91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0001 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4539  integrase family protein  94.4 
 
 		 339 aa  655    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3112  integrase family protein  93.22 
 
 		 337 aa  645    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.295128 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5698  phage integrase family protein  94.69 
 
 		 339 aa  657    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  hitchhiker  0.00119848 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0001  Phage integrase  100 
 
 		 339 aa  691    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4969  phage integrase family protein  93.51 
 
 		 337 aa  644    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.188705  normal  0.373928 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5161  phage integrase  94.69 
 
 		 339 aa  657    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3158  integrase family protein  86.73 
 
 		 337 aa  589  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0002  phage integrase family protein  72.75 
 
 		 347 aa  498  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0002  phage integrase family protein  74.45 
 
 		 347 aa  494  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0002  phage integrase family site specific recombinase  74.45 
 
 		 347 aa  494  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0002  integrase  74.77 
 
 		 347 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.66685  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1148  phage integrase family protein  74.45 
 
 		 347 aa  494  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0330275  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0003  phage integrase family site specific recombinase  74.14 
 
 		 347 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1428  phage integrase family protein  74.14 
 
 		 347 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310189  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1507  phage integrase family protein  74.45 
 
 		 347 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0506287  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4156  integrase family protein  64.52 
 
 		 354 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7007  integrase family protein  60.71 
 
 		 360 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.436087 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3024  putative phage integrase  61.31 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5594  integrase/recombinase protein  39.64 
 
 		 341 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727948  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02608  integrase/recombinase protein  36.83 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  0.0976015 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4344  integrase/recombinase protein  36.98 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.509087 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4234  integrase family protein  36.98 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3675  phage integrase / Tyr recombinase protein  37.57 
 
 		 358 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6006  tyr recombinase activity site-specific recombination  30.03 
 
 		 391 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4939  phage integrase family protein  32.88 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.267668  normal  0.379493 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6298  integrase family protein  28.62 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7390  integrase family protein  29.28 
 
 		 313 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.335502 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5154  integrase family protein  25.75 
 
 		 297 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.471019 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1729  integrase family protein  25.75 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.873688  normal  0.924027 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5993  Phage integrase  31.44 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6690  integrase family protein  29.93 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.254504 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6618  Phage integrase  30 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.821698 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0405  hypothetical protein  24.29 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000315128  hitchhiker  0.0000725469 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6214  phage integrase family protein  29.2 
 
 		 311 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.419719  hitchhiker  0.00629138 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5847  phage integrase  29.2 
 
 		 311 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.687418  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4618  integrase family protein  29.33 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  29.71 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4462  integrase family protein  28 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0012  Phage integrase  26.01 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5334  integrase family protein  29.24 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.70643  normal  0.0475719 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5041  hypothetical protein  23.49 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.283113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1273  phage integrase  26.44 
 
 		 331 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010146 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  28.12 
 
 		 373 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5937  phage integrase family protein  28.98 
 
 		 329 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2347  phage integrase family protein  25.4 
 
 		 332 aa  50.4  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.01871 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3505  phage integrase family protein  28.74 
 
 		 330 aa  49.7  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431904  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2008  integrase family protein  28.74 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2228  integrase family protein  28.74 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.763924 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5348  integrase family protein  28.74 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464558 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  27.33 
 
 		 332 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6779  integrase family protein  25.17 
 
 		 309 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1730  integrase family protein  31.78 
 
 		 317 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00295  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.09 
 
 		 297 aa  47.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3580  tyrosine recombinase XerC  27.14 
 
 		 302 aa  47.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4243  phage integrase  26.62 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000426285 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  27.22 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  20.9 
 
 		 301 aa  46.2  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5408  phage integrase family protein  29.14 
 
 		 330 aa  46.2  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.123433 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1914  integrase/recombinase  27.92 
 
 		 304 aa  46.2  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00100079  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3266  phage integrase family protein  28.86 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119927  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  27.92 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  27.92 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5530  site-specific tyrosine recombinase XerS  29.53 
 
 		 357 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.267916  hitchhiker  0.00142122 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3884  phage integrase family site specific recombinase  25.87 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.06 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  23.91 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  23.91 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3971  tyrosine recombinase XerC  24.64 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3558  phage integrase family protein  24.56 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  23.91 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0370  integrase family protein  28.27 
 
 		 332 aa  43.5  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.14 
 
 		 298 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1013  site-specific tyrosine recombinase XerS  28.85 
 
 		 356 aa  43.1  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00257725  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0018  site-specific tyrosine recombinase XerS  28.86 
 
 		 358 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000485096  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3894  tyrosine recombinase XerC  24.64 
 
 		 306 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.14 
 
 		 298 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.14 
 
 		 298 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.14 
 
 		 298 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.14 
 
 		 298 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3993  tyrosine recombinase XerC  24.64 
 
 		 306 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4087  tyrosine recombinase XerC  24.64 
 
 		 306 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0169707 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  26.67 
 
 		 283 aa  43.1  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  22.44 
 
 		 310 aa  43.1  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0366  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 		 173 aa  42.7  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.61457  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  27.12 
 
 		 407 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2492  integrase family protein  22.75 
 
 		 332 aa  42.7  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4306  integrase/recombinase XerC  23.19 
 
 		 299 aa  42.7  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0261  site-specific tyrosine recombinase XerS  25.95 
 
 		 361 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3221  integrase family protein  26.75 
 
 		 337 aa  42.7  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  hitchhiker  0.000000474252 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  19.66 
 
 		 290 aa  42.7  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0768  integrase family protein  25.56 
 
 		 337 aa  42.7  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000101801 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>