  integrase/recombinase protein  23.4 
 
 		 326 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.509087 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.59 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.59 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4969  phage integrase family protein  24.16 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.188705  normal  0.373928 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.59 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3112  integrase family protein  24.16 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.295128 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.59 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04122  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.29 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.08 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.59 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.09 
 
 		 299 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  30.69 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  32.73 
 
 		 317 aa  50.4  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5698  phage integrase family protein  24.17 
 
 		 339 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  hitchhiker  0.00119848 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.09 
 
 		 299 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.09 
 
 		 299 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5161  phage integrase  24.17 
 
 		 339 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0039  tyrosine recombinase XerD  28.47 
 
 		 312 aa  50.1  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.6 
 
 		 299 aa  49.7  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.09 
 
 		 299 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4539  integrase family protein  24.34 
 
 		 339 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0001  Phage integrase  25.17 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3158  integrase family protein  25.17 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  27.41 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  23.47 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3024  putative phage integrase  26.37 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2271  phage integrase family protein  28.68 
 
 		 321 aa  47  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3587  integrase family protein  22.97 
 
 		 304 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000000515843  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  31.29 
 
 		 310 aa  46.2  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0393  tyrosine recombinase XerC  27.5 
 
 		 321 aa  46.2  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  30.41 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  34.25 
 
 		 304 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1555  tyrosine recombinase XerD  22.35 
 
 		 290 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  28.38 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3947  integrase family protein  27.71 
 
 		 353 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.859516  normal  0.187137 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  21.74 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1847  integrase family protein  25.58 
 
 		 314 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  30.41 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  27.7 
 
 		 283 aa  45.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  31.25 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  29 
 
 		 311 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.94 
 
 		 322 aa  44.3  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  30.05 
 
 		 285 aa  43.9  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  28.98 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0447  tyrosine recombinase XerC  22.08 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  26.59 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  27 
 
 		 302 aa  43.9  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1428  phage integrase  26.38 
 
 		 317 aa  43.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal  0.0585003 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  27.06 
 
 		 342 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  25.42 
 
 		 309 aa  43.1  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.67 
 
 		 325 aa  43.1  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  24.91 
 
 		 328 aa  43.1  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  26.47 
 
 		 307 aa  42.7  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1659  tyrosine recombinase XerD subunit  28.5 
 
 		 296 aa  42.7  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  26.47 
 
 		 307 aa  42.4  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  22.75 
 
 		 299 aa  42.4  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3445  integrase family protein  23.53 
 
 		 304 aa  42.4  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  23.98 
 
 		 291 aa  42.4  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0611  integrase family protein  24.44 
 
 		 337 aa  42.4  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>