173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3754 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  82.01 
 
 
409 aa  685    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  100 
 
 
418 aa  826    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2873  HipA N-terminal domain protein  47.67 
 
 
396 aa  282  8.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  44.8 
 
 
408 aa  280  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  32.21 
 
 
422 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  32.27 
 
 
418 aa  103  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  28.82 
 
 
460 aa  98.6  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  31.69 
 
 
413 aa  94.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  30.64 
 
 
450 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  32.6 
 
 
450 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  31.01 
 
 
414 aa  92.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0687  HipA-like protein  31.5 
 
 
413 aa  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  27.45 
 
 
433 aa  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  28.22 
 
 
433 aa  89  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  31.01 
 
 
453 aa  89  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  27.45 
 
 
433 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  27.39 
 
 
433 aa  87.8  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  29.02 
 
 
441 aa  87.4  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  24.69 
 
 
435 aa  87.4  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  28.32 
 
 
400 aa  87  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  32.64 
 
 
318 aa  87  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  32.64 
 
 
318 aa  86.7  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  27.45 
 
 
433 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  27.55 
 
 
433 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  27.55 
 
 
423 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  30.61 
 
 
437 aa  85.9  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  26.53 
 
 
312 aa  84  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  31.45 
 
 
413 aa  83.6  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  25.57 
 
 
435 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4901  putative regulator containing a HipA-like domain  29.41 
 
 
433 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.460954  normal  0.048459 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  27.54 
 
 
437 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  28.46 
 
 
435 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  31.53 
 
 
419 aa  82  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  28.47 
 
 
404 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  26.18 
 
 
435 aa  81.3  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  25.74 
 
 
444 aa  80.9  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  23.71 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  27.1 
 
 
418 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  25 
 
 
438 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  27.54 
 
 
441 aa  80.1  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  25.06 
 
 
442 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  25.65 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  30.4 
 
 
317 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  29.43 
 
 
450 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  29.56 
 
 
449 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3810  HipA domain-containing protein  28.76 
 
 
402 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842886  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  25.64 
 
 
439 aa  77  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  24.06 
 
 
435 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  25.93 
 
 
440 aa  76.6  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  30.38 
 
 
430 aa  76.6  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  28.34 
 
 
461 aa  76.6  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  27.62 
 
 
435 aa  76.3  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  27.62 
 
 
435 aa  76.3  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  25.34 
 
 
430 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0282  HipA domain-containing protein  29.38 
 
 
451 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  24.74 
 
 
434 aa  74.7  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  24.24 
 
 
430 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  28.53 
 
 
440 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1775  HipA N-terminal domain protein  25.33 
 
 
404 aa  74.7  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.474256  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  27.58 
 
 
454 aa  74.7  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  29.48 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  31.03 
 
 
433 aa  73.2  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  27.95 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  27.76 
 
 
446 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  25.73 
 
 
446 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  28.9 
 
 
403 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  29.21 
 
 
416 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3103  HipA domain-containing protein  27 
 
 
449 aa  72.8  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891938  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  27.67 
 
 
418 aa  72.8  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4032  HipA domain-containing protein  26.68 
 
 
444 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.716492 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  24.52 
 
 
420 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  24.25 
 
 
420 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  27.69 
 
 
425 aa  72  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  24.52 
 
 
420 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  22.99 
 
 
431 aa  71.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0482  hypothetical protein  25.26 
 
 
524 aa  71.6  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  27.43 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  27.68 
 
 
422 aa  71.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  24.52 
 
 
420 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  27.07 
 
 
440 aa  70.5  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  26.17 
 
 
444 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  28.57 
 
 
446 aa  70.5  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  28.12 
 
 
445 aa  70.1  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3446  HipA domain-containing protein  33.12 
 
 
617 aa  69.7  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  26.17 
 
 
444 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  27.39 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  26.75 
 
 
434 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  26.9 
 
 
449 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  23.98 
 
 
420 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  28.53 
 
 
440 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  26.23 
 
 
434 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  26.97 
 
 
434 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  26.23 
 
 
434 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  29.33 
 
 
435 aa  67.4  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  25.8 
 
 
444 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  25 
 
 
439 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  28.17 
 
 
443 aa  67  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4056  HipA-like  32.68 
 
 
613 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.970389  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5430  HipA N-terminal domain protein  26.13 
 
 
439 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.875392 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  23.57 
 
 
434 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>