183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4244 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  100 
 
 
439 aa  916    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  67.73 
 
 
439 aa  625  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  67.28 
 
 
438 aa  622  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  66.59 
 
 
435 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  53.3 
 
 
440 aa  489  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  53.9 
 
 
440 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  53.9 
 
 
440 aa  474  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  53.9 
 
 
440 aa  474  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  53.9 
 
 
440 aa  474  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  53.9 
 
 
440 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  50.81 
 
 
439 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  52.18 
 
 
441 aa  435  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  48.39 
 
 
435 aa  426  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  46.22 
 
 
434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  44.37 
 
 
442 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  43.68 
 
 
444 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  45.29 
 
 
441 aa  375  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  45.18 
 
 
447 aa  375  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  46.01 
 
 
440 aa  372  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  54.03 
 
 
351 aa  372  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  45.43 
 
 
446 aa  372  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  44.85 
 
 
446 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  44.14 
 
 
444 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  44.88 
 
 
437 aa  362  1e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  42.89 
 
 
444 aa  358  8e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  42.79 
 
 
450 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  42.79 
 
 
450 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  42.79 
 
 
450 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  42.79 
 
 
450 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  45.02 
 
 
446 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  42.56 
 
 
450 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  42.56 
 
 
622 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  42.89 
 
 
444 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  42.66 
 
 
433 aa  350  3e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  40.63 
 
 
450 aa  349  5e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  42.53 
 
 
435 aa  348  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  42.53 
 
 
435 aa  348  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  42.89 
 
 
444 aa  346  4e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  43.28 
 
 
440 aa  344  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  44.44 
 
 
380 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  41.69 
 
 
446 aa  343  5e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  42.86 
 
 
435 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  41.51 
 
 
446 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  42.24 
 
 
440 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  40.6 
 
 
446 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  40.6 
 
 
446 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  41.5 
 
 
445 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  40.65 
 
 
445 aa  313  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  40 
 
 
450 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  39.68 
 
 
443 aa  306  7e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  38.78 
 
 
449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  37.44 
 
 
435 aa  269  8.999999999999999e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  32.01 
 
 
425 aa  192  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  31.43 
 
 
426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4031  HipA N-terminal domain protein  67.8 
 
 
222 aa  178  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1765  protein HipA  52.87 
 
 
176 aa  177  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  33.17 
 
 
414 aa  172  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  31.39 
 
 
461 aa  161  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  33.04 
 
 
422 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  28.54 
 
 
480 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  30.63 
 
 
454 aa  149  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  32.95 
 
 
422 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  30.32 
 
 
382 aa  146  6e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  29.19 
 
 
435 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  31.67 
 
 
418 aa  138  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  29.08 
 
 
427 aa  136  8e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  29.06 
 
 
411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  32.42 
 
 
449 aa  134  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  28.45 
 
 
427 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  30.84 
 
 
416 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0568  hypothetical protein  53.57 
 
 
116 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116615  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  25.93 
 
 
435 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  27.06 
 
 
419 aa  124  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  26.45 
 
 
434 aa  124  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  29.71 
 
 
460 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  26.6 
 
 
433 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  27.91 
 
 
430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  25.94 
 
 
433 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  26 
 
 
433 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  26.35 
 
 
423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  25.94 
 
 
433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  27.91 
 
 
434 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  27.91 
 
 
434 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  25.53 
 
 
433 aa  109  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  28.7 
 
 
430 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  27.49 
 
 
433 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  28.12 
 
 
434 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  28.12 
 
 
434 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  29.71 
 
 
433 aa  106  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  27.5 
 
 
450 aa  106  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  27.78 
 
 
450 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  28.29 
 
 
431 aa  104  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0282  HipA domain-containing protein  26.75 
 
 
451 aa  100  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  24.5 
 
 
453 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  27.65 
 
 
408 aa  94.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  27.2 
 
 
418 aa  93.2  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  26.32 
 
 
451 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  28.83 
 
 
440 aa  90.9  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5936  HipA N-terminal domain protein  27.14 
 
 
456 aa  90.5  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  27.6 
 
 
430 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>