More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3569 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3569  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 350 aa  702    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2534  uroporphyrinogen decarboxylase  63.74 
 
 		 349 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2936  uroporphyrinogen decarboxylase  57.65 
 
 		 350 aa  393  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4014  uroporphyrinogen decarboxylase  56.8 
 
 		 348 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.0629126 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3769  uroporphyrinogen decarboxylase  56.51 
 
 		 348 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477463  normal  0.0130148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1696  uroporphyrinogen decarboxylase  56.29 
 
 		 338 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146484  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2192  uroporphyrinogen decarboxylase  57.23 
 
 		 343 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3476  uroporphyrinogen decarboxylase  57.14 
 
 		 342 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1258  uroporphyrinogen decarboxylase  58.26 
 
 		 325 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0175405 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0977  uroporphyrinogen decarboxylase  57.68 
 
 		 325 aa  372  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.942428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3208  uroporphyrinogen decarboxylase  55.75 
 
 		 343 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1271  uroporphyrinogen decarboxylase  58.29 
 
 		 360 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4393  uroporphyrinogen decarboxylase  54.28 
 
 		 346 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2066  uroporphyrinogen decarboxylase  53.85 
 
 		 341 aa  362  8e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.502432  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0854  uroporphyrinogen decarboxylase  54.01 
 
 		 341 aa  361  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.913792  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1986  uroporphyrinogen decarboxylase  53.55 
 
 		 341 aa  358  9.999999999999999e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  53.51 
 
 		 348 aa  358  9.999999999999999e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.024361 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2833  uroporphyrinogen decarboxylase  54.78 
 
 		 344 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543255 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3934  uroporphyrinogen decarboxylase  54.19 
 
 		 340 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.569662 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4260  uroporphyrinogen decarboxylase  53.89 
 
 		 335 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.962102  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1257  uroporphyrinogen decarboxylase  51.91 
 
 		 355 aa  350  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3616  uroporphyrinogen decarboxylase  51.45 
 
 		 348 aa  349  4e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00257093  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1494  uroporphyrinogen decarboxylase  54.44 
 
 		 361 aa  348  7e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0243578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1039  uroporphyrinogen decarboxylase  56.62 
 
 		 357 aa  344  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2843  uroporphyrinogen decarboxylase  53.12 
 
 		 342 aa  343  2e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1772  uroporphyrinogen decarboxylase  55.62 
 
 		 360 aa  342  7e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.767605  normal  0.203092 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4298  uroporphyrinogen decarboxylase  51.83 
 
 		 392 aa  339  4e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0372721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1494  uroporphyrinogen decarboxylase  54.34 
 
 		 370 aa  325  9e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.775015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2528  uroporphyrinogen decarboxylase  48.82 
 
 		 345 aa  323  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3629  uroporphyrinogen decarboxylase  49.11 
 
 		 342 aa  322  6e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  48.97 
 
 		 343 aa  322  9.000000000000001e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2705  uroporphyrinogen decarboxylase  48.38 
 
 		 344 aa  321  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0118  uroporphyrinogen decarboxylase  48.07 
 
 		 341 aa  318  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2475  uroporphyrinogen decarboxylase  51.78 
 
 		 358 aa  315  7e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000149322  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5016  uroporphyrinogen decarboxylase  48.68 
 
 		 346 aa  312  6.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.739471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2335  uroporphyrinogen decarboxylase  46.61 
 
 		 343 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.540822  normal  0.254547 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0550  uroporphyrinogen decarboxylase  45.72 
 
 		 343 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0680  uroporphyrinogen decarboxylase  46.31 
 
 		 343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2973  uroporphyrinogen decarboxylase  46.9 
 
 		 345 aa  304  1.0000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1927  uroporphyrinogen decarboxylase  46.29 
 
 		 353 aa  291  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.849644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0030  uroporphyrinogen decarboxylase  42.55 
 
 		 334 aa  279  4e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.210193  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0010  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  41.93 
 
 		 334 aa  276  5e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1013  uroporphyrinogen decarboxylase  42.86 
 
 		 340 aa  265  7e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1470  uroporphyrinogen decarboxylase  42.04 
 
 		 342 aa  260  2e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1379  uroporphyrinogen decarboxylase  38.87 
 
 		 340 aa  255  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1258  uroporphyrinogen decarboxylase  38.87 
 
 		 340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1456  uroporphyrinogen decarboxylase  41.44 
 
 		 343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1268  uroporphyrinogen decarboxylase  39.76 
 
 		 340 aa  255  1.0000000000000001e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0483  uroporphyrinogen decarboxylase  38.87 
 
 		 340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.258594  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0317  uroporphyrinogen decarboxylase  39.94 
 
 		 340 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0634  uroporphyrinogen decarboxylase  39.76 
 
 		 343 aa  249  4e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000186369  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0529  uroporphyrinogen decarboxylase  39.17 
 
 		 340 aa  248  9e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  42.81 
 
 		 354 aa  245  6.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  42.32 
 
 		 354 aa  245  9e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2666  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 		 354 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212078  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0028  uroporphyrinogen decarboxylase  41.31 
 
 		 369 aa  242  9e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  42.81 
 
 		 340 aa  240  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  42.27 
 
 		 354 aa  239  5e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  43.73 
 
 		 354 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1028  uroporphyrinogen decarboxylase  37.27 
 
 		 338 aa  236  6e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  39.71 
 
 		 356 aa  235  8e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3304  uroporphyrinogen decarboxylase  43.43 
 
 		 364 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  43.41 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  43.22 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  41.61 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  41.12 
 
 		 340 aa  233  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  42.07 
 
 		 355 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  42.45 
 
 		 355 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  42.59 
 
 		 354 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  42.59 
 
 		 354 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3963  uroporphyrinogen decarboxylase  42.81 
 
 		 364 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2944  uroporphyrinogen decarboxylase  43.12 
 
 		 392 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0032555  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0111  uroporphyrinogen decarboxylase  43.12 
 
 		 392 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0979299  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1580  uroporphyrinogen decarboxylase  42.81 
 
 		 364 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3349  uroporphyrinogen decarboxylase  42.81 
 
 		 364 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3022  uroporphyrinogen decarboxylase  42.81 
 
 		 364 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4036  uroporphyrinogen decarboxylase  42.81 
 
 		 364 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617261  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  42.45 
 
 		 355 aa  232  6e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  42.59 
 
 		 354 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3491  uroporphyrinogen decarboxylase  42.25 
 
 		 367 aa  232  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000153179  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  39.01 
 
 		 352 aa  232  8.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0170  uroporphyrinogen decarboxylase  42.81 
 
 		 405 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0112  uroporphyrinogen decarboxylase  42.51 
 
 		 392 aa  232  9e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2962  uroporphyrinogen decarboxylase  42.81 
 
 		 405 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  42.04 
 
 		 355 aa  231  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  39.32 
 
 		 353 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3498  uroporphyrinogen decarboxylase  42.77 
 
 		 367 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0044  uroporphyrinogen decarboxylase  42.2 
 
 		 366 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0126  uroporphyrinogen decarboxylase  42.81 
 
 		 375 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3303  uroporphyrinogen decarboxylase  42.55 
 
 		 364 aa  230  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0163615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  40.69 
 
 		 354 aa  230  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  39.89 
 
 		 353 aa  230  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3292  uroporphyrinogen decarboxylase  40.9 
 
 		 392 aa  229  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.136246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  41.92 
 
 		 356 aa  229  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0101  uroporphyrinogen decarboxylase  42.81 
 
 		 392 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0110  uroporphyrinogen decarboxylase  42.81 
 
 		 375 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.760433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1200  uroporphyrinogen decarboxylase  39.38 
 
 		 347 aa  229  7e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3174  uroporphyrinogen decarboxylase  42.77 
 
 		 367 aa  228  9e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  40.54 
 
 		 340 aa  228  9e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0363  uroporphyrinogen decarboxylase  39.39 
 
 		 369 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178148  normal  0.394936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>