More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3846 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 343 aa  701    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2705  uroporphyrinogen decarboxylase  73.47 
 
 		 344 aa  534  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2528  uroporphyrinogen decarboxylase  71.35 
 
 		 345 aa  522  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3629  uroporphyrinogen decarboxylase  72.06 
 
 		 342 aa  521  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0550  uroporphyrinogen decarboxylase  71.68 
 
 		 343 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2335  uroporphyrinogen decarboxylase  71.68 
 
 		 343 aa  512  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.540822  normal  0.254547 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0680  uroporphyrinogen decarboxylase  71.39 
 
 		 343 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1257  uroporphyrinogen decarboxylase  56.01 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2534  uroporphyrinogen decarboxylase  51.78 
 
 		 349 aa  368  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3208  uroporphyrinogen decarboxylase  55.03 
 
 		 343 aa  358  8e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4393  uroporphyrinogen decarboxylase  53.8 
 
 		 346 aa  355  5e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3934  uroporphyrinogen decarboxylase  53.27 
 
 		 340 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.569662 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3476  uroporphyrinogen decarboxylase  52.49 
 
 		 342 aa  351  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0854  uroporphyrinogen decarboxylase  52.06 
 
 		 341 aa  350  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.913792  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4260  uroporphyrinogen decarboxylase  52.68 
 
 		 335 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.962102  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2843  uroporphyrinogen decarboxylase  51.03 
 
 		 342 aa  346  4e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_004310  BR2066  uroporphyrinogen decarboxylase  50.29 
 
 		 341 aa  342  5e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.502432  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1986  uroporphyrinogen decarboxylase  50 
 
 		 341 aa  338  7e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  49.56 
 
 		 348 aa  336  3.9999999999999995e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.024361 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3616  uroporphyrinogen decarboxylase  48.53 
 
 		 348 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00257093  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0118  uroporphyrinogen decarboxylase  48.96 
 
 		 341 aa  333  2e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2973  uroporphyrinogen decarboxylase  51.03 
 
 		 345 aa  331  1e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2192  uroporphyrinogen decarboxylase  47.35 
 
 		 343 aa  330  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2833  uroporphyrinogen decarboxylase  48.69 
 
 		 344 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543255 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1696  uroporphyrinogen decarboxylase  47.46 
 
 		 338 aa  328  9e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146484  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3769  uroporphyrinogen decarboxylase  46.61 
 
 		 348 aa  325  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477463  normal  0.0130148 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3569  uroporphyrinogen decarboxylase  48.97 
 
 		 350 aa  322  8e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4014  uroporphyrinogen decarboxylase  46.31 
 
 		 348 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.0629126 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2475  uroporphyrinogen decarboxylase  48.53 
 
 		 358 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000149322  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2936  uroporphyrinogen decarboxylase  46.75 
 
 		 350 aa  317  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1271  uroporphyrinogen decarboxylase  48.15 
 
 		 360 aa  315  8e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1258  uroporphyrinogen decarboxylase  46.58 
 
 		 325 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0175405 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4298  uroporphyrinogen decarboxylase  45.41 
 
 		 392 aa  311  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0372721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1494  uroporphyrinogen decarboxylase  47.4 
 
 		 361 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0243578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1039  uroporphyrinogen decarboxylase  46.86 
 
 		 357 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1772  uroporphyrinogen decarboxylase  48.27 
 
 		 360 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.767605  normal  0.203092 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1927  uroporphyrinogen decarboxylase  46.26 
 
 		 353 aa  301  9e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.849644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0977  uroporphyrinogen decarboxylase  46.25 
 
 		 325 aa  295  6e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.942428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1494  uroporphyrinogen decarboxylase  46.91 
 
 		 370 aa  290  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.775015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  42.52 
 
 		 352 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  40.94 
 
 		 353 aa  281  8.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  42.82 
 
 		 355 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  42.65 
 
 		 354 aa  279  5e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  40.06 
 
 		 352 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5016  uroporphyrinogen decarboxylase  44.48 
 
 		 346 aa  276  5e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.739471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  40.88 
 
 		 354 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1028  uroporphyrinogen decarboxylase  42.9 
 
 		 338 aa  274  1.0000000000000001e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  41.57 
 
 		 354 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  40.59 
 
 		 354 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  40.59 
 
 		 354 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  41.28 
 
 		 354 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  41.91 
 
 		 354 aa  271  9e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  40.59 
 
 		 354 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  41.76 
 
 		 355 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  41.47 
 
 		 355 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1599  uroporphyrinogen decarboxylase  42.53 
 
 		 368 aa  270  2e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00586302  hitchhiker  0.0000224711 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  41.3 
 
 		 351 aa  268  7e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  41.35 
 
 		 355 aa  268  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  40.41 
 
 		 353 aa  267  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  41.47 
 
 		 355 aa  266  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  41.09 
 
 		 354 aa  266  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  41.52 
 
 		 354 aa  266  5e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  40.23 
 
 		 354 aa  261  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1681  uroporphyrinogen decarboxylase  39.44 
 
 		 378 aa  261  2e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  40.18 
 
 		 355 aa  260  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1502  uroporphyrinogen decarboxylase  39.44 
 
 		 378 aa  260  3e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  39.94 
 
 		 354 aa  259  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  39.77 
 
 		 357 aa  259  4e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  40.47 
 
 		 380 aa  258  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0030  uroporphyrinogen decarboxylase  40.06 
 
 		 334 aa  258  1e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.210193  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0010  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  40.55 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  42.23 
 
 		 354 aa  257  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  42.23 
 
 		 354 aa  257  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  39.94 
 
 		 354 aa  256  4e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0468  uroporphyrinogen decarboxylase  39.66 
 
 		 354 aa  256  4e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.551624  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  39.94 
 
 		 354 aa  256  5e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  39.59 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3920  uroporphyrinogen decarboxylase  40.4 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3039  uroporphyrinogen decarboxylase  40.92 
 
 		 360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1013  uroporphyrinogen decarboxylase  38.65 
 
 		 340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  40.4 
 
 		 354 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118509 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0413  uroporphyrinogen decarboxylase  40.4 
 
 		 354 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4042  uroporphyrinogen decarboxylase  40.4 
 
 		 354 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.984022 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1268  uroporphyrinogen decarboxylase  38.65 
 
 		 340 aa  253  4.0000000000000004e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  39.88 
 
 		 354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0124917 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  39.3 
 
 		 356 aa  252  5.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  39.37 
 
 		 354 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0387  uroporphyrinogen decarboxylase  39.66 
 
 		 354 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03874  uroporphyrinogen decarboxylase  38.53 
 
 		 354 aa  252  7e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  38.53 
 
 		 354 aa  252  7e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4488  uroporphyrinogen decarboxylase  38.53 
 
 		 354 aa  252  7e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03827  hypothetical protein  38.53 
 
 		 354 aa  252  7e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4540  uroporphyrinogen decarboxylase  38.53 
 
 		 354 aa  252  7e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4445  uroporphyrinogen decarboxylase  38.53 
 
 		 354 aa  252  7e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531857 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4231  uroporphyrinogen decarboxylase  38.53 
 
 		 354 aa  252  7e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4028  uroporphyrinogen decarboxylase  38.53 
 
 		 354 aa  252  7e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5466  uroporphyrinogen decarboxylase  38.53 
 
 		 354 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4498  uroporphyrinogen decarboxylase  39.12 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0575835 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2779  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  41.47 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.313146 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1118  uroporphyrinogen decarboxylase  39.36 
 
 		 366 aa  251  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>