81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0405 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0405  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  762    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000315128  hitchhiker  0.0000725469 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5041  hypothetical protein  26.24 
 
 		 328 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.283113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5993  Phage integrase  33.21 
 
 		 342 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4156  integrase family protein  26.11 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7390  integrase family protein  27.33 
 
 		 313 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.335502 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4969  phage integrase family protein  25 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.188705  normal  0.373928 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5154  integrase family protein  26.33 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.471019 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3112  integrase family protein  25.14 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.295128 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1729  integrase family protein  26.92 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.873688  normal  0.924027 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0002  phage integrase family protein  25.53 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0001  Phage integrase  24.72 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1507  phage integrase family protein  25.53 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0506287  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1148  phage integrase family protein  25.53 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0330275  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0002  phage integrase family protein  25.53 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0002  integrase  25.53 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.66685  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1428  phage integrase family protein  25.53 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310189  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0003  phage integrase family site specific recombinase  25.53 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0002  phage integrase family site specific recombinase  25.53 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4539  integrase family protein  24.51 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5161  phage integrase  24.51 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5698  phage integrase family protein  24.51 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  hitchhiker  0.00119848 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6779  integrase family protein  27.59 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3158  integrase family protein  24.25 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7007  integrase family protein  24.43 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.436087 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6690  integrase family protein  27.31 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.254504 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5847  phage integrase  27 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.687418  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6214  phage integrase family protein  27 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.419719  hitchhiker  0.00629138 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6298  integrase family protein  25.51 
 
 		 340 aa  57  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6618  Phage integrase  26.54 
 
 		 312 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.821698 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5334  integrase family protein  28.24 
 
 		 313 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.70643  normal  0.0475719 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2012  Phage integrase  27.38 
 
 		 329 aa  53.9  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4939  phage integrase family protein  26.35 
 
 		 305 aa  53.5  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.267668  normal  0.379493 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 299 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0684  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.95 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.631001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 299 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4608  site-specific recombinase, phage integrase family  25.52 
 
 		 320 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.764652  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0772  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.89 
 
 		 324 aa  51.2  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1475  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  25.52 
 
 		 320 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.04346  normal  0.165942 
 
 
-
 
NC_002950  PG0386  phage integrase family site specific recombinase  25.11 
 
 		 400 aa  50.8  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.33 
 
 		 299 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.89 
 
 		 299 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.45 
 
 		 301 aa  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.56 
 
 		 299 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.56 
 
 		 299 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  24.82 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  22.9 
 
 		 301 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4949  hypothetical protein  24.41 
 
 		 416 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.284652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5594  integrase/recombinase protein  24.23 
 
 		 341 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727948  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3024  putative phage integrase  26.15 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1492  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  25.1 
 
 		 320 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4646  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  24.47 
 
 		 317 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.12 
 
 		 299 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3587  integrase family protein  20.82 
 
 		 304 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000000515843  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.12 
 
 		 299 aa  47.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.16 
 
 		 302 aa  47  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5937  phage integrase family protein  27.14 
 
 		 329 aa  47  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  24.82 
 
 		 311 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.08 
 
 		 299 aa  46.6  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0142  integrase family protein  23.88 
 
 		 292 aa  46.6  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4798  phage integrase family protein  26.29 
 
 		 331 aa  46.2  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.586427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3589  phage integrase family protein  23.96 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0455  phage integrase family protein  23.96 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3398  integrase  21.74 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.292469  normal  0.438437 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3558  phage integrase family protein  26.04 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5497  phage integrase family protein  23.96 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052501 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1508  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  24.05 
 
 		 319 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  24.3 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  25.74 
 
 		 254 aa  45.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  23.82 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0421  integrase family protein  28.35 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1428  phage integrase  25 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal  0.0585003 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0052  phage integrase  23.53 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  22.43 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3505  phage integrase family protein  25.27 
 
 		 330 aa  44.3  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431904  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.85 
 
 		 299 aa  44.3  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3749  phage integrase family protein  21.59 
 
 		 318 aa  43.5  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00852374  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  25.52 
 
 		 308 aa  43.5  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  25.7 
 
 		 301 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  21.02 
 
 		 301 aa  42.7  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>