85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5334 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5334  integrase family protein  100 
 
 
313 aa  616  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.70643  normal  0.0475719 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6618  Phage integrase  82.11 
 
 
312 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.821698 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6690  integrase family protein  80.45 
 
 
333 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.254504 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6214  phage integrase family protein  80.13 
 
 
311 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.419719  hitchhiker  0.00629138 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5847  phage integrase  80.13 
 
 
311 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.687418  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6779  integrase family protein  51 
 
 
309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5993  Phage integrase  48.66 
 
 
342 aa  231  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7390  integrase family protein  45.67 
 
 
313 aa  229  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.335502 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5154  integrase family protein  44 
 
 
297 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.471019 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1729  integrase family protein  43.67 
 
 
297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.873688  normal  0.924027 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5041  hypothetical protein  29.39 
 
 
328 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.283113  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0153  hypothetical protein  50 
 
 
309 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1428  phage integrase family protein  30.16 
 
 
347 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310189  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0002  phage integrase family site specific recombinase  30.7 
 
 
347 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1148  phage integrase family protein  30.7 
 
 
347 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0330275  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0002  integrase  30.16 
 
 
347 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.66685  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0003  phage integrase family site specific recombinase  30.16 
 
 
347 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1507  phage integrase family protein  30.16 
 
 
347 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0506287  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0002  phage integrase family protein  30.7 
 
 
347 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0002  phage integrase family protein  29.84 
 
 
347 aa  87.8  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7007  integrase family protein  31.19 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.436087 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3112  integrase family protein  29.35 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.295128 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4969  phage integrase family protein  28.99 
 
 
337 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.188705  normal  0.373928 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4539  integrase family protein  29.03 
 
 
339 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5161  phage integrase  29.03 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5698  phage integrase family protein  29.03 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  hitchhiker  0.00119848 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4156  integrase family protein  29.08 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0001  Phage integrase  29.6 
 
 
339 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5594  integrase/recombinase protein  27.01 
 
 
341 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727948  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3158  integrase family protein  28.52 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3024  putative phage integrase  30.59 
 
 
360 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6298  integrase family protein  30.06 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0405  hypothetical protein  28.63 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000315128  hitchhiker  0.0000725469 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.57 
 
 
298 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.2 
 
 
298 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.2 
 
 
298 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.2 
 
 
298 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.2 
 
 
298 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.47 
 
 
298 aa  55.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.47 
 
 
298 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.47 
 
 
298 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  26.47 
 
 
298 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  26.47 
 
 
298 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.47 
 
 
298 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.47 
 
 
298 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.47 
 
 
298 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.3 
 
 
298 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1902  phage integrase  28.63 
 
 
293 aa  53.5  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6006  tyr recombinase activity site-specific recombination  22.67 
 
 
391 aa  52.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02608  integrase/recombinase protein  27.8 
 
 
323 aa  52.8  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  0.0976015 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  24.63 
 
 
299 aa  52  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  28.93 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4234  integrase family protein  26.64 
 
 
326 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4344  integrase/recombinase protein  26.64 
 
 
326 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.509087 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3312  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.66 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0895  tyrosine recombinase XerD  28.25 
 
 
308 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4939  phage integrase family protein  26.26 
 
 
305 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.267668  normal  0.379493 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  31.85 
 
 
306 aa  47.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  23.31 
 
 
319 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2593  integrase family protein  26.62 
 
 
291 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3675  phage integrase / Tyr recombinase protein  26.58 
 
 
358 aa  47  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.28 
 
 
277 aa  46.2  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.74 
 
 
294 aa  46.2  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  28.7 
 
 
296 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  29.7 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.72 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0890  tyrosine recombinase XerD  28.74 
 
 
300 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267893  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0611  integrase family protein  24.86 
 
 
337 aa  44.3  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.19 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.19 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3115  phage integrase  30.08 
 
 
298 aa  44.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.19 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0562  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.62 
 
 
300 aa  44.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0684  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.2 
 
 
324 aa  44.3  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.631001  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  31.74 
 
 
298 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  24.13 
 
 
314 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.05 
 
 
325 aa  43.5  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  27.59 
 
 
308 aa  43.5  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0039  tyrosine recombinase XerD  26.28 
 
 
312 aa  43.1  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.93 
 
 
345 aa  43.5  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  22.73 
 
 
336 aa  43.1  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3709  phage integrase family protein  23.73 
 
 
289 aa  43.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  25.09 
 
 
304 aa  42.7  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0011  phage integrase family protein  28.7 
 
 
301 aa  42.7  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 
331 aa  42.7  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>