12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4383 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4383  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  707    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3241  hypothetical protein  31.74 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4572  phage integrase  29.24 
 
 		 337 aa  105  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0929051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5390  phage integrase  28.25 
 
 		 358 aa  104  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.824533  normal  0.372469 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4431  phage integrase  23.46 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.521707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3947  integrase family protein  28.01 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.859516  normal  0.187137 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4949  hypothetical protein  25.87 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.284652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5041  hypothetical protein  22.74 
 
 		 328 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.283113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6298  integrase family protein  25 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  29.61 
 
 		 311 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  30.1 
 
 		 311 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  25.88 
 
 		 294 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>