More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5497 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0455  phage integrase family protein  100 
 
 
349 aa  696    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3589  phage integrase family protein  100 
 
 
349 aa  696    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0127182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5497  phage integrase family protein  100 
 
 
349 aa  696    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.052501 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1113  phage integrase family protein  39.04 
 
 
364 aa  205  8e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0671879  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4645  phage integrase family protein  38 
 
 
360 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4728  integrase family protein  44.49 
 
 
324 aa  179  8e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2670  integrase family protein  44.49 
 
 
324 aa  179  8e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2585  integrase family protein  44.49 
 
 
324 aa  179  8e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3706  integrase family protein  40.26 
 
 
334 aa  172  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000354013  normal  0.710204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1237  integrase family protein  40.26 
 
 
334 aa  172  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2522  integrase family protein  40.26 
 
 
334 aa  172  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000359584  hitchhiker  0.00166754 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  27.08 
 
 
295 aa  119  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  25.71 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  32.52 
 
 
295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  30.59 
 
 
367 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  32.21 
 
 
294 aa  112  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  26.61 
 
 
298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  26.61 
 
 
298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  25.6 
 
 
361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  30.82 
 
 
293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  32.66 
 
 
294 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  27.22 
 
 
323 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  28.53 
 
 
313 aa  110  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  28.18 
 
 
305 aa  109  8.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  23.82 
 
 
361 aa  109  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  23.82 
 
 
361 aa  109  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  23.82 
 
 
361 aa  109  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  23.82 
 
 
361 aa  109  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  23.82 
 
 
361 aa  109  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  23.82 
 
 
361 aa  109  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  23.82 
 
 
361 aa  109  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  30.48 
 
 
320 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  29.94 
 
 
293 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  30.93 
 
 
317 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  29.88 
 
 
290 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  30.47 
 
 
310 aa  106  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1698  integrase family protein  27.93 
 
 
314 aa  105  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  28.37 
 
 
308 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  31.25 
 
 
294 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  32.11 
 
 
343 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  29.85 
 
 
314 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  32.01 
 
 
342 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  28.03 
 
 
310 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  28.18 
 
 
294 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  30.82 
 
 
311 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  26.81 
 
 
297 aa  104  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1317  phage integrase family protein  33.13 
 
 
325 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  30.42 
 
 
313 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  31.8 
 
 
343 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  29.28 
 
 
297 aa  103  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  24.33 
 
 
300 aa  103  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  29.36 
 
 
292 aa  102  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3115  phage integrase  31.91 
 
 
298 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  33.54 
 
 
304 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  24.34 
 
 
310 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  26.2 
 
 
302 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.98 
 
 
299 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  27.54 
 
 
306 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  33.75 
 
 
310 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  26.77 
 
 
295 aa  101  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  23.58 
 
 
307 aa  101  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3587  integrase family protein  28.08 
 
 
304 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000000515843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  25.9 
 
 
302 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  26.2 
 
 
302 aa  100  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  30.51 
 
 
317 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  23.05 
 
 
307 aa  99.4  8e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0240  tyrosine recombinase XerC subunit  32.8 
 
 
291 aa  99.4  9e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.295303  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0663  tyrosine recombinase XerD  25.84 
 
 
305 aa  98.6  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  31.33 
 
 
298 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  25.53 
 
 
298 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  26.33 
 
 
300 aa  98.2  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  29.41 
 
 
332 aa  98.2  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3398  integrase  26.69 
 
 
293 aa  98.2  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.292469  normal  0.438437 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  24 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0401  integrase family protein  23.77 
 
 
310 aa  97.8  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  27.04 
 
 
309 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2654  tyrosine recombinase XerD  36.36 
 
 
306 aa  97.8  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3445  integrase family protein  27.9 
 
 
304 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  29.13 
 
 
302 aa  97.4  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  32.23 
 
 
295 aa  97.4  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  26.38 
 
 
321 aa  97.4  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0234  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.57 
 
 
302 aa  97.1  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  31.47 
 
 
299 aa  97.1  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  26.73 
 
 
309 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  27.1 
 
 
322 aa  96.7  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.45 
 
 
301 aa  96.3  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  26.59 
 
 
307 aa  95.9  9e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  27.04 
 
 
309 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  23.73 
 
 
295 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1914  integrase/recombinase  29.66 
 
 
304 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00100079  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  24.62 
 
 
310 aa  95.5  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5643  tyrosine recombinase XerD  29.13 
 
 
299 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.776137 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.35 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  29.31 
 
 
373 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  23.73 
 
 
295 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  30.82 
 
 
317 aa  95.1  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.45 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.45 
 
 
299 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.77 
 
 
299 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  22.59 
 
 
301 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>