More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0844 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0844  ribonuclease R  100 
 
 		 681 aa  1409    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.360488  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3672  ribonuclease R  53.11 
 
 		 787 aa  743    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330393  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0605  VacB/RNase II family exoribonuclease  52.81 
 
 		 783 aa  748    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3416  ribonuclease R  49.26 
 
 		 791 aa  637    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.076864  normal  0.337145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2337  ribonuclease R  50.76 
 
 		 795 aa  649    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235553  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1713  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II/ribonuclease R  49.85 
 
 		 782 aa  661    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.631532  normal  0.56941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7411  ribonuclease R  50.99 
 
 		 762 aa  698    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00900108  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2418  exoribonuclease R  48.89 
 
 		 783 aa  653    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0155442  normal  0.184337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2238  ribonuclease R  48.57 
 
 		 790 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37194  normal  0.0587886 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6672  ribonuclease R  50.84 
 
 		 762 aa  700    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.594925 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3034  ribonuclease R  49.03 
 
 		 781 aa  655    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0258557  normal  0.241672 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2438  ribonuclease R  50.31 
 
 		 790 aa  666    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.404679  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3864  ribonuclease R  50.38 
 
 		 776 aa  679    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3536  ribonuclease R  49.03 
 
 		 781 aa  666    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.589347  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2380  ribonuclease R  50.31 
 
 		 788 aa  643    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.736062 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1755  ribonuclease R  52.91 
 
 		 792 aa  722    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1353  ribonuclease R  52.77 
 
 		 765 aa  742    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25106  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0570  ribonuclease R  52.96 
 
 		 783 aa  751    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.864395  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4734  ribonuclease R  49.11 
 
 		 792 aa  666    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1294  ribonuclease R  51.63 
 
 		 790 aa  713    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501938  decreased coverage  0.00167989 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2657  ribonuclease R  50.15 
 
 		 788 aa  640    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0931  ribonuclease R  50.81 
 
 		 789 aa  697    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3572  ribonuclease R  48.75 
 
 		 773 aa  635    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.923698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1386  ribonuclease R  51.04 
 
 		 790 aa  701    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.365928 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3846  ribonuclease R  50 
 
 		 787 aa  619  1e-176  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0372876 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2830  ribonuclease R  45.72 
 
 		 782 aa  570  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.120928  normal  0.835648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1502  ribonuclease R  45.34 
 
 		 777 aa  570  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.68898  normal  0.0835717 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0356  ribonuclease R  45.65 
 
 		 778 aa  564  1.0000000000000001e-159  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1281  ribonuclease R  45.48 
 
 		 754 aa  555  1e-157  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.106141 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0037  ribonuclease R  44.14 
 
 		 745 aa  552  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2994  RNAse R  44.38 
 
 		 761 aa  549  1e-155  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3203  RNAse R  43.4 
 
 		 842 aa  547  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.62845  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2853  ribonuclease R  43.48 
 
 		 754 aa  534  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1126  RNAse R  43.52 
 
 		 752 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2787  ribonuclease R  43.52 
 
 		 752 aa  529  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0015  ribonuclease R  45.16 
 
 		 751 aa  526  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.587853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0050  ribonuclease R  42.92 
 
 		 750 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1646  ribonuclease R  38.48 
 
 		 781 aa  478  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.353487 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4048  RNAse R  39.7 
 
 		 769 aa  468  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1948  ribonuclease R  39.27 
 
 		 759 aa  452  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45898  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1231  ribonuclease R  38.32 
 
 		 766 aa  434  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.982448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002268  ribonuclease R  36.35 
 
 		 834 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  36.44 
 
 		 758 aa  365  1e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00085  ribonuclease R  36.31 
 
 		 830 aa  365  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1953  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  36.3 
 
 		 735 aa  364  4e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223171  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4765  exoribonuclease R  37.52 
 
 		 812 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.57696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0151  exoribonuclease II (ribonuclease R)  37.54 
 
 		 804 aa  362  2e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4636  exoribonuclease R  37.52 
 
 		 812 aa  361  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4646  exoribonuclease R  37.52 
 
 		 812 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4729  exoribonuclease R  37.52 
 
 		 812 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4786  exoribonuclease R  37.52 
 
 		 812 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.717168 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  37.03 
 
 		 749 aa  359  9.999999999999999e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  37.03 
 
 		 736 aa  358  9.999999999999999e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0749  ribonuclease R  37.18 
 
 		 807 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000988982  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04046  exoribonuclease R, RNase R  37.87 
 
 		 813 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.765624  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3814  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  37.87 
 
 		 813 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04008  hypothetical protein  37.87 
 
 		 813 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.863156  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3264  RNAse R  37.18 
 
 		 808 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000483036  decreased coverage  0.00000524837 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5695  exoribonuclease R  37.87 
 
 		 813 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3834  exoribonuclease R  37.87 
 
 		 813 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000264601 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4422  exoribonuclease R  37.87 
 
 		 813 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4650  exoribonuclease R  37.87 
 
 		 813 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.526461 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4738  exoribonuclease R  37.87 
 
 		 813 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.604978  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4710  exoribonuclease R  37.87 
 
 		 813 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0683  RNAse R  37.18 
 
 		 808 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0668572  hitchhiker  0.000463961 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4217  ribonuclease R  36.69 
 
 		 826 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997198  hitchhiker  0.000734426 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2972  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  36.82 
 
 		 805 aa  357  5e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0511  ribonuclease R  37.59 
 
 		 817 aa  356  8.999999999999999e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3935  ribonuclease R  36.94 
 
 		 808 aa  355  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0737  ribonuclease R  37.01 
 
 		 807 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.034125  hitchhiker  0.00132247 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0707  ribonuclease R  37.01 
 
 		 807 aa  356  1e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.419789  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0728  ribonuclease R  37.01 
 
 		 807 aa  356  1e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.14505  hitchhiker  0.000000257568 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3647  ribonuclease R  37.01 
 
 		 807 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0028274  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0697  RNAse R  37.18 
 
 		 809 aa  353  4e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00112836  hitchhiker  0.000328486 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0752  exoribonuclease II  37.18 
 
 		 833 aa  353  5e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000040627  hitchhiker  0.00244525 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  36.12 
 
 		 857 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  39.31 
 
 		 722 aa  353  8e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0994  ribonuclease R  38.16 
 
 		 810 aa  353  8e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3355  ribonuclease R  37.5 
 
 		 829 aa  353  8e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0608  RNAse R  35.58 
 
 		 758 aa  352  1e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  36.12 
 
 		 857 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  37.23 
 
 		 937 aa  352  1e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3417  ribonuclease R  34.95 
 
 		 834 aa  351  2e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.629084 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  36.12 
 
 		 857 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2177  ribonuclease R  36.74 
 
 		 821 aa  351  2e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000855619  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0362  exoribonuclease R  36.32 
 
 		 824 aa  352  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569814 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3590  ribonuclease R  36.38 
 
 		 819 aa  351  3e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0101048  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  34.48 
 
 		 801 aa  351  3e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3289  ribonuclease R  36.69 
 
 		 824 aa  350  3e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.457006  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0532  RNAse R  36.72 
 
 		 876 aa  350  5e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373854 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1938  ribonuclease R  34.38 
 
 		 829 aa  350  5e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.751615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  36.09 
 
 		 859 aa  350  6e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  37.46 
 
 		 828 aa  348  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  35.43 
 
 		 818 aa  348  2e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1565  ribonuclease R  36.03 
 
 		 746 aa  348  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000702631 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1891  ribonuclease R  36.03 
 
 		 746 aa  348  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3378  ribonuclease R  34.13 
 
 		 1055 aa  346  6e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0579  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  36.46 
 
 		 877 aa  347  6e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4935  ribonuclease R  36.29 
 
 		 877 aa  346  8.999999999999999e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1626  ribonuclease R  34.45 
 
 		 840 aa  345  1e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0588631  normal  0.0102881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>