77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5594 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5594  integrase/recombinase protein  100 
 
 		 341 aa  679    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727948  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3675  phage integrase / Tyr recombinase protein  68.77 
 
 		 358 aa  440  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_003296  RS02608  integrase/recombinase protein  47.95 
 
 		 323 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  0.0976015 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4344  integrase/recombinase protein  46.75 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.509087 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4234  integrase family protein  46.75 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0003  phage integrase family site specific recombinase  42.14 
 
 		 347 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1428  phage integrase family protein  42.14 
 
 		 347 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310189  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1507  phage integrase family protein  42.14 
 
 		 347 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0506287  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0002  phage integrase family protein  42.14 
 
 		 347 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0002  phage integrase family site specific recombinase  42.14 
 
 		 347 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0002  integrase  42.14 
 
 		 347 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.66685  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1148  phage integrase family protein  42.14 
 
 		 347 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0330275  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0002  phage integrase family protein  41.82 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7007  integrase family protein  40.12 
 
 		 360 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.436087 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3158  integrase family protein  38.6 
 
 		 337 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5698  phage integrase family protein  39.23 
 
 		 339 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  hitchhiker  0.00119848 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5161  phage integrase  39.23 
 
 		 339 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4539  integrase family protein  38.94 
 
 		 339 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3112  integrase family protein  39.88 
 
 		 337 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.295128 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4969  phage integrase family protein  39.88 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.188705  normal  0.373928 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0001  Phage integrase  39.64 
 
 		 339 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3024  putative phage integrase  39.51 
 
 		 360 aa  185  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4156  integrase family protein  38.49 
 
 		 354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4939  phage integrase family protein  33.55 
 
 		 305 aa  119  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.267668  normal  0.379493 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6006  tyr recombinase activity site-specific recombination  27.32 
 
 		 391 aa  102  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7390  integrase family protein  27.56 
 
 		 313 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.335502 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6298  integrase family protein  33.44 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5993  Phage integrase  28.75 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5847  phage integrase  28.43 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.687418  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6214  phage integrase family protein  28.43 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.419719  hitchhiker  0.00629138 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5154  integrase family protein  25.48 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.471019 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1729  integrase family protein  25.48 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.873688  normal  0.924027 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6690  integrase family protein  28.12 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.254504 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6618  Phage integrase  27.48 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.821698 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5041  hypothetical protein  23.51 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.283113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  33.55 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6779  integrase family protein  24.37 
 
 		 309 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2413  integrase family protein  28.4 
 
 		 182 aa  53.1  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5334  integrase family protein  27.01 
 
 		 313 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.70643  normal  0.0475719 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  29.76 
 
 		 294 aa  50.4  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  30.34 
 
 		 293 aa  50.4  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  29.37 
 
 		 301 aa  49.3  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4949  hypothetical protein  25.71 
 
 		 416 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.284652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0405  hypothetical protein  24.23 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000315128  hitchhiker  0.0000725469 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2409  integrase family protein  27.07 
 
 		 197 aa  47.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5937  phage integrase family protein  29.54 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.5 
 
 		 302 aa  47.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  32.43 
 
 		 286 aa  47  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0264  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.04 
 
 		 315 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7458  integrase family protein  26.12 
 
 		 335 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1056  integrase family protein  27.07 
 
 		 197 aa  46.6  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0180759 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 319 aa  46.6  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4760  integrase family protein  29.45 
 
 		 354 aa  46.6  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  28.42 
 
 		 395 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  27.39 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  24.33 
 
 		 309 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0015  Phage integrase  24.35 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.230922  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.07 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  24 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  23.51 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2421  integrase family protein  26.06 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0129159 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0366  phage integrase family site specific recombinase  24.53 
 
 		 173 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.61457  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3442  phage integrase  38.75 
 
 		 337 aa  43.9  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1241  phage integrase  28.74 
 
 		 336 aa  43.5  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  23.51 
 
 		 300 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3884  phage integrase family site specific recombinase  29.61 
 
 		 310 aa  43.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0370  integrase family protein  28.77 
 
 		 332 aa  43.5  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  21.08 
 
 		 301 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0311  site-specific tyrosine recombinase XerS  24.87 
 
 		 361 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3218  phage integrase family protein  28.95 
 
 		 310 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000104017 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.28 
 
 		 303 aa  42.7  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.28 
 
 		 303 aa  42.7  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2871  integrase family protein  25.85 
 
 		 198 aa  42.7  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.28 
 
 		 303 aa  42.7  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0873  HbiF  25.48 
 
 		 188 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.102979  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0839  DNA recombinase HbiF  25.48 
 
 		 188 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821916 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0776  hypothetical protein  25.48 
 
 		 188 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.371446 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>