More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2475 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2475  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 358 aa  710    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000149322  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1927  uroporphyrinogen decarboxylase  56.45 
 
 		 353 aa  378  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.849644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2534  uroporphyrinogen decarboxylase  52.17 
 
 		 349 aa  339  4e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1271  uroporphyrinogen decarboxylase  55.49 
 
 		 360 aa  338  7e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4014  uroporphyrinogen decarboxylase  50.14 
 
 		 348 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.0629126 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2843  uroporphyrinogen decarboxylase  54.71 
 
 		 342 aa  335  7e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2833  uroporphyrinogen decarboxylase  55.49 
 
 		 344 aa  334  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543255 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3616  uroporphyrinogen decarboxylase  50.88 
 
 		 348 aa  333  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00257093  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3769  uroporphyrinogen decarboxylase  49.13 
 
 		 348 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477463  normal  0.0130148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1696  uroporphyrinogen decarboxylase  50.15 
 
 		 338 aa  328  7e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146484  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1257  uroporphyrinogen decarboxylase  52.8 
 
 		 355 aa  325  6e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3476  uroporphyrinogen decarboxylase  51.18 
 
 		 342 aa  325  7e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3629  uroporphyrinogen decarboxylase  52.94 
 
 		 342 aa  325  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2192  uroporphyrinogen decarboxylase  49.27 
 
 		 343 aa  322  6e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  51.04 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.024361 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0118  uroporphyrinogen decarboxylase  50.89 
 
 		 341 aa  319  3.9999999999999996e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  48.53 
 
 		 343 aa  319  3.9999999999999996e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2936  uroporphyrinogen decarboxylase  51.04 
 
 		 350 aa  318  7.999999999999999e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0854  uroporphyrinogen decarboxylase  50 
 
 		 341 aa  317  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.913792  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1039  uroporphyrinogen decarboxylase  53.98 
 
 		 357 aa  316  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0550  uroporphyrinogen decarboxylase  48.97 
 
 		 343 aa  316  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1258  uroporphyrinogen decarboxylase  49.69 
 
 		 325 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0175405 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3569  uroporphyrinogen decarboxylase  51.78 
 
 		 350 aa  315  7e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668232  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2066  uroporphyrinogen decarboxylase  49.41 
 
 		 341 aa  314  9.999999999999999e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.502432  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3208  uroporphyrinogen decarboxylase  49.41 
 
 		 343 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1494  uroporphyrinogen decarboxylase  51.71 
 
 		 361 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0243578 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2335  uroporphyrinogen decarboxylase  49.26 
 
 		 343 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.540822  normal  0.254547 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2528  uroporphyrinogen decarboxylase  49.56 
 
 		 345 aa  312  5.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0977  uroporphyrinogen decarboxylase  51.72 
 
 		 325 aa  311  7.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.942428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0680  uroporphyrinogen decarboxylase  49.26 
 
 		 343 aa  311  9e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1986  uroporphyrinogen decarboxylase  49.11 
 
 		 341 aa  311  1e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2973  uroporphyrinogen decarboxylase  50.29 
 
 		 345 aa  308  1.0000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4298  uroporphyrinogen decarboxylase  49.2 
 
 		 392 aa  305  7e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0372721 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3934  uroporphyrinogen decarboxylase  48.8 
 
 		 340 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.569662 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1772  uroporphyrinogen decarboxylase  50.86 
 
 		 360 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.767605  normal  0.203092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4260  uroporphyrinogen decarboxylase  48.2 
 
 		 335 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.962102  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2705  uroporphyrinogen decarboxylase  46.61 
 
 		 344 aa  295  6e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4393  uroporphyrinogen decarboxylase  46.09 
 
 		 346 aa  292  6e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1494  uroporphyrinogen decarboxylase  47.77 
 
 		 370 aa  291  9e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.775015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5016  uroporphyrinogen decarboxylase  47.45 
 
 		 346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.739471  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  42.94 
 
 		 352 aa  271  2e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  42.65 
 
 		 353 aa  270  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1028  uroporphyrinogen decarboxylase  44.72 
 
 		 338 aa  268  1e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0030  uroporphyrinogen decarboxylase  42.41 
 
 		 334 aa  266  4e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.210193  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0010  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  41.93 
 
 		 334 aa  265  8e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  45.43 
 
 		 352 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  45.64 
 
 		 357 aa  263  3e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0705  uroporphyrinogen decarboxylase  46.11 
 
 		 365 aa  261  1e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  43.9 
 
 		 354 aa  261  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  45.06 
 
 		 353 aa  258  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  44.97 
 
 		 354 aa  255  9e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0032  uroporphyrinogen decarboxylase  43.44 
 
 		 355 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.590696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  43.9 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  44.44 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  44.85 
 
 		 356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  43.75 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  43.4 
 
 		 355 aa  253  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  45.24 
 
 		 354 aa  253  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0468  uroporphyrinogen decarboxylase  43.77 
 
 		 354 aa  253  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.551624  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  41.36 
 
 		 364 aa  253  3e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  43.02 
 
 		 355 aa  253  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  43.6 
 
 		 354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  43.77 
 
 		 359 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0387  uroporphyrinogen decarboxylase  44.31 
 
 		 354 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  45.06 
 
 		 380 aa  252  7e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2779  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  45.61 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.313146 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3303  uroporphyrinogen decarboxylase  43.65 
 
 		 364 aa  250  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0163615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  43.3 
 
 		 354 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3920  uroporphyrinogen decarboxylase  43.11 
 
 		 354 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0044  uroporphyrinogen decarboxylase  44.48 
 
 		 366 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  43.31 
 
 		 354 aa  249  4e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  43.73 
 
 		 350 aa  249  4e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3524  uroporphyrinogen decarboxylase  44.08 
 
 		 356 aa  249  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00974086 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  44.35 
 
 		 355 aa  249  5e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  43.77 
 
 		 355 aa  249  5e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  43.02 
 
 		 354 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  43.02 
 
 		 354 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  42.86 
 
 		 354 aa  249  6e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3406  uroporphyrinogen decarboxylase  43.57 
 
 		 354 aa  249  7e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0482  uroporphyrinogen decarboxylase  42.98 
 
 		 354 aa  249  7e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  42.94 
 
 		 354 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  42.82 
 
 		 354 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118509 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  43.36 
 
 		 351 aa  248  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4042  uroporphyrinogen decarboxylase  42.82 
 
 		 354 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.984022 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  43.4 
 
 		 402 aa  247  2e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  43.4 
 
 		 361 aa  247  2e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0413  uroporphyrinogen decarboxylase  42.82 
 
 		 354 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0439  uroporphyrinogen decarboxylase  43.27 
 
 		 354 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3590  uroporphyrinogen decarboxylase  43.27 
 
 		 354 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  42.33 
 
 		 355 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  43.27 
 
 		 354 aa  248  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  43.27 
 
 		 354 aa  247  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  42.17 
 
 		 354 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2666  uroporphyrinogen decarboxylase  43.6 
 
 		 354 aa  247  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212078  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  42.78 
 
 		 355 aa  246  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3498  uroporphyrinogen decarboxylase  42.02 
 
 		 367 aa  246  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  43.06 
 
 		 354 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  45.05 
 
 		 354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  41.76 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  45.05 
 
 		 354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>