More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR2066 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR2066  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 341 aa  691    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.502432  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0854  uroporphyrinogen decarboxylase  95.89 
 
 		 341 aa  672    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.913792  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1986  uroporphyrinogen decarboxylase  99.71 
 
 		 341 aa  689    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3476  uroporphyrinogen decarboxylase  69.23 
 
 		 342 aa  492  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3934  uroporphyrinogen decarboxylase  70.45 
 
 		 340 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.569662 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4393  uroporphyrinogen decarboxylase  68.75 
 
 		 346 aa  482  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4260  uroporphyrinogen decarboxylase  70.06 
 
 		 335 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.962102  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3208  uroporphyrinogen decarboxylase  68.84 
 
 		 343 aa  478  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2936  uroporphyrinogen decarboxylase  58.63 
 
 		 350 aa  396  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2192  uroporphyrinogen decarboxylase  56.43 
 
 		 343 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3769  uroporphyrinogen decarboxylase  56.47 
 
 		 348 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477463  normal  0.0130148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1696  uroporphyrinogen decarboxylase  55.92 
 
 		 338 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146484  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2534  uroporphyrinogen decarboxylase  57.82 
 
 		 349 aa  389  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4014  uroporphyrinogen decarboxylase  54.97 
 
 		 348 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.0629126 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0977  uroporphyrinogen decarboxylase  58.88 
 
 		 325 aa  383  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.942428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1258  uroporphyrinogen decarboxylase  57.41 
 
 		 325 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0175405 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1271  uroporphyrinogen decarboxylase  56.16 
 
 		 360 aa  363  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3616  uroporphyrinogen decarboxylase  52.8 
 
 		 348 aa  363  2e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00257093  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3569  uroporphyrinogen decarboxylase  53.85 
 
 		 350 aa  362  7.0000000000000005e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  53.12 
 
 		 348 aa  361  1e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.024361 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2833  uroporphyrinogen decarboxylase  55.03 
 
 		 344 aa  360  2e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543255 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1494  uroporphyrinogen decarboxylase  54.73 
 
 		 361 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0243578 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1257  uroporphyrinogen decarboxylase  52.51 
 
 		 355 aa  353  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2528  uroporphyrinogen decarboxylase  52.79 
 
 		 345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2843  uroporphyrinogen decarboxylase  53.25 
 
 		 342 aa  350  3e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2705  uroporphyrinogen decarboxylase  51.76 
 
 		 344 aa  349  5e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4298  uroporphyrinogen decarboxylase  54.45 
 
 		 392 aa  348  6e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0372721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1039  uroporphyrinogen decarboxylase  56.03 
 
 		 357 aa  345  5e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3629  uroporphyrinogen decarboxylase  51.76 
 
 		 342 aa  345  5e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1772  uroporphyrinogen decarboxylase  54.15 
 
 		 360 aa  344  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.767605  normal  0.203092 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  50.29 
 
 		 343 aa  342  5e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2335  uroporphyrinogen decarboxylase  50.58 
 
 		 343 aa  339  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.540822  normal  0.254547 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2973  uroporphyrinogen decarboxylase  50.74 
 
 		 345 aa  336  2.9999999999999997e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0550  uroporphyrinogen decarboxylase  50 
 
 		 343 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0680  uroporphyrinogen decarboxylase  50.29 
 
 		 343 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1494  uroporphyrinogen decarboxylase  52.65 
 
 		 370 aa  332  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.775015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0118  uroporphyrinogen decarboxylase  51.03 
 
 		 341 aa  329  5.0000000000000004e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2475  uroporphyrinogen decarboxylase  49.41 
 
 		 358 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000149322  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5016  uroporphyrinogen decarboxylase  45.37 
 
 		 346 aa  291  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.739471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0483  uroporphyrinogen decarboxylase  46.15 
 
 		 340 aa  290  2e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.258594  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1258  uroporphyrinogen decarboxylase  45.85 
 
 		 340 aa  288  8e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1013  uroporphyrinogen decarboxylase  46.77 
 
 		 340 aa  287  2e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1379  uroporphyrinogen decarboxylase  45.85 
 
 		 340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1927  uroporphyrinogen decarboxylase  45.11 
 
 		 353 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.849644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0010  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  41.61 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1268  uroporphyrinogen decarboxylase  43.69 
 
 		 340 aa  280  2e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0030  uroporphyrinogen decarboxylase  41.12 
 
 		 334 aa  275  8e-73  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.210193  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1470  uroporphyrinogen decarboxylase  44.62 
 
 		 342 aa  273  3e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  44.05 
 
 		 352 aa  270  2e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1456  uroporphyrinogen decarboxylase  44 
 
 		 343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  44.05 
 
 		 353 aa  269  7e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0317  uroporphyrinogen decarboxylase  43.87 
 
 		 340 aa  267  2e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0529  uroporphyrinogen decarboxylase  44.62 
 
 		 340 aa  265  1e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0634  uroporphyrinogen decarboxylase  41.77 
 
 		 343 aa  260  3e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000186369  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1028  uroporphyrinogen decarboxylase  38.63 
 
 		 338 aa  256  5e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  43.6 
 
 		 354 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2666  uroporphyrinogen decarboxylase  44.71 
 
 		 354 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212078  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  44.02 
 
 		 350 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  42.82 
 
 		 354 aa  249  6e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  42.77 
 
 		 353 aa  247  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  41.81 
 
 		 357 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  41.21 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  42.6 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  43.11 
 
 		 352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  41.52 
 
 		 355 aa  243  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  40.58 
 
 		 354 aa  242  7.999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  42.44 
 
 		 354 aa  242  7.999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  41.74 
 
 		 380 aa  242  9e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0968  uroporphyrinogen decarboxylase  38.12 
 
 		 324 aa  240  2e-62  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  39.6 
 
 		 351 aa  240  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  42.11 
 
 		 351 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4036  uroporphyrinogen decarboxylase  41.67 
 
 		 364 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3963  uroporphyrinogen decarboxylase  41.67 
 
 		 364 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3304  uroporphyrinogen decarboxylase  41.67 
 
 		 364 aa  239  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  41.52 
 
 		 354 aa  239  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  41.81 
 
 		 354 aa  238  8e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  39.02 
 
 		 351 aa  238  1e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3022  uroporphyrinogen decarboxylase  41.67 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0170  uroporphyrinogen decarboxylase  41.67 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1580  uroporphyrinogen decarboxylase  41.67 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  43.86 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3349  uroporphyrinogen decarboxylase  41.67 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2962  uroporphyrinogen decarboxylase  41.67 
 
 		 405 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  41.81 
 
 		 354 aa  237  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  41.81 
 
 		 354 aa  236  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  41.81 
 
 		 354 aa  237  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0468  uroporphyrinogen decarboxylase  41.81 
 
 		 354 aa  237  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.551624  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2944  uroporphyrinogen decarboxylase  41.38 
 
 		 392 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0032555  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0111  uroporphyrinogen decarboxylase  41.38 
 
 		 392 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0979299  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  40.58 
 
 		 354 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1599  uroporphyrinogen decarboxylase  39.26 
 
 		 368 aa  236  4e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00586302  hitchhiker  0.0000224711 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  41.91 
 
 		 359 aa  236  4e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0821  uroporphyrinogen decarboxylase  41.64 
 
 		 369 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00198157  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  42.86 
 
 		 355 aa  235  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  42.86 
 
 		 355 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  41.16 
 
 		 354 aa  235  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0112  uroporphyrinogen decarboxylase  40.8 
 
 		 392 aa  235  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3292  uroporphyrinogen decarboxylase  41.09 
 
 		 392 aa  235  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.136246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  41.52 
 
 		 354 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  40.87 
 
 		 354 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>