271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4939 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008759  Pnap_4939  phage integrase family protein  100 
 
 		 305 aa  619  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.267668  normal  0.379493 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4156  integrase family protein  33.22 
 
 		 354 aa  135  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4539  integrase family protein  33.9 
 
 		 339 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5161  phage integrase  33.9 
 
 		 339 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5698  phage integrase family protein  33.9 
 
 		 339 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  hitchhiker  0.00119848 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0002  phage integrase family site specific recombinase  33.33 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1507  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0506287  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0002  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0002  integrase  33.33 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.66685  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0003  phage integrase family site specific recombinase  33.33 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1148  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0330275  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1428  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310189  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0002  phage integrase family protein  33.67 
 
 		 347 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5594  integrase/recombinase protein  33.55 
 
 		 341 aa  125  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727948  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0001  Phage integrase  32.88 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3158  integrase family protein  33.9 
 
 		 337 aa  123  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7007  integrase family protein  33.78 
 
 		 360 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.436087 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4969  phage integrase family protein  32.88 
 
 		 337 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.188705  normal  0.373928 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3112  integrase family protein  32.2 
 
 		 337 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.295128 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3024  putative phage integrase  34.8 
 
 		 360 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7390  integrase family protein  28.46 
 
 		 313 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.335502 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3675  phage integrase / Tyr recombinase protein  29.61 
 
 		 358 aa  85.9  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1729  integrase family protein  26.91 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.873688  normal  0.924027 
 
 
-
 
NC_003296  RS02608  integrase/recombinase protein  30.17 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  0.0976015 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5154  integrase family protein  26.55 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.471019 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4234  integrase family protein  30.4 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4344  integrase/recombinase protein  30.4 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.509087 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5993  Phage integrase  27.78 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6298  integrase family protein  29.19 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  28.91 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6779  integrase family protein  29.23 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0405  hypothetical protein  26.23 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000315128  hitchhiker  0.0000725469 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.69 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0105  hydrogenase expression/formation protein  27.35 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.86 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2090  transport protein  27.35 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0326537  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3738  tyrosine recombinase XerD subunit  31.87 
 
 		 328 aa  62  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6006  tyr recombinase activity site-specific recombination  26.48 
 
 		 391 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  30.56 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0735  integrase/recombinase  26.2 
 
 		 355 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000138239  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0950  phage integrase family site specific recombinase  24.71 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0218535  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0879  phage integrase family site specific recombinase  24.71 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.159654  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  30.23 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.96 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1012  phage integrase family site specific recombinase  24.71 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000959514  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.73 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  26.79 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  22.83 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  28.27 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  29.07 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5041  hypothetical protein  25.1 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.283113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  23.22 
 
 		 290 aa  57  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1508  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  28.95 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1132  phage integrase family site specific recombinase  24.86 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0562  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.65 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4646  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  28.27 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  26.2 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1268  integrase family protein  24.29 
 
 		 353 aa  55.8  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.83 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.83 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.83 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  27.31 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  29.73 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  26.22 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.32 
 
 		 277 aa  55.5  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1991  metallo-beta-lactamase family protein  25.86 
 
 		 353 aa  54.3  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3696  integrase family protein  31.25 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  32.2 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.63 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4006  integrase family protein  31.25 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.84 
 
 		 330 aa  53.9  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  28.06 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  25.67 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2012  Phage integrase  25.97 
 
 		 329 aa  53.5  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  23.76 
 
 		 301 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  25.67 
 
 		 298 aa  53.1  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.25 
 
 		 299 aa  53.1  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2544  tyrosine recombinase XerC  26.79 
 
 		 318 aa  53.1  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774585  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  29.23 
 
 		 304 aa  52.8  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0530  tyrosine recombinase XerD  24.2 
 
 		 320 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.931339  normal  0.0955198 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0843  phage integrase family site specific recombinase  23.55 
 
 		 354 aa  52.4  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00824905  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  24.83 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4608  site-specific recombinase, phage integrase family  28.45 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.764652  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1475  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  28.45 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.04346  normal  0.165942 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.25 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.25 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0409  Phage integrase  26.11 
 
 		 317 aa  50.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.383536  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1902  phage integrase  29.35 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8116  integrase/recombinase  30.9 
 
 		 335 aa  51.2  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000851463  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  25.77 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3407  integrase family protein  28.43 
 
 		 325 aa  51.2  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.25 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  27.86 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.25 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5937  phage integrase family protein  29.15 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  29.43 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2512  type 1 fimbriae regulatory protein  28.41 
 
 		 209 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.570306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0421  integrase family protein  28.35 
 
 		 329 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  25.93 
 
 		 304 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  26.54 
 
 		 311 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>