218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0511 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  100 
 
 
422 aa  836    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  45.5 
 
 
414 aa  296  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  40.8 
 
 
454 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  37 
 
 
382 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  35.57 
 
 
435 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  37.5 
 
 
425 aa  192  7e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  38.36 
 
 
418 aa  189  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  33.25 
 
 
426 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  34.91 
 
 
437 aa  186  9e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  32.41 
 
 
438 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  35.04 
 
 
435 aa  183  6e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  35.73 
 
 
435 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  36.39 
 
 
362 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  38.89 
 
 
449 aa  179  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  30.44 
 
 
439 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  32.88 
 
 
441 aa  178  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  32.64 
 
 
480 aa  173  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  31.13 
 
 
434 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  35.71 
 
 
440 aa  171  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  38.44 
 
 
460 aa  171  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  33.08 
 
 
451 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  35.76 
 
 
450 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  35.69 
 
 
440 aa  166  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  35.19 
 
 
439 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  30.12 
 
 
435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  35.16 
 
 
445 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  33.11 
 
 
450 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  34.65 
 
 
416 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  35.71 
 
 
433 aa  163  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0282  HipA domain-containing protein  34.92 
 
 
451 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  33.71 
 
 
450 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  34.16 
 
 
411 aa  160  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  30.22 
 
 
435 aa  160  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  32.13 
 
 
449 aa  160  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  35.2 
 
 
443 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  35.56 
 
 
446 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  33.04 
 
 
439 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  32.2 
 
 
444 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  32.48 
 
 
427 aa  157  3e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  34.53 
 
 
445 aa  157  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  31.53 
 
 
435 aa  157  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  31.53 
 
 
435 aa  157  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  30.73 
 
 
440 aa  157  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  35.28 
 
 
446 aa  156  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  33.25 
 
 
422 aa  155  9e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  30.92 
 
 
433 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  33.17 
 
 
444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  34.45 
 
 
446 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  33.33 
 
 
453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  32.94 
 
 
444 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  29.98 
 
 
433 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  35 
 
 
446 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  28.67 
 
 
434 aa  153  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  34.19 
 
 
444 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  32.56 
 
 
444 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  34.22 
 
 
446 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  34.2 
 
 
441 aa  151  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  34.55 
 
 
434 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  34.55 
 
 
434 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  31.67 
 
 
442 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  30.21 
 
 
433 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  33.82 
 
 
450 aa  150  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  30.26 
 
 
433 aa  149  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  29.36 
 
 
433 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  32.95 
 
 
447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  29.67 
 
 
433 aa  146  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  33.87 
 
 
430 aa  146  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  29.63 
 
 
431 aa  146  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5936  HipA N-terminal domain protein  30.73 
 
 
456 aa  145  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  33.09 
 
 
434 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  29.27 
 
 
433 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  29.59 
 
 
427 aa  144  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  29.81 
 
 
423 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  34.02 
 
 
419 aa  143  7e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  31.78 
 
 
440 aa  142  9e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  31.78 
 
 
440 aa  142  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  31.78 
 
 
440 aa  142  9e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  31.78 
 
 
440 aa  142  9e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  33.09 
 
 
434 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  31.78 
 
 
440 aa  142  9e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  35.29 
 
 
440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  31.78 
 
 
408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1775  HipA N-terminal domain protein  29.83 
 
 
404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.474256  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  35.38 
 
 
446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  29.98 
 
 
446 aa  141  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  34.79 
 
 
450 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  34.79 
 
 
450 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  34.79 
 
 
450 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  34.79 
 
 
450 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  34.79 
 
 
450 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  34.34 
 
 
622 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  31.2 
 
 
435 aa  139  8.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  30.03 
 
 
404 aa  136  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  33.33 
 
 
461 aa  136  9e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  32.28 
 
 
412 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  32 
 
 
430 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  30.73 
 
 
400 aa  132  9e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  32.13 
 
 
380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  31.28 
 
 
418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  30.1 
 
 
413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0420791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>