More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3476 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3476  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 342 aa  695    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0854  uroporphyrinogen decarboxylase  69.91 
 
 		 341 aa  498  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.913792  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2066  uroporphyrinogen decarboxylase  69.23 
 
 		 341 aa  492  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.502432  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1986  uroporphyrinogen decarboxylase  68.93 
 
 		 341 aa  489  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3208  uroporphyrinogen decarboxylase  66.08 
 
 		 343 aa  458  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3934  uroporphyrinogen decarboxylase  63.1 
 
 		 340 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.569662 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4260  uroporphyrinogen decarboxylase  63.77 
 
 		 335 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.962102  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4393  uroporphyrinogen decarboxylase  62.91 
 
 		 346 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2534  uroporphyrinogen decarboxylase  57.77 
 
 		 349 aa  395  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2192  uroporphyrinogen decarboxylase  56.21 
 
 		 343 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1696  uroporphyrinogen decarboxylase  55.52 
 
 		 338 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146484  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2936  uroporphyrinogen decarboxylase  56.68 
 
 		 350 aa  393  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4014  uroporphyrinogen decarboxylase  53.82 
 
 		 348 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.0629126 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3769  uroporphyrinogen decarboxylase  53.64 
 
 		 348 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477463  normal  0.0130148 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0977  uroporphyrinogen decarboxylase  58.31 
 
 		 325 aa  384  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.942428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3569  uroporphyrinogen decarboxylase  57.14 
 
 		 350 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3616  uroporphyrinogen decarboxylase  53.96 
 
 		 348 aa  381  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00257093  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1258  uroporphyrinogen decarboxylase  54.66 
 
 		 325 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0175405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2833  uroporphyrinogen decarboxylase  54.9 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543255 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2843  uroporphyrinogen decarboxylase  54.81 
 
 		 342 aa  364  1e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1257  uroporphyrinogen decarboxylase  53.35 
 
 		 355 aa  363  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  53.25 
 
 		 348 aa  362  3e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.024361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1271  uroporphyrinogen decarboxylase  54.99 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2528  uroporphyrinogen decarboxylase  53.96 
 
 		 345 aa  353  2e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  52.49 
 
 		 343 aa  351  1e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2705  uroporphyrinogen decarboxylase  53.24 
 
 		 344 aa  350  2e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3629  uroporphyrinogen decarboxylase  52.49 
 
 		 342 aa  349  4e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1772  uroporphyrinogen decarboxylase  53.12 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.767605  normal  0.203092 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4298  uroporphyrinogen decarboxylase  50.81 
 
 		 392 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0372721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1039  uroporphyrinogen decarboxylase  54.02 
 
 		 357 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1494  uroporphyrinogen decarboxylase  51.85 
 
 		 361 aa  338  5e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0243578 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0118  uroporphyrinogen decarboxylase  49.85 
 
 		 341 aa  334  1e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0550  uroporphyrinogen decarboxylase  49.85 
 
 		 343 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2973  uroporphyrinogen decarboxylase  49.12 
 
 		 345 aa  327  1.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1494  uroporphyrinogen decarboxylase  51.38 
 
 		 370 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.775015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2475  uroporphyrinogen decarboxylase  51.18 
 
 		 358 aa  325  6e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000149322  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2335  uroporphyrinogen decarboxylase  49.56 
 
 		 343 aa  324  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.540822  normal  0.254547 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0680  uroporphyrinogen decarboxylase  48.97 
 
 		 343 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0010  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  44.72 
 
 		 334 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1927  uroporphyrinogen decarboxylase  43.97 
 
 		 353 aa  293  4e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.849644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5016  uroporphyrinogen decarboxylase  45.4 
 
 		 346 aa  289  6e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.739471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0030  uroporphyrinogen decarboxylase  42.5 
 
 		 334 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.210193  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1028  uroporphyrinogen decarboxylase  42.37 
 
 		 338 aa  285  7e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1470  uroporphyrinogen decarboxylase  44.75 
 
 		 342 aa  283  3.0000000000000004e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0483  uroporphyrinogen decarboxylase  43.87 
 
 		 340 aa  281  1e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.258594  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1258  uroporphyrinogen decarboxylase  43.87 
 
 		 340 aa  281  1e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1268  uroporphyrinogen decarboxylase  44 
 
 		 340 aa  279  4e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0317  uroporphyrinogen decarboxylase  42.86 
 
 		 340 aa  278  7e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1379  uroporphyrinogen decarboxylase  43.56 
 
 		 340 aa  278  1e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1013  uroporphyrinogen decarboxylase  43.52 
 
 		 340 aa  276  3e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  43.84 
 
 		 356 aa  272  7e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  44.25 
 
 		 353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2666  uroporphyrinogen decarboxylase  46.47 
 
 		 354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212078  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  43.02 
 
 		 352 aa  269  5e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0529  uroporphyrinogen decarboxylase  43.52 
 
 		 340 aa  268  1e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  45.32 
 
 		 353 aa  265  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0634  uroporphyrinogen decarboxylase  40.24 
 
 		 343 aa  263  3e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000186369  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1456  uroporphyrinogen decarboxylase  40.95 
 
 		 343 aa  262  4.999999999999999e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  44.15 
 
 		 354 aa  261  1e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  45.09 
 
 		 355 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  43.35 
 
 		 354 aa  259  5.0000000000000005e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  44.51 
 
 		 355 aa  259  6e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  43.27 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  44.64 
 
 		 355 aa  257  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  44.83 
 
 		 355 aa  256  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  45.27 
 
 		 357 aa  256  4e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  45.14 
 
 		 352 aa  256  6e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  42.98 
 
 		 354 aa  255  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  43.18 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  45.45 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  45.45 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  44.22 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  43.02 
 
 		 354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  43.3 
 
 		 354 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  43.02 
 
 		 354 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  42.24 
 
 		 354 aa  249  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  44.65 
 
 		 356 aa  250  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  42.66 
 
 		 354 aa  250  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  41.26 
 
 		 355 aa  249  6e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03630  uroporphyrinogen decarboxylase  38.71 
 
 		 343 aa  248  2e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  43.1 
 
 		 354 aa  248  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1118  uroporphyrinogen decarboxylase  41.74 
 
 		 366 aa  247  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0387  uroporphyrinogen decarboxylase  44.07 
 
 		 354 aa  247  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1540  uroporphyrinogen decarboxylase  43.58 
 
 		 354 aa  246  4e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0588582  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  42.73 
 
 		 354 aa  245  6e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0124917 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  43.57 
 
 		 351 aa  245  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5466  uroporphyrinogen decarboxylase  42.44 
 
 		 354 aa  245  9e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6502  uroporphyrinogen decarboxylase  38.58 
 
 		 341 aa  245  9e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.607973 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  43.53 
 
 		 350 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  42.54 
 
 		 354 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0468  uroporphyrinogen decarboxylase  42.94 
 
 		 354 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.551624  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  45.3 
 
 		 365 aa  245  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  41.81 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  41.98 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0044  uroporphyrinogen decarboxylase  42.9 
 
 		 366 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629756  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  41.67 
 
 		 354 aa  243  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4488  uroporphyrinogen decarboxylase  41.67 
 
 		 354 aa  243  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4028  uroporphyrinogen decarboxylase  41.67 
 
 		 354 aa  243  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4445  uroporphyrinogen decarboxylase  41.67 
 
 		 354 aa  243  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>