More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1927 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1927  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 353 aa  699    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.849644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2475  uroporphyrinogen decarboxylase  56.45 
 
 		 358 aa  378  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000149322  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3616  uroporphyrinogen decarboxylase  48.72 
 
 		 348 aa  331  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00257093  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2833  uroporphyrinogen decarboxylase  53.31 
 
 		 344 aa  324  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543255 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1257  uroporphyrinogen decarboxylase  50.29 
 
 		 355 aa  317  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0118  uroporphyrinogen decarboxylase  50 
 
 		 341 aa  315  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2534  uroporphyrinogen decarboxylase  48.41 
 
 		 349 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  46.26 
 
 		 343 aa  301  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  46.86 
 
 		 348 aa  296  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.024361 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2973  uroporphyrinogen decarboxylase  46.96 
 
 		 345 aa  295  7e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3208  uroporphyrinogen decarboxylase  46.02 
 
 		 343 aa  293  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3476  uroporphyrinogen decarboxylase  43.97 
 
 		 342 aa  293  4e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3629  uroporphyrinogen decarboxylase  47.13 
 
 		 342 aa  291  9e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3569  uroporphyrinogen decarboxylase  46.29 
 
 		 350 aa  291  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2528  uroporphyrinogen decarboxylase  45.27 
 
 		 345 aa  290  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2843  uroporphyrinogen decarboxylase  47.44 
 
 		 342 aa  288  8e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2335  uroporphyrinogen decarboxylase  44.99 
 
 		 343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.540822  normal  0.254547 
 
 
-
 
NC_004310  BR2066  uroporphyrinogen decarboxylase  45.11 
 
 		 341 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.502432  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0854  uroporphyrinogen decarboxylase  44.67 
 
 		 341 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.913792  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0550  uroporphyrinogen decarboxylase  43.84 
 
 		 343 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3934  uroporphyrinogen decarboxylase  46.51 
 
 		 340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.569662 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0680  uroporphyrinogen decarboxylase  44.99 
 
 		 343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4393  uroporphyrinogen decarboxylase  45.04 
 
 		 346 aa  283  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1986  uroporphyrinogen decarboxylase  44.83 
 
 		 341 aa  281  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4260  uroporphyrinogen decarboxylase  45.64 
 
 		 335 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.962102  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1696  uroporphyrinogen decarboxylase  40.92 
 
 		 338 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146484  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4014  uroporphyrinogen decarboxylase  41.26 
 
 		 348 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.0629126 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2705  uroporphyrinogen decarboxylase  43.91 
 
 		 344 aa  275  7e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3769  uroporphyrinogen decarboxylase  39.83 
 
 		 348 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477463  normal  0.0130148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1271  uroporphyrinogen decarboxylase  46.28 
 
 		 360 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1258  uroporphyrinogen decarboxylase  40.72 
 
 		 325 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0175405 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2936  uroporphyrinogen decarboxylase  41.78 
 
 		 350 aa  270  4e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2192  uroporphyrinogen decarboxylase  40.57 
 
 		 343 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1039  uroporphyrinogen decarboxylase  45.53 
 
 		 357 aa  260  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1494  uroporphyrinogen decarboxylase  43.54 
 
 		 361 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0243578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4298  uroporphyrinogen decarboxylase  41.62 
 
 		 392 aa  256  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0372721 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0112  uroporphyrinogen decarboxylase  43.59 
 
 		 392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0030  uroporphyrinogen decarboxylase  36.23 
 
 		 334 aa  253  3e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.210193  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1772  uroporphyrinogen decarboxylase  42.13 
 
 		 360 aa  253  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.767605  normal  0.203092 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3963  uroporphyrinogen decarboxylase  43.14 
 
 		 364 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4036  uroporphyrinogen decarboxylase  43.14 
 
 		 364 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617261  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3349  uroporphyrinogen decarboxylase  43.14 
 
 		 364 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3292  uroporphyrinogen decarboxylase  43.18 
 
 		 392 aa  252  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.136246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1580  uroporphyrinogen decarboxylase  43.14 
 
 		 364 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3022  uroporphyrinogen decarboxylase  43.14 
 
 		 364 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3304  uroporphyrinogen decarboxylase  43.14 
 
 		 364 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3023  uroporphyrinogen decarboxylase  43.43 
 
 		 378 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2944  uroporphyrinogen decarboxylase  43.3 
 
 		 392 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0032555  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0111  uroporphyrinogen decarboxylase  43.3 
 
 		 392 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0979299  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2962  uroporphyrinogen decarboxylase  43.14 
 
 		 405 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0110  uroporphyrinogen decarboxylase  43.94 
 
 		 375 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.760433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0170  uroporphyrinogen decarboxylase  43.84 
 
 		 405 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5016  uroporphyrinogen decarboxylase  42.98 
 
 		 346 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.739471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0101  uroporphyrinogen decarboxylase  43.87 
 
 		 392 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  41.09 
 
 		 340 aa  249  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0126  uroporphyrinogen decarboxylase  43.02 
 
 		 375 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0044  uroporphyrinogen decarboxylase  43.43 
 
 		 366 aa  249  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0977  uroporphyrinogen decarboxylase  40.83 
 
 		 325 aa  248  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.942428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  42.98 
 
 		 343 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  37.82 
 
 		 353 aa  246  4e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  37.82 
 
 		 352 aa  245  6.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  40.23 
 
 		 340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3861  uroporphyrinogen decarboxylase  41.37 
 
 		 370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3890  uroporphyrinogen decarboxylase  42.57 
 
 		 366 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  38.75 
 
 		 364 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4469  uroporphyrinogen decarboxylase  41.48 
 
 		 379 aa  242  7e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.450699  normal  0.0158572 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0566  uroporphyrinogen decarboxylase  40.49 
 
 		 370 aa  242  9e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  43.62 
 
 		 354 aa  242  9e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  39.94 
 
 		 340 aa  241  9e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  43.62 
 
 		 354 aa  242  9e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1028  uroporphyrinogen decarboxylase  38.74 
 
 		 338 aa  241  2e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0010  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  35.54 
 
 		 334 aa  241  2e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  40.96 
 
 		 355 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  40.74 
 
 		 354 aa  240  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  39.94 
 
 		 339 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  42.09 
 
 		 357 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1494  uroporphyrinogen decarboxylase  40.98 
 
 		 370 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.775015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  39.94 
 
 		 339 aa  239  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  39.66 
 
 		 339 aa  239  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3134  uroporphyrinogen decarboxylase  40.82 
 
 		 370 aa  239  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  41.62 
 
 		 353 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  40.4 
 
 		 354 aa  238  8e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  40.96 
 
 		 354 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  37.43 
 
 		 351 aa  238  9e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0363  uroporphyrinogen decarboxylase  40.38 
 
 		 369 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178148  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0821  uroporphyrinogen decarboxylase  39.44 
 
 		 369 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00198157  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  40.96 
 
 		 354 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  40.53 
 
 		 356 aa  238  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  40.46 
 
 		 354 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3524  uroporphyrinogen decarboxylase  41.26 
 
 		 356 aa  237  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00974086 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  40.23 
 
 		 354 aa  235  8e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0010  uroporphyrinogen decarboxylase  40.82 
 
 		 370 aa  235  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.717373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  36.57 
 
 		 351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  38.33 
 
 		 342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  40.17 
 
 		 354 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  40.23 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  36.29 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  41.36 
 
 		 355 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6502  uroporphyrinogen decarboxylase  37.86 
 
 		 341 aa  233  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.607973 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2666  uroporphyrinogen decarboxylase  40.17 
 
 		 354 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212078  normal  0.51797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>