More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2973 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2973  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 345 aa  690    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5016  uroporphyrinogen decarboxylase  54.55 
 
 		 346 aa  360  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.739471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2192  uroporphyrinogen decarboxylase  52.37 
 
 		 343 aa  352  7e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2936  uroporphyrinogen decarboxylase  50.88 
 
 		 350 aa  342  7e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2833  uroporphyrinogen decarboxylase  52.82 
 
 		 344 aa  339  4e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543255 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0854  uroporphyrinogen decarboxylase  51.04 
 
 		 341 aa  339  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.913792  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2843  uroporphyrinogen decarboxylase  52.49 
 
 		 342 aa  338  8e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_004310  BR2066  uroporphyrinogen decarboxylase  50.74 
 
 		 341 aa  336  2.9999999999999997e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.502432  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1696  uroporphyrinogen decarboxylase  50.15 
 
 		 338 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146484  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2534  uroporphyrinogen decarboxylase  50.74 
 
 		 349 aa  335  5e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3769  uroporphyrinogen decarboxylase  49.42 
 
 		 348 aa  335  9e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477463  normal  0.0130148 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1986  uroporphyrinogen decarboxylase  50.45 
 
 		 341 aa  333  3e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4014  uroporphyrinogen decarboxylase  49.71 
 
 		 348 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.0629126 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  51.03 
 
 		 343 aa  331  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0118  uroporphyrinogen decarboxylase  51.03 
 
 		 341 aa  330  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1258  uroporphyrinogen decarboxylase  51.86 
 
 		 325 aa  328  7e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0175405 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3476  uroporphyrinogen decarboxylase  49.12 
 
 		 342 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3616  uroporphyrinogen decarboxylase  49.85 
 
 		 348 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00257093  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0977  uroporphyrinogen decarboxylase  51.41 
 
 		 325 aa  317  1e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.942428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4393  uroporphyrinogen decarboxylase  47.49 
 
 		 346 aa  317  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3208  uroporphyrinogen decarboxylase  47.65 
 
 		 343 aa  316  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1772  uroporphyrinogen decarboxylase  48.85 
 
 		 360 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.767605  normal  0.203092 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2705  uroporphyrinogen decarboxylase  46.9 
 
 		 344 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1257  uroporphyrinogen decarboxylase  48.82 
 
 		 355 aa  313  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3934  uroporphyrinogen decarboxylase  47.75 
 
 		 340 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.569662 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2528  uroporphyrinogen decarboxylase  47.35 
 
 		 345 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0680  uroporphyrinogen decarboxylase  48.09 
 
 		 343 aa  309  4e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2335  uroporphyrinogen decarboxylase  48.09 
 
 		 343 aa  309  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.540822  normal  0.254547 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2475  uroporphyrinogen decarboxylase  50.29 
 
 		 358 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000149322  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4260  uroporphyrinogen decarboxylase  46.85 
 
 		 335 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.962102  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0550  uroporphyrinogen decarboxylase  47.8 
 
 		 343 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3629  uroporphyrinogen decarboxylase  47.8 
 
 		 342 aa  306  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3569  uroporphyrinogen decarboxylase  46.9 
 
 		 350 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1271  uroporphyrinogen decarboxylase  48.85 
 
 		 360 aa  301  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1039  uroporphyrinogen decarboxylase  48.56 
 
 		 357 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1494  uroporphyrinogen decarboxylase  48.12 
 
 		 361 aa  298  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0243578 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1927  uroporphyrinogen decarboxylase  46.96 
 
 		 353 aa  295  7e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.849644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4298  uroporphyrinogen decarboxylase  47.44 
 
 		 392 aa  294  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0372721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1494  uroporphyrinogen decarboxylase  47.21 
 
 		 370 aa  293  3e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.775015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  45.45 
 
 		 348 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.024361 
 
 
-
 
NC_002978  WD1028  uroporphyrinogen decarboxylase  43.48 
 
 		 338 aa  274  1.0000000000000001e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0030  uroporphyrinogen decarboxylase  39.57 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.210193  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  40.17 
 
 		 355 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0010  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  37.12 
 
 		 334 aa  246  3e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  39.6 
 
 		 355 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  39.32 
 
 		 355 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  39.71 
 
 		 354 aa  243  5e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  39.43 
 
 		 354 aa  242  7e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  38.18 
 
 		 355 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  39.43 
 
 		 354 aa  238  8e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  37.64 
 
 		 353 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0482  uroporphyrinogen decarboxylase  39.14 
 
 		 354 aa  237  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  37.43 
 
 		 354 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  40.72 
 
 		 354 aa  236  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  37.75 
 
 		 356 aa  236  6e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  37.43 
 
 		 354 aa  235  7e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  37.36 
 
 		 352 aa  235  7e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0968  uroporphyrinogen decarboxylase  38.82 
 
 		 324 aa  235  1.0000000000000001e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3406  uroporphyrinogen decarboxylase  39.14 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  39.14 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4042  uroporphyrinogen decarboxylase  39.14 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.984022 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  39.14 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118509 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0468  uroporphyrinogen decarboxylase  38.86 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.551624  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  37.43 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0413  uroporphyrinogen decarboxylase  39.14 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  37.61 
 
 		 355 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  37.14 
 
 		 354 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  37.43 
 
 		 354 aa  232  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0439  uroporphyrinogen decarboxylase  39.14 
 
 		 354 aa  232  6e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3590  uroporphyrinogen decarboxylase  39.14 
 
 		 354 aa  232  6e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  39.14 
 
 		 354 aa  232  6e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3920  uroporphyrinogen decarboxylase  38.86 
 
 		 354 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  37.14 
 
 		 354 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  38.46 
 
 		 354 aa  232  8.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  38.86 
 
 		 357 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1013  uroporphyrinogen decarboxylase  37.42 
 
 		 340 aa  230  3e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3849  uroporphyrinogen decarboxylase  39.35 
 
 		 355 aa  229  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0459  uroporphyrinogen decarboxylase  39.35 
 
 		 355 aa  228  8e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000960348 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0351  uroporphyrinogen decarboxylase  39.35 
 
 		 355 aa  228  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.777116  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  37.61 
 
 		 353 aa  228  9e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  39.42 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  41.67 
 
 		 343 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0387  uroporphyrinogen decarboxylase  38.29 
 
 		 354 aa  228  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  38.51 
 
 		 354 aa  226  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  38.26 
 
 		 354 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  36.47 
 
 		 355 aa  225  7e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  37.83 
 
 		 350 aa  224  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1268  uroporphyrinogen decarboxylase  35.89 
 
 		 340 aa  225  1e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  39.23 
 
 		 340 aa  224  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  38.46 
 
 		 354 aa  225  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1540  uroporphyrinogen decarboxylase  38.51 
 
 		 354 aa  223  3e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0588582  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  38.76 
 
 		 354 aa  223  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  37.25 
 
 		 364 aa  223  4e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3713  uroporphyrinogen decarboxylase  39.05 
 
 		 360 aa  223  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  39.1 
 
 		 354 aa  223  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  35.71 
 
 		 351 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3867  uroporphyrinogen decarboxylase  39.35 
 
 		 357 aa  222  6e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  36.29 
 
 		 351 aa  222  6e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3039  uroporphyrinogen decarboxylase  38.64 
 
 		 360 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  37.14 
 
 		 354 aa  221  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0124917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>