More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5016 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_5016  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 346 aa  693    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.739471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2973  uroporphyrinogen decarboxylase  54.55 
 
 		 345 aa  360  2e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2192  uroporphyrinogen decarboxylase  51.8 
 
 		 343 aa  315  7e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3569  uroporphyrinogen decarboxylase  48.68 
 
 		 350 aa  312  5.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1696  uroporphyrinogen decarboxylase  50.75 
 
 		 338 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146484  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2843  uroporphyrinogen decarboxylase  48.25 
 
 		 342 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4014  uroporphyrinogen decarboxylase  48.4 
 
 		 348 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.0629126 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3769  uroporphyrinogen decarboxylase  48.98 
 
 		 348 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477463  normal  0.0130148 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1257  uroporphyrinogen decarboxylase  47.02 
 
 		 355 aa  299  4e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2936  uroporphyrinogen decarboxylase  49.4 
 
 		 350 aa  299  4e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3616  uroporphyrinogen decarboxylase  47.18 
 
 		 348 aa  293  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00257093  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0854  uroporphyrinogen decarboxylase  45.97 
 
 		 341 aa  293  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.913792  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2534  uroporphyrinogen decarboxylase  46.69 
 
 		 349 aa  291  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2066  uroporphyrinogen decarboxylase  45.37 
 
 		 341 aa  291  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.502432  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2833  uroporphyrinogen decarboxylase  48.06 
 
 		 344 aa  291  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543255 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3476  uroporphyrinogen decarboxylase  45.4 
 
 		 342 aa  289  6e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1986  uroporphyrinogen decarboxylase  45.07 
 
 		 341 aa  287  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1258  uroporphyrinogen decarboxylase  49.38 
 
 		 325 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0175405 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0977  uroporphyrinogen decarboxylase  49.53 
 
 		 325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.942428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3208  uroporphyrinogen decarboxylase  44.38 
 
 		 343 aa  286  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2705  uroporphyrinogen decarboxylase  45.24 
 
 		 344 aa  280  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3629  uroporphyrinogen decarboxylase  44.74 
 
 		 342 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4393  uroporphyrinogen decarboxylase  43.75 
 
 		 346 aa  276  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  44.48 
 
 		 343 aa  276  5e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0550  uroporphyrinogen decarboxylase  43.66 
 
 		 343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2475  uroporphyrinogen decarboxylase  47.45 
 
 		 358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000149322  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0118  uroporphyrinogen decarboxylase  43.28 
 
 		 341 aa  269  5e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3934  uroporphyrinogen decarboxylase  42.04 
 
 		 340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.569662 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2335  uroporphyrinogen decarboxylase  43.11 
 
 		 343 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.540822  normal  0.254547 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4260  uroporphyrinogen decarboxylase  42.04 
 
 		 335 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.962102  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  45.83 
 
 		 348 aa  264  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.024361 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0680  uroporphyrinogen decarboxylase  42.82 
 
 		 343 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2528  uroporphyrinogen decarboxylase  42.01 
 
 		 345 aa  263  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1927  uroporphyrinogen decarboxylase  42.98 
 
 		 353 aa  251  9.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.849644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1772  uroporphyrinogen decarboxylase  46.24 
 
 		 360 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.767605  normal  0.203092 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1039  uroporphyrinogen decarboxylase  46.42 
 
 		 357 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1271  uroporphyrinogen decarboxylase  44.86 
 
 		 360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1494  uroporphyrinogen decarboxylase  45.38 
 
 		 361 aa  238  8e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0243578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4298  uroporphyrinogen decarboxylase  43.24 
 
 		 392 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0372721 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0010  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  37.13 
 
 		 334 aa  238  2e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0030  uroporphyrinogen decarboxylase  36.56 
 
 		 334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.210193  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  39.49 
 
 		 354 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_002978  WD1028  uroporphyrinogen decarboxylase  39.44 
 
 		 338 aa  230  3e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  39.71 
 
 		 354 aa  229  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  38.81 
 
 		 354 aa  229  5e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  39.42 
 
 		 354 aa  228  8e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1494  uroporphyrinogen decarboxylase  44.66 
 
 		 370 aa  228  9e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.775015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  39.13 
 
 		 354 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  40.91 
 
 		 354 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1118  uroporphyrinogen decarboxylase  38.89 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  39.82 
 
 		 354 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2666  uroporphyrinogen decarboxylase  39.49 
 
 		 354 aa  223  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212078  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  40.18 
 
 		 353 aa  223  4e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  39.51 
 
 		 354 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  39.51 
 
 		 354 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0968  uroporphyrinogen decarboxylase  37.69 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  40.5 
 
 		 354 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  40.8 
 
 		 354 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  40 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  39.88 
 
 		 354 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0468  uroporphyrinogen decarboxylase  40.24 
 
 		 354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.551624  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0482  uroporphyrinogen decarboxylase  40.24 
 
 		 354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  41.51 
 
 		 355 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  39.69 
 
 		 355 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  39.33 
 
 		 356 aa  219  5e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3406  uroporphyrinogen decarboxylase  42.58 
 
 		 354 aa  219  6e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  39.63 
 
 		 355 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  42.26 
 
 		 354 aa  218  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  39.88 
 
 		 354 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  38.01 
 
 		 364 aa  217  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0387  uroporphyrinogen decarboxylase  40.55 
 
 		 354 aa  217  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  40.29 
 
 		 354 aa  216  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0413  uroporphyrinogen decarboxylase  41.94 
 
 		 354 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  41.94 
 
 		 354 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118509 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4042  uroporphyrinogen decarboxylase  41.94 
 
 		 354 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.984022 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0439  uroporphyrinogen decarboxylase  42.26 
 
 		 354 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3590  uroporphyrinogen decarboxylase  42.26 
 
 		 354 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  42.26 
 
 		 354 aa  216  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3920  uroporphyrinogen decarboxylase  41.94 
 
 		 354 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  40 
 
 		 355 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  40.31 
 
 		 355 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  39.47 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  37.93 
 
 		 352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  39.64 
 
 		 355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3039  uroporphyrinogen decarboxylase  39.78 
 
 		 360 aa  212  7e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  40.38 
 
 		 354 aa  212  9e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1681  uroporphyrinogen decarboxylase  36.24 
 
 		 378 aa  211  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  40.13 
 
 		 354 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  38.3 
 
 		 357 aa  210  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  38.69 
 
 		 354 aa  209  5e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1502  uroporphyrinogen decarboxylase  35.97 
 
 		 378 aa  209  8e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3849  uroporphyrinogen decarboxylase  39.75 
 
 		 355 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  40.58 
 
 		 365 aa  208  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0483  uroporphyrinogen decarboxylase  36.14 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.258594  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1268  uroporphyrinogen decarboxylase  37.77 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0459  uroporphyrinogen decarboxylase  39.75 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000960348 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0351  uroporphyrinogen decarboxylase  39.75 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.777116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  39.43 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1258  uroporphyrinogen decarboxylase  35.83 
 
 		 340 aa  206  3e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4445  uroporphyrinogen decarboxylase  39.43 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>