More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4260 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3934  uroporphyrinogen decarboxylase  96.11 
 
 		 340 aa  655    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.569662 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4260  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 335 aa  679    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.962102  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3208  uroporphyrinogen decarboxylase  79.88 
 
 		 343 aa  540  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4393  uroporphyrinogen decarboxylase  75.9 
 
 		 346 aa  510  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0854  uroporphyrinogen decarboxylase  71.26 
 
 		 341 aa  488  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.913792  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2066  uroporphyrinogen decarboxylase  70.06 
 
 		 341 aa  481  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.502432  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1986  uroporphyrinogen decarboxylase  69.76 
 
 		 341 aa  477  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3476  uroporphyrinogen decarboxylase  63.77 
 
 		 342 aa  441  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1696  uroporphyrinogen decarboxylase  53.59 
 
 		 338 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146484  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2936  uroporphyrinogen decarboxylase  54.46 
 
 		 350 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2534  uroporphyrinogen decarboxylase  56.55 
 
 		 349 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3769  uroporphyrinogen decarboxylase  53.59 
 
 		 348 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477463  normal  0.0130148 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0977  uroporphyrinogen decarboxylase  56.07 
 
 		 325 aa  370  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.942428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4014  uroporphyrinogen decarboxylase  53.89 
 
 		 348 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.0629126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2192  uroporphyrinogen decarboxylase  54.35 
 
 		 343 aa  368  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3616  uroporphyrinogen decarboxylase  54.49 
 
 		 348 aa  364  1e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00257093  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1258  uroporphyrinogen decarboxylase  52.96 
 
 		 325 aa  358  6e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0175405 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1257  uroporphyrinogen decarboxylase  54.93 
 
 		 355 aa  357  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3629  uroporphyrinogen decarboxylase  55.06 
 
 		 342 aa  356  2.9999999999999997e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2705  uroporphyrinogen decarboxylase  54.01 
 
 		 344 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3569  uroporphyrinogen decarboxylase  53.89 
 
 		 350 aa  350  2e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1271  uroporphyrinogen decarboxylase  54.91 
 
 		 360 aa  348  5e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  52.68 
 
 		 343 aa  347  2e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  53.73 
 
 		 348 aa  344  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.024361 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2335  uroporphyrinogen decarboxylase  52.52 
 
 		 343 aa  341  9e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.540822  normal  0.254547 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1039  uroporphyrinogen decarboxylase  56.81 
 
 		 357 aa  341  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0550  uroporphyrinogen decarboxylase  52.52 
 
 		 343 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0680  uroporphyrinogen decarboxylase  52.52 
 
 		 343 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2528  uroporphyrinogen decarboxylase  51.48 
 
 		 345 aa  339  5e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1494  uroporphyrinogen decarboxylase  53.2 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0243578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4298  uroporphyrinogen decarboxylase  52.6 
 
 		 392 aa  334  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0372721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1772  uroporphyrinogen decarboxylase  54.07 
 
 		 360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.767605  normal  0.203092 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2833  uroporphyrinogen decarboxylase  51.19 
 
 		 344 aa  325  9e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543255 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2843  uroporphyrinogen decarboxylase  52.78 
 
 		 342 aa  320  9.999999999999999e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1494  uroporphyrinogen decarboxylase  52.82 
 
 		 370 aa  316  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.775015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0118  uroporphyrinogen decarboxylase  47.46 
 
 		 341 aa  313  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2973  uroporphyrinogen decarboxylase  46.85 
 
 		 345 aa  307  2.0000000000000002e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2475  uroporphyrinogen decarboxylase  48.2 
 
 		 358 aa  301  1e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000149322  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1927  uroporphyrinogen decarboxylase  45.64 
 
 		 353 aa  278  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.849644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5016  uroporphyrinogen decarboxylase  42.04 
 
 		 346 aa  266  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.739471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0010  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  38.14 
 
 		 334 aa  265  1e-69  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  43.24 
 
 		 354 aa  261  8.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  43.77 
 
 		 354 aa  259  3e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  42.73 
 
 		 354 aa  259  4e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  43.82 
 
 		 353 aa  259  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  42.94 
 
 		 357 aa  258  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1013  uroporphyrinogen decarboxylase  43.03 
 
 		 340 aa  257  2e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  44.21 
 
 		 351 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0030  uroporphyrinogen decarboxylase  38.63 
 
 		 334 aa  256  3e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.210193  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  41.96 
 
 		 353 aa  256  5e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  43.62 
 
 		 356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  41.96 
 
 		 352 aa  253  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1470  uroporphyrinogen decarboxylase  42.72 
 
 		 342 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  44.02 
 
 		 352 aa  253  3e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2666  uroporphyrinogen decarboxylase  42.18 
 
 		 354 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212078  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  43.81 
 
 		 356 aa  252  5.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0363  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 		 369 aa  252  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178148  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0821  uroporphyrinogen decarboxylase  44.58 
 
 		 369 aa  252  7e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00198157  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1268  uroporphyrinogen decarboxylase  40.43 
 
 		 340 aa  251  2e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4036  uroporphyrinogen decarboxylase  44.74 
 
 		 364 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617261  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4264  uroporphyrinogen decarboxylase  44.54 
 
 		 369 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0317  uroporphyrinogen decarboxylase  41.87 
 
 		 340 aa  250  2e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3963  uroporphyrinogen decarboxylase  44.74 
 
 		 364 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3022  uroporphyrinogen decarboxylase  44.74 
 
 		 364 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3039  uroporphyrinogen decarboxylase  45.06 
 
 		 360 aa  249  4e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1580  uroporphyrinogen decarboxylase  44.74 
 
 		 364 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3304  uroporphyrinogen decarboxylase  44.44 
 
 		 364 aa  249  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3349  uroporphyrinogen decarboxylase  44.74 
 
 		 364 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1681  uroporphyrinogen decarboxylase  40.91 
 
 		 378 aa  249  6e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2962  uroporphyrinogen decarboxylase  44.74 
 
 		 405 aa  248  7e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0170  uroporphyrinogen decarboxylase  44.74 
 
 		 405 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1599  uroporphyrinogen decarboxylase  40.47 
 
 		 368 aa  248  8e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00586302  hitchhiker  0.0000224711 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1502  uroporphyrinogen decarboxylase  40.62 
 
 		 378 aa  248  1e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0032  uroporphyrinogen decarboxylase  42.01 
 
 		 355 aa  248  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.590696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2944  uroporphyrinogen decarboxylase  43.06 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0032555  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  41.25 
 
 		 355 aa  248  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0111  uroporphyrinogen decarboxylase  43.06 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0979299  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2779  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  43.62 
 
 		 356 aa  247  3e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.313146 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3292  uroporphyrinogen decarboxylase  43.27 
 
 		 392 aa  246  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.136246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  41.54 
 
 		 354 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  40.41 
 
 		 351 aa  246  4e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0483  uroporphyrinogen decarboxylase  40.98 
 
 		 340 aa  246  4.9999999999999997e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.258594  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1258  uroporphyrinogen decarboxylase  40.98 
 
 		 340 aa  246  4.9999999999999997e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  41.54 
 
 		 354 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  41.54 
 
 		 354 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1379  uroporphyrinogen decarboxylase  40.98 
 
 		 340 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  41.54 
 
 		 354 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0634  uroporphyrinogen decarboxylase  40.06 
 
 		 343 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000186369  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0110  uroporphyrinogen decarboxylase  43.27 
 
 		 375 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.760433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0101  uroporphyrinogen decarboxylase  43.27 
 
 		 392 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0126  uroporphyrinogen decarboxylase  42.98 
 
 		 375 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  41.25 
 
 		 354 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  42.56 
 
 		 350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  41.32 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  40.41 
 
 		 351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  40.12 
 
 		 351 aa  243  3e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  39.53 
 
 		 351 aa  243  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  43.41 
 
 		 353 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0112  uroporphyrinogen decarboxylase  42.98 
 
 		 392 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  41 
 
 		 354 aa  242  5e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.104978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>