More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1039 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1039  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 357 aa  696    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1271  uroporphyrinogen decarboxylase  89.69 
 
 		 360 aa  622  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1494  uroporphyrinogen decarboxylase  78.09 
 
 		 361 aa  530  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0243578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4298  uroporphyrinogen decarboxylase  75.73 
 
 		 392 aa  519  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0372721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1772  uroporphyrinogen decarboxylase  78.16 
 
 		 360 aa  513  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.767605  normal  0.203092 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1494  uroporphyrinogen decarboxylase  77.18 
 
 		 370 aa  499  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.775015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2192  uroporphyrinogen decarboxylase  56.57 
 
 		 343 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2936  uroporphyrinogen decarboxylase  56.86 
 
 		 350 aa  374  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  56.61 
 
 		 348 aa  364  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.024361 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0854  uroporphyrinogen decarboxylase  56.32 
 
 		 341 aa  364  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.913792  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2534  uroporphyrinogen decarboxylase  56.98 
 
 		 349 aa  364  2e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2066  uroporphyrinogen decarboxylase  56.03 
 
 		 341 aa  361  9e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.502432  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4014  uroporphyrinogen decarboxylase  53.74 
 
 		 348 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.0629126 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3569  uroporphyrinogen decarboxylase  56.62 
 
 		 350 aa  358  9e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3208  uroporphyrinogen decarboxylase  56.16 
 
 		 343 aa  358  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1986  uroporphyrinogen decarboxylase  55.75 
 
 		 341 aa  358  9.999999999999999e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4260  uroporphyrinogen decarboxylase  56.81 
 
 		 335 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.962102  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3934  uroporphyrinogen decarboxylase  56.23 
 
 		 340 aa  355  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.569662 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3476  uroporphyrinogen decarboxylase  54.02 
 
 		 342 aa  355  5e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3769  uroporphyrinogen decarboxylase  52.87 
 
 		 348 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477463  normal  0.0130148 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0977  uroporphyrinogen decarboxylase  56.02 
 
 		 325 aa  353  2e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.942428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1258  uroporphyrinogen decarboxylase  55.29 
 
 		 325 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0175405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1696  uroporphyrinogen decarboxylase  53.04 
 
 		 338 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146484  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2833  uroporphyrinogen decarboxylase  53.69 
 
 		 344 aa  338  5.9999999999999996e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543255 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4393  uroporphyrinogen decarboxylase  52.12 
 
 		 346 aa  334  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2475  uroporphyrinogen decarboxylase  53.98 
 
 		 358 aa  326  3e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000149322  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2705  uroporphyrinogen decarboxylase  49.43 
 
 		 344 aa  324  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3629  uroporphyrinogen decarboxylase  51.71 
 
 		 342 aa  323  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1257  uroporphyrinogen decarboxylase  49.29 
 
 		 355 aa  322  7e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  46.86 
 
 		 343 aa  319  5e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2528  uroporphyrinogen decarboxylase  49 
 
 		 345 aa  317  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2843  uroporphyrinogen decarboxylase  51.29 
 
 		 342 aa  316  3e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2335  uroporphyrinogen decarboxylase  47.43 
 
 		 343 aa  309  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.540822  normal  0.254547 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0680  uroporphyrinogen decarboxylase  47.43 
 
 		 343 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2973  uroporphyrinogen decarboxylase  48.56 
 
 		 345 aa  306  3e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0118  uroporphyrinogen decarboxylase  48.14 
 
 		 341 aa  306  4.0000000000000004e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0550  uroporphyrinogen decarboxylase  45.85 
 
 		 343 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3616  uroporphyrinogen decarboxylase  46.91 
 
 		 348 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00257093  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1927  uroporphyrinogen decarboxylase  45.53 
 
 		 353 aa  269  5e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.849644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0030  uroporphyrinogen decarboxylase  38.44 
 
 		 334 aa  263  4.999999999999999e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.210193  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1013  uroporphyrinogen decarboxylase  41.79 
 
 		 340 aa  260  3e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  42.27 
 
 		 353 aa  259  5.0000000000000005e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0010  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  36.73 
 
 		 334 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2666  uroporphyrinogen decarboxylase  44.29 
 
 		 354 aa  256  6e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212078  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5016  uroporphyrinogen decarboxylase  46.42 
 
 		 346 aa  255  7e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.739471  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  41.4 
 
 		 352 aa  253  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1470  uroporphyrinogen decarboxylase  40.88 
 
 		 342 aa  252  9.000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  43.9 
 
 		 355 aa  248  9e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  43.6 
 
 		 355 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  44.57 
 
 		 355 aa  246  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  43.07 
 
 		 354 aa  246  6e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  42.98 
 
 		 353 aa  244  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  41.89 
 
 		 354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1268  uroporphyrinogen decarboxylase  37.58 
 
 		 340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  42.65 
 
 		 354 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  42.77 
 
 		 354 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3174  uroporphyrinogen decarboxylase  44.9 
 
 		 367 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0317  uroporphyrinogen decarboxylase  38.12 
 
 		 340 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  43.73 
 
 		 355 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  42.94 
 
 		 354 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  42.65 
 
 		 354 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0483  uroporphyrinogen decarboxylase  37.87 
 
 		 340 aa  243  5e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.258594  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  43.62 
 
 		 357 aa  243  5e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  41.47 
 
 		 355 aa  243  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1258  uroporphyrinogen decarboxylase  37.87 
 
 		 340 aa  243  5e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  42.65 
 
 		 354 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0705  uroporphyrinogen decarboxylase  42.86 
 
 		 365 aa  242  7e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0032  uroporphyrinogen decarboxylase  41.72 
 
 		 355 aa  242  9e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.590696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3498  uroporphyrinogen decarboxylase  44.31 
 
 		 367 aa  242  9e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1379  uroporphyrinogen decarboxylase  37.87 
 
 		 340 aa  241  1e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0134  uroporphyrinogen decarboxylase  44.74 
 
 		 372 aa  241  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106114  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  40.51 
 
 		 354 aa  241  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  42.61 
 
 		 352 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3304  uroporphyrinogen decarboxylase  43.79 
 
 		 364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0634  uroporphyrinogen decarboxylase  38.58 
 
 		 343 aa  239  6.999999999999999e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000186369  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1934  uroporphyrinogen decarboxylase  40.22 
 
 		 365 aa  238  8e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4036  uroporphyrinogen decarboxylase  43.22 
 
 		 364 aa  238  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3963  uroporphyrinogen decarboxylase  43.22 
 
 		 364 aa  238  9e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  39.66 
 
 		 354 aa  238  9e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2779  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  43.99 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.313146 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0170  uroporphyrinogen decarboxylase  43.22 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  43.27 
 
 		 351 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3022  uroporphyrinogen decarboxylase  42.94 
 
 		 364 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1118  uroporphyrinogen decarboxylase  40.06 
 
 		 366 aa  237  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1580  uroporphyrinogen decarboxylase  42.94 
 
 		 364 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0112  uroporphyrinogen decarboxylase  42.94 
 
 		 392 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1456  uroporphyrinogen decarboxylase  37.91 
 
 		 343 aa  238  2e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3349  uroporphyrinogen decarboxylase  42.94 
 
 		 364 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3303  uroporphyrinogen decarboxylase  44.02 
 
 		 364 aa  236  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0163615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0821  uroporphyrinogen decarboxylase  41.38 
 
 		 369 aa  237  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00198157  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2944  uroporphyrinogen decarboxylase  43.55 
 
 		 392 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0032555  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0111  uroporphyrinogen decarboxylase  43.55 
 
 		 392 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0979299  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3524  uroporphyrinogen decarboxylase  43.99 
 
 		 356 aa  236  4e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00974086 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2962  uroporphyrinogen decarboxylase  42.94 
 
 		 405 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3342  uroporphyrinogen decarboxylase  41.99 
 
 		 363 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  43.62 
 
 		 356 aa  235  7e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  44.31 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  44.31 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  41.09 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0101  uroporphyrinogen decarboxylase  43.27 
 
 		 392 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>