More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0634 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0634  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 343 aa  710    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000186369  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0317  uroporphyrinogen decarboxylase  70.5 
 
 		 340 aa  513  1e-144  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1268  uroporphyrinogen decarboxylase  67.17 
 
 		 340 aa  491  9.999999999999999e-139  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1456  uroporphyrinogen decarboxylase  67.35 
 
 		 343 aa  488  1e-137  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1258  uroporphyrinogen decarboxylase  65 
 
 		 340 aa  483  1e-135  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0483  uroporphyrinogen decarboxylase  64.71 
 
 		 340 aa  483  1e-135  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.258594  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1013  uroporphyrinogen decarboxylase  66.76 
 
 		 340 aa  478  1e-134  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1379  uroporphyrinogen decarboxylase  64.71 
 
 		 340 aa  480  1e-134  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0529  uroporphyrinogen decarboxylase  67.35 
 
 		 340 aa  475  1e-133  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1470  uroporphyrinogen decarboxylase  65.68 
 
 		 342 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  47.09 
 
 		 354 aa  310  2e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  42.9 
 
 		 350 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  45.06 
 
 		 354 aa  303  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  43.93 
 
 		 355 aa  303  3.0000000000000004e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  44.48 
 
 		 354 aa  300  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0124917 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  44.02 
 
 		 354 aa  299  4e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  44.02 
 
 		 354 aa  299  4e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  43.93 
 
 		 355 aa  299  4e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3713  uroporphyrinogen decarboxylase  44.61 
 
 		 360 aa  298  9e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  43.64 
 
 		 364 aa  298  1e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  44.19 
 
 		 355 aa  298  1e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  45.06 
 
 		 354 aa  298  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  45.06 
 
 		 351 aa  297  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  44.44 
 
 		 354 aa  297  2e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  45.78 
 
 		 365 aa  296  3e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  44.48 
 
 		 355 aa  296  3e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  44.19 
 
 		 355 aa  296  4e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2666  uroporphyrinogen decarboxylase  44.38 
 
 		 354 aa  296  4e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212078  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3867  uroporphyrinogen decarboxylase  44.15 
 
 		 357 aa  296  4e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  43.9 
 
 		 359 aa  295  5e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  43.35 
 
 		 354 aa  295  8e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03874  uroporphyrinogen decarboxylase  43.6 
 
 		 354 aa  295  9e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  43.6 
 
 		 354 aa  295  9e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03827  hypothetical protein  43.6 
 
 		 354 aa  295  9e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4231  uroporphyrinogen decarboxylase  43.6 
 
 		 354 aa  295  9e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5466  uroporphyrinogen decarboxylase  43.6 
 
 		 354 aa  295  9e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4028  uroporphyrinogen decarboxylase  43.6 
 
 		 354 aa  295  9e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4540  uroporphyrinogen decarboxylase  43.6 
 
 		 354 aa  295  9e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4445  uroporphyrinogen decarboxylase  43.6 
 
 		 354 aa  295  9e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531857 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4488  uroporphyrinogen decarboxylase  43.6 
 
 		 354 aa  295  9e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  42.14 
 
 		 356 aa  294  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  43.35 
 
 		 354 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  44.77 
 
 		 351 aa  293  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  43.31 
 
 		 380 aa  294  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  45.06 
 
 		 351 aa  293  4e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  44.83 
 
 		 340 aa  293  4e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  44.06 
 
 		 355 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4500  uroporphyrinogen decarboxylase  43.6 
 
 		 354 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  44.35 
 
 		 355 aa  292  7e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  44.48 
 
 		 351 aa  291  8e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  43.64 
 
 		 354 aa  291  9e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  44.54 
 
 		 339 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  41.86 
 
 		 353 aa  291  1e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  43.35 
 
 		 354 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4498  uroporphyrinogen decarboxylase  43.02 
 
 		 354 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0575835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4378  uroporphyrinogen decarboxylase  43.19 
 
 		 354 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.91714 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  44.19 
 
 		 351 aa  290  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4411  uroporphyrinogen decarboxylase  43.02 
 
 		 354 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.356712  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4574  uroporphyrinogen decarboxylase  43.02 
 
 		 354 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.300698 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  43.35 
 
 		 354 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3849  uroporphyrinogen decarboxylase  43.44 
 
 		 355 aa  289  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  43.9 
 
 		 354 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  43.19 
 
 		 355 aa  289  4e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3491  uroporphyrinogen decarboxylase  42.45 
 
 		 367 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000153179  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  41.87 
 
 		 351 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0351  uroporphyrinogen decarboxylase  43.44 
 
 		 355 aa  289  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.777116  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0459  uroporphyrinogen decarboxylase  43.44 
 
 		 355 aa  289  5.0000000000000004e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000960348 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  43.39 
 
 		 340 aa  287  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  43.36 
 
 		 354 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3498  uroporphyrinogen decarboxylase  41.43 
 
 		 367 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  43.36 
 
 		 354 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  41.45 
 
 		 352 aa  287  2e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3174  uroporphyrinogen decarboxylase  41.71 
 
 		 367 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3342  uroporphyrinogen decarboxylase  42.45 
 
 		 363 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3890  uroporphyrinogen decarboxylase  41.76 
 
 		 366 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  43.6 
 
 		 351 aa  287  2e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  42.9 
 
 		 355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1540  uroporphyrinogen decarboxylase  42.44 
 
 		 354 aa  285  5.999999999999999e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0588582  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  40.64 
 
 		 357 aa  285  7e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  43.44 
 
 		 355 aa  285  7e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0044  uroporphyrinogen decarboxylase  41.69 
 
 		 366 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  43.39 
 
 		 340 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1599  uroporphyrinogen decarboxylase  45.32 
 
 		 368 aa  283  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00586302  hitchhiker  0.0000224711 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  42.33 
 
 		 352 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0112  uroporphyrinogen decarboxylase  40.56 
 
 		 392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  43.31 
 
 		 354 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1118  uroporphyrinogen decarboxylase  43.31 
 
 		 366 aa  282  5.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  42.73 
 
 		 351 aa  282  7.000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  43.02 
 
 		 354 aa  282  7.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0821  uroporphyrinogen decarboxylase  42.17 
 
 		 369 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00198157  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3303  uroporphyrinogen decarboxylase  41.19 
 
 		 364 aa  280  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0163615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3963  uroporphyrinogen decarboxylase  40.62 
 
 		 364 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0774  uroporphyrinogen decarboxylase  42.86 
 
 		 344 aa  280  3e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.352991 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4036  uroporphyrinogen decarboxylase  40.62 
 
 		 364 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617261  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3022  uroporphyrinogen decarboxylase  40.62 
 
 		 364 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3349  uroporphyrinogen decarboxylase  40.62 
 
 		 364 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1580  uroporphyrinogen decarboxylase  40.62 
 
 		 364 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3304  uroporphyrinogen decarboxylase  40.91 
 
 		 364 aa  279  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0134  uroporphyrinogen decarboxylase  40.62 
 
 		 372 aa  279  6e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106114  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0170  uroporphyrinogen decarboxylase  40.62 
 
 		 405 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>