82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6690 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6690  integrase family protein  100 
 
 		 333 aa  656    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.254504 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5847  phage integrase  96.46 
 
 		 311 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.687418  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6214  phage integrase family protein  96.46 
 
 		 311 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.419719  hitchhiker  0.00629138 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6618  Phage integrase  88.42 
 
 		 312 aa  494  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.821698 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5334  integrase family protein  80.45 
 
 		 313 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.70643  normal  0.0475719 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6779  integrase family protein  53.04 
 
 		 309 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7390  integrase family protein  44.67 
 
 		 313 aa  231  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.335502 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5993  Phage integrase  49.17 
 
 		 342 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5154  integrase family protein  44 
 
 		 297 aa  215  8e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.471019 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1729  integrase family protein  44 
 
 		 297 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.873688  normal  0.924027 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0153  hypothetical protein  50 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5041  hypothetical protein  29.71 
 
 		 328 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.283113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0002  phage integrase family protein  30.07 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1507  phage integrase family protein  29.97 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0506287  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0002  phage integrase family site specific recombinase  29.74 
 
 		 347 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0002  integrase  29.97 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.66685  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0002  phage integrase family protein  29.97 
 
 		 347 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1148  phage integrase family protein  29.97 
 
 		 347 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0330275  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1428  phage integrase family protein  29.97 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310189  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7007  integrase family protein  30.03 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.436087 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0003  phage integrase family site specific recombinase  29.97 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3112  integrase family protein  30.66 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.295128 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4969  phage integrase family protein  30.29 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.188705  normal  0.373928 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4156  integrase family protein  28.48 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4539  integrase family protein  29.5 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5161  phage integrase  29.5 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5698  phage integrase family protein  29.5 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  hitchhiker  0.00119848 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3158  integrase family protein  30.29 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0001  Phage integrase  29.93 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5594  integrase/recombinase protein  28.12 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727948  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3024  putative phage integrase  29.61 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0405  hypothetical protein  27.59 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000315128  hitchhiker  0.0000725469 
 
 
-
 
NC_003296  RS02608  integrase/recombinase protein  30.35 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  0.0976015 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3675  phage integrase / Tyr recombinase protein  28.31 
 
 		 358 aa  59.3  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4344  integrase/recombinase protein  28.1 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.509087 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4234  integrase family protein  28.1 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6298  integrase family protein  27.33 
 
 		 340 aa  53.5  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  19.24 
 
 		 319 aa  53.1  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4939  phage integrase family protein  28.04 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.267668  normal  0.379493 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6006  tyr recombinase activity site-specific recombination  22.02 
 
 		 391 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  25.82 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  25.35 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  25.44 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1145  tyrosine recombinase, phage integrase family  26.58 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00135559  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  25.09 
 
 		 293 aa  46.6  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  27.12 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0895  tyrosine recombinase XerD  27.54 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  24.75 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04122  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.53 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  40 
 
 		 411 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  24.24 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1001  integrase family protein  31.03 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  26.6 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.14 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3947  integrase family protein  25.32 
 
 		 353 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.859516  normal  0.187137 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07060  site-specific recombinase XerD  24.61 
 
 		 315 aa  44.3  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.273434 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  27.78 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4062  tyrosine recombinase XerD  26.98 
 
 		 353 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.159612  normal  0.47475 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1481  integrase family protein  29.49 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  24.69 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  27.73 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1279  phage integrase family protein  28.09 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0644752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.65 
 
 		 294 aa  43.9  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.18 
 
 		 298 aa  43.9  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.65 
 
 		 277 aa  43.9  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  25.28 
 
 		 283 aa  43.5  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  26.25 
 
 		 303 aa  43.1  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0890  tyrosine recombinase XerD  25.62 
 
 		 300 aa  43.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267893  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  21.09 
 
 		 307 aa  43.1  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  30.25 
 
 		 313 aa  42.7  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5582  integrase family protein  28.48 
 
 		 313 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.04 
 
 		 311 aa  42.7  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0037  integrase-recombinase protein  22.63 
 
 		 285 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.491877  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  22.86 
 
 		 298 aa  42.7  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  22.86 
 
 		 298 aa  42.7  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.86 
 
 		 298 aa  42.7  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.86 
 
 		 298 aa  42.7  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.86 
 
 		 298 aa  42.7  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.12 
 
 		 298 aa  42.7  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.86 
 
 		 298 aa  42.7  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.86 
 
 		 298 aa  42.7  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.12 
 
 		 298 aa  42.4  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>