More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0118 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0118  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 341 aa  688    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2833  uroporphyrinogen decarboxylase  67.46 
 
 		 344 aa  451  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543255 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2843  uroporphyrinogen decarboxylase  64.99 
 
 		 342 aa  449  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2534  uroporphyrinogen decarboxylase  53.24 
 
 		 349 aa  367  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1257  uroporphyrinogen decarboxylase  53.55 
 
 		 355 aa  357  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3629  uroporphyrinogen decarboxylase  52.52 
 
 		 342 aa  352  5e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2335  uroporphyrinogen decarboxylase  51.01 
 
 		 343 aa  348  9e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.540822  normal  0.254547 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0550  uroporphyrinogen decarboxylase  50.29 
 
 		 343 aa  345  7e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0680  uroporphyrinogen decarboxylase  51.01 
 
 		 343 aa  345  7e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1696  uroporphyrinogen decarboxylase  49.11 
 
 		 338 aa  342  4e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146484  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3769  uroporphyrinogen decarboxylase  49.26 
 
 		 348 aa  341  9e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477463  normal  0.0130148 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4014  uroporphyrinogen decarboxylase  49.12 
 
 		 348 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.0629126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2192  uroporphyrinogen decarboxylase  49.42 
 
 		 343 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2528  uroporphyrinogen decarboxylase  50.89 
 
 		 345 aa  339  4e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  50 
 
 		 348 aa  337  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.024361 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2936  uroporphyrinogen decarboxylase  50.44 
 
 		 350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3476  uroporphyrinogen decarboxylase  49.85 
 
 		 342 aa  334  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0977  uroporphyrinogen decarboxylase  52.01 
 
 		 325 aa  333  2e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.942428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  48.96 
 
 		 343 aa  333  2e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3616  uroporphyrinogen decarboxylase  49.7 
 
 		 348 aa  333  4e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00257093  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2973  uroporphyrinogen decarboxylase  51.03 
 
 		 345 aa  330  1e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2066  uroporphyrinogen decarboxylase  51.03 
 
 		 341 aa  329  5.0000000000000004e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.502432  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0854  uroporphyrinogen decarboxylase  49.26 
 
 		 341 aa  328  7e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.913792  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1258  uroporphyrinogen decarboxylase  49.54 
 
 		 325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0175405 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1986  uroporphyrinogen decarboxylase  50.74 
 
 		 341 aa  325  5e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2705  uroporphyrinogen decarboxylase  47.32 
 
 		 344 aa  322  6e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2475  uroporphyrinogen decarboxylase  50.89 
 
 		 358 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000149322  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3569  uroporphyrinogen decarboxylase  48.07 
 
 		 350 aa  318  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1927  uroporphyrinogen decarboxylase  50 
 
 		 353 aa  315  9e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.849644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4260  uroporphyrinogen decarboxylase  47.46 
 
 		 335 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.962102  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3934  uroporphyrinogen decarboxylase  47.16 
 
 		 340 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.569662 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3208  uroporphyrinogen decarboxylase  46.57 
 
 		 343 aa  309  5e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4393  uroporphyrinogen decarboxylase  45.86 
 
 		 346 aa  306  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1271  uroporphyrinogen decarboxylase  48.29 
 
 		 360 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4298  uroporphyrinogen decarboxylase  46.2 
 
 		 392 aa  290  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0372721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1039  uroporphyrinogen decarboxylase  48.14 
 
 		 357 aa  290  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1028  uroporphyrinogen decarboxylase  43.21 
 
 		 338 aa  284  2.0000000000000002e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1494  uroporphyrinogen decarboxylase  45.24 
 
 		 361 aa  277  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0243578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1772  uroporphyrinogen decarboxylase  45.24 
 
 		 360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.767605  normal  0.203092 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5016  uroporphyrinogen decarboxylase  43.28 
 
 		 346 aa  269  5e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.739471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0010  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  39 
 
 		 334 aa  266  4e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0030  uroporphyrinogen decarboxylase  38.24 
 
 		 334 aa  265  7e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.210193  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  44.02 
 
 		 352 aa  263  4e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1494  uroporphyrinogen decarboxylase  44.26 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.775015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  40.48 
 
 		 364 aa  256  5e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1599  uroporphyrinogen decarboxylase  42.24 
 
 		 368 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00586302  hitchhiker  0.0000224711 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  39.76 
 
 		 352 aa  253  5.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2666  uroporphyrinogen decarboxylase  40.94 
 
 		 354 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212078  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4264  uroporphyrinogen decarboxylase  40.94 
 
 		 369 aa  252  7e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0634  uroporphyrinogen decarboxylase  38.48 
 
 		 343 aa  252  8.000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000186369  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  38.3 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3524  uroporphyrinogen decarboxylase  39.77 
 
 		 356 aa  250  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00974086 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  39.58 
 
 		 353 aa  249  4e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  39.47 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0363  uroporphyrinogen decarboxylase  39.33 
 
 		 369 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178148  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0134  uroporphyrinogen decarboxylase  42.01 
 
 		 372 aa  247  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106114  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0821  uroporphyrinogen decarboxylase  39.82 
 
 		 369 aa  246  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00198157  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  41.11 
 
 		 356 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  41.38 
 
 		 354 aa  246  6e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  41.38 
 
 		 354 aa  246  6e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0439  uroporphyrinogen decarboxylase  40.12 
 
 		 354 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3590  uroporphyrinogen decarboxylase  40.12 
 
 		 354 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  40.12 
 
 		 354 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3498  uroporphyrinogen decarboxylase  41.48 
 
 		 367 aa  245  8e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0317  uroporphyrinogen decarboxylase  38.81 
 
 		 340 aa  245  8e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0112  uroporphyrinogen decarboxylase  41.09 
 
 		 392 aa  245  9e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3406  uroporphyrinogen decarboxylase  39.65 
 
 		 354 aa  245  9e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1268  uroporphyrinogen decarboxylase  37.54 
 
 		 340 aa  245  9.999999999999999e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1934  uroporphyrinogen decarboxylase  39.02 
 
 		 365 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0387  uroporphyrinogen decarboxylase  38.95 
 
 		 354 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6502  uroporphyrinogen decarboxylase  40.18 
 
 		 341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.607973 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  39.36 
 
 		 354 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0032  uroporphyrinogen decarboxylase  40.7 
 
 		 355 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.590696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  39.77 
 
 		 354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118509 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  39.05 
 
 		 354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4042  uroporphyrinogen decarboxylase  39.77 
 
 		 354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.984022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0413  uroporphyrinogen decarboxylase  39.77 
 
 		 354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3920  uroporphyrinogen decarboxylase  39.77 
 
 		 354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3174  uroporphyrinogen decarboxylase  40.91 
 
 		 367 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  38.12 
 
 		 355 aa  243  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  38.71 
 
 		 354 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3304  uroporphyrinogen decarboxylase  40.8 
 
 		 364 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0968  uroporphyrinogen decarboxylase  38.56 
 
 		 324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0529  uroporphyrinogen decarboxylase  40.24 
 
 		 340 aa  243  3.9999999999999997e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  38.19 
 
 		 359 aa  243  5e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3963  uroporphyrinogen decarboxylase  40.8 
 
 		 364 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3349  uroporphyrinogen decarboxylase  40.8 
 
 		 364 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3022  uroporphyrinogen decarboxylase  40.8 
 
 		 364 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2944  uroporphyrinogen decarboxylase  41.83 
 
 		 392 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0032555  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0111  uroporphyrinogen decarboxylase  41.83 
 
 		 392 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0979299  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4036  uroporphyrinogen decarboxylase  40.8 
 
 		 364 aa  242  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617261  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1580  uroporphyrinogen decarboxylase  40.8 
 
 		 364 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0170  uroporphyrinogen decarboxylase  40.8 
 
 		 405 aa  242  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3292  uroporphyrinogen decarboxylase  40.8 
 
 		 392 aa  242  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.136246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  38.42 
 
 		 354 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2962  uroporphyrinogen decarboxylase  40.8 
 
 		 405 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0101  uroporphyrinogen decarboxylase  41.55 
 
 		 392 aa  241  9e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  37.9 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0110  uroporphyrinogen decarboxylase  41.55 
 
 		 375 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.760433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  39.3 
 
 		 354 aa  241  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>