47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6298 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6298  integrase family protein  100 
 
 		 340 aa  679    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3158  integrase family protein  29.52 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4156  integrase family protein  31.75 
 
 		 354 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4539  integrase family protein  29.35 
 
 		 339 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5698  phage integrase family protein  29.35 
 
 		 339 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  hitchhiker  0.00119848 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4969  phage integrase family protein  28.71 
 
 		 337 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.188705  normal  0.373928 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5161  phage integrase  29.35 
 
 		 339 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3112  integrase family protein  28.71 
 
 		 337 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.295128 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1507  phage integrase family protein  29.69 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0506287  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0001  Phage integrase  28.62 
 
 		 339 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0002  phage integrase family protein  29.38 
 
 		 347 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0003  phage integrase family site specific recombinase  29.38 
 
 		 347 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0002  integrase  29.38 
 
 		 347 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.66685  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1428  phage integrase family protein  29.38 
 
 		 347 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310189  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1148  phage integrase family protein  29.38 
 
 		 347 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0330275  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0002  phage integrase family site specific recombinase  29.38 
 
 		 347 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0002  phage integrase family protein  29.25 
 
 		 347 aa  92.8  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7007  integrase family protein  29.23 
 
 		 360 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.436087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5594  integrase/recombinase protein  33.44 
 
 		 341 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727948  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3024  putative phage integrase  29.54 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4939  phage integrase family protein  29.19 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.267668  normal  0.379493 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  31.1 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7390  integrase family protein  27.83 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.335502 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5041  hypothetical protein  24.77 
 
 		 328 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.283113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  29.67 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  29.67 
 
 		 311 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0405  hypothetical protein  25.51 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000315128  hitchhiker  0.0000725469 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6618  Phage integrase  28.53 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.821698 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5993  Phage integrase  26.21 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3675  phage integrase / Tyr recombinase protein  26.91 
 
 		 358 aa  53.9  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  35 
 
 		 283 aa  52.8  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5334  integrase family protein  30.06 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.70643  normal  0.0475719 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4344  integrase/recombinase protein  29.15 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.509087 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4234  integrase family protein  29.15 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1846  integrase family protein  30.19 
 
 		 370 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000018136  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  29.49 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0339  phage integrase  30.77 
 
 		 277 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  27.37 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1145  tyrosine recombinase, phage integrase family  27.78 
 
 		 301 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00135559  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0735  integrase/recombinase  23.4 
 
 		 355 aa  46.6  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000138239  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02608  integrase/recombinase protein  28.24 
 
 		 323 aa  46.2  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  0.0976015 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  27.75 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_002978  WD1148  phage integrase family site specific recombinase  20.32 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0281308  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  30.85 
 
 		 332 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0401  integrase family protein  25.16 
 
 		 310 aa  43.5  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4383  hypothetical protein  25 
 
 		 347 aa  42.7  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6690  integrase family protein  27.33 
 
 		 333 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.254504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>