190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3972 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  82.01 
 
 		 418 aa  685    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  100 
 
 		 409 aa  814    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  43.49 
 
 		 408 aa  298  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2873  HipA N-terminal domain protein  46.38 
 
 		 396 aa  298  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  33.14 
 
 		 418 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  33.43 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  32.27 
 
 		 422 aa  111  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  32.84 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  29.06 
 
 		 414 aa  100  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  28.62 
 
 		 460 aa  97.4  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  34.89 
 
 		 318 aa  95.9  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  34.89 
 
 		 318 aa  95.9  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  30 
 
 		 454 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  29.66 
 
 		 312 aa  94  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  30.33 
 
 		 450 aa  93.6  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0687  HipA-like protein  32.34 
 
 		 413 aa  92.8  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  29.13 
 
 		 419 aa  91.3  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  30.85 
 
 		 450 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4901  putative regulator containing a HipA-like domain  31 
 
 		 433 aa  89.7  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.460954  normal  0.048459 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  27.86 
 
 		 437 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  30.71 
 
 		 404 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  27.61 
 
 		 441 aa  89  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  28.31 
 
 		 312 aa  88.2  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  29.08 
 
 		 400 aa  88.2  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  26.92 
 
 		 418 aa  87.4  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  32.07 
 
 		 433 aa  87.4  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  32.22 
 
 		 317 aa  87  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  27.13 
 
 		 435 aa  87  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  29.92 
 
 		 437 aa  86.7  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  30.34 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  30.94 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  30.94 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  24.2 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  25.19 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3810  HipA domain-containing protein  28.78 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842886  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3103  HipA domain-containing protein  26.81 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891938  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  27.16 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  24.27 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  26.28 
 
 		 435 aa  84  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  28.02 
 
 		 440 aa  84  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  27.51 
 
 		 382 aa  82.8  0.000000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  28.33 
 
 		 440 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  29.17 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  28.38 
 
 		 461 aa  81.6  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  27.88 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  28.75 
 
 		 453 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  24.62 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3446  HipA domain-containing protein  36.25 
 
 		 617 aa  80.1  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  28.39 
 
 		 425 aa  80.1  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  26.42 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  27.19 
 
 		 433 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  27.35 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4032  HipA domain-containing protein  27.34 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.716492 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  24.51 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0482  hypothetical protein  25.13 
 
 		 524 aa  77  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  26.16 
 
 		 430 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  26.76 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  25.2 
 
 		 434 aa  76.6  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  25.39 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  26.76 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  25.48 
 
 		 440 aa  76.6  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  30.38 
 
 		 435 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  29.11 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  27.57 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  27.41 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  24.74 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  28.53 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  27.43 
 
 		 450 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  30.82 
 
 		 440 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1930  hypothetical protein  26.87 
 
 		 449 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  27.65 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1621  HipA N-terminal domain protein  27.92 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2253  HipA domain-containing protein  27.92 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00653025  normal  0.641538 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  27.41 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  24.72 
 
 		 431 aa  73.2  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  28.26 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  28.34 
 
 		 451 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1825  HipA N-terminal domain protein  28.77 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  25.06 
 
 		 444 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  26.05 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  29.94 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0282  HipA domain-containing protein  28.53 
 
 		 451 aa  72  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  26.46 
 
 		 449 aa  71.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5430  HipA N-terminal domain protein  26.33 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.875392 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  25.66 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  27.06 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  25.77 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  28.52 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  24.71 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  27.69 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  26.05 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  25.77 
 
 		 449 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  25.83 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  25.83 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2046  HipA domain protein  31.22 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  27.06 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  27.73 
 
 		 446 aa  69.7  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  25.72 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  25.72 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  24.14 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>