More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0529 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0529  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 340 aa  699    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1379  uroporphyrinogen decarboxylase  81.18 
 
 		 340 aa  585  1e-166  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1258  uroporphyrinogen decarboxylase  80.88 
 
 		 340 aa  586  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0483  uroporphyrinogen decarboxylase  80.29 
 
 		 340 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.258594  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1470  uroporphyrinogen decarboxylase  76.33 
 
 		 342 aa  553  1e-156  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1013  uroporphyrinogen decarboxylase  75.59 
 
 		 340 aa  554  1e-156  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1456  uroporphyrinogen decarboxylase  74.71 
 
 		 343 aa  542  1e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1268  uroporphyrinogen decarboxylase  73.67 
 
 		 340 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0317  uroporphyrinogen decarboxylase  71.68 
 
 		 340 aa  527  1e-148  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0634  uroporphyrinogen decarboxylase  67.35 
 
 		 343 aa  486  1e-136  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000186369  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  47.52 
 
 		 354 aa  316  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  47.52 
 
 		 354 aa  316  4e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  46.67 
 
 		 351 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  43.9 
 
 		 356 aa  312  5.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  47.81 
 
 		 354 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  48.1 
 
 		 354 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  45.03 
 
 		 352 aa  310  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  48.1 
 
 		 354 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  47.23 
 
 		 354 aa  309  5e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  46.09 
 
 		 351 aa  309  5.9999999999999995e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  47.52 
 
 		 355 aa  308  8e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  45.32 
 
 		 353 aa  308  8e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  47.52 
 
 		 355 aa  308  9e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  46.36 
 
 		 354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  47.52 
 
 		 354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  47.52 
 
 		 354 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  46.06 
 
 		 354 aa  305  6e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3849  uroporphyrinogen decarboxylase  46.49 
 
 		 355 aa  305  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0459  uroporphyrinogen decarboxylase  46.49 
 
 		 355 aa  305  8.000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000960348 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0351  uroporphyrinogen decarboxylase  46.49 
 
 		 355 aa  305  8.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.777116  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  46.94 
 
 		 355 aa  304  1.0000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  46.06 
 
 		 355 aa  304  1.0000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  47.09 
 
 		 355 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  45.61 
 
 		 354 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  46.65 
 
 		 359 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  45.32 
 
 		 354 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  44.41 
 
 		 350 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1599  uroporphyrinogen decarboxylase  46.22 
 
 		 368 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00586302  hitchhiker  0.0000224711 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  45.16 
 
 		 357 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  45.48 
 
 		 354 aa  303  3.0000000000000004e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0124917 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1118  uroporphyrinogen decarboxylase  46.65 
 
 		 366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  47.09 
 
 		 355 aa  303  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  44.93 
 
 		 351 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  45.77 
 
 		 380 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  45.64 
 
 		 355 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1502  uroporphyrinogen decarboxylase  46.09 
 
 		 378 aa  301  8.000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03874  uroporphyrinogen decarboxylase  45.77 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  45.77 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03827  hypothetical protein  45.77 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4488  uroporphyrinogen decarboxylase  45.77 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4028  uroporphyrinogen decarboxylase  45.77 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  46.49 
 
 		 355 aa  301  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2666  uroporphyrinogen decarboxylase  45.93 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212078  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4231  uroporphyrinogen decarboxylase  45.77 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4540  uroporphyrinogen decarboxylase  45.77 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5466  uroporphyrinogen decarboxylase  45.77 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  45.8 
 
 		 351 aa  301  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4445  uroporphyrinogen decarboxylase  45.77 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531857 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  44.78 
 
 		 364 aa  300  2e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1681  uroporphyrinogen decarboxylase  45.8 
 
 		 378 aa  301  2e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  45.48 
 
 		 355 aa  300  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4574  uroporphyrinogen decarboxylase  45.77 
 
 		 354 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.300698 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4500  uroporphyrinogen decarboxylase  45.77 
 
 		 354 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407137 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4411  uroporphyrinogen decarboxylase  45.48 
 
 		 354 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.356712  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  44.35 
 
 		 351 aa  300  3e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4378  uroporphyrinogen decarboxylase  45.48 
 
 		 354 aa  299  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.91714 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  45.35 
 
 		 355 aa  299  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3867  uroporphyrinogen decarboxylase  45.75 
 
 		 357 aa  299  5e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3713  uroporphyrinogen decarboxylase  45.32 
 
 		 360 aa  299  5e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4498  uroporphyrinogen decarboxylase  45.48 
 
 		 354 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0575835 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  44.35 
 
 		 351 aa  297  2e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1540  uroporphyrinogen decarboxylase  45.45 
 
 		 354 aa  297  2e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0588582  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  43.48 
 
 		 351 aa  296  4e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  44.61 
 
 		 354 aa  295  5e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  44.61 
 
 		 354 aa  295  5e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  45.19 
 
 		 354 aa  294  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  44.61 
 
 		 354 aa  294  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0439  uroporphyrinogen decarboxylase  45.19 
 
 		 354 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3590  uroporphyrinogen decarboxylase  45.19 
 
 		 354 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  45.19 
 
 		 354 aa  295  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0387  uroporphyrinogen decarboxylase  45.48 
 
 		 354 aa  294  1e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  44.9 
 
 		 354 aa  294  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3406  uroporphyrinogen decarboxylase  44.9 
 
 		 354 aa  293  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  44.93 
 
 		 365 aa  293  3e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  44.57 
 
 		 354 aa  293  3e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  42.14 
 
 		 352 aa  293  4e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  44.61 
 
 		 354 aa  292  5e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  44.61 
 
 		 354 aa  292  5e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1934  uroporphyrinogen decarboxylase  42.98 
 
 		 365 aa  291  1e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3174  uroporphyrinogen decarboxylase  42.98 
 
 		 367 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3491  uroporphyrinogen decarboxylase  42.86 
 
 		 367 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000153179  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0482  uroporphyrinogen decarboxylase  44.61 
 
 		 354 aa  291  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3498  uroporphyrinogen decarboxylase  42.98 
 
 		 367 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4042  uroporphyrinogen decarboxylase  44.9 
 
 		 354 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.984022 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  44.87 
 
 		 340 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0413  uroporphyrinogen decarboxylase  44.9 
 
 		 354 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  44.9 
 
 		 354 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118509 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3920  uroporphyrinogen decarboxylase  44.9 
 
 		 354 aa  289  6e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3303  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 		 364 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0163615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3342  uroporphyrinogen decarboxylase  42.29 
 
 		 363 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>