175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4225 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  894    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  49.77 
 
 		 435 aa  396  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  46.59 
 
 		 433 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  48.03 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  44.14 
 
 		 441 aa  354  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  44.24 
 
 		 434 aa  350  4e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  43.19 
 
 		 439 aa  342  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  40.91 
 
 		 435 aa  322  9.999999999999999e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  44.58 
 
 		 435 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  44.58 
 
 		 435 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  41.36 
 
 		 435 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  39.68 
 
 		 439 aa  311  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  40.87 
 
 		 439 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  44.47 
 
 		 447 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  45.77 
 
 		 446 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  39.58 
 
 		 438 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  42.63 
 
 		 441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  44.49 
 
 		 444 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  42.06 
 
 		 440 aa  302  6.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  44.13 
 
 		 440 aa  301  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  42.63 
 
 		 450 aa  301  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  45.41 
 
 		 446 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  44.49 
 
 		 444 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  44.52 
 
 		 444 aa  297  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  44.29 
 
 		 446 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  41.8 
 
 		 446 aa  295  9e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  41.47 
 
 		 446 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  43.94 
 
 		 446 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  41.24 
 
 		 449 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  39.82 
 
 		 442 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  42.89 
 
 		 444 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  42.47 
 
 		 450 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  39.95 
 
 		 444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  41.65 
 
 		 446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  39.34 
 
 		 440 aa  279  7e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  39.34 
 
 		 440 aa  279  7e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  39.34 
 
 		 440 aa  279  7e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  39.34 
 
 		 440 aa  279  7e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  39.34 
 
 		 440 aa  279  7e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  43.2 
 
 		 445 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  43.06 
 
 		 622 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  44.12 
 
 		 380 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  43.06 
 
 		 450 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  43.06 
 
 		 450 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  43.06 
 
 		 450 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  43.06 
 
 		 450 aa  272  7e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  43.06 
 
 		 450 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  43.24 
 
 		 440 aa  271  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  39.12 
 
 		 445 aa  270  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  36.77 
 
 		 440 aa  266  4e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  38.87 
 
 		 351 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  30.02 
 
 		 435 aa  196  6e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  33.33 
 
 		 425 aa  179  9e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  32.7 
 
 		 414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  34.53 
 
 		 461 aa  167  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  34.25 
 
 		 480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  35.2 
 
 		 422 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  34.2 
 
 		 426 aa  160  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  32.21 
 
 		 454 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  32.44 
 
 		 411 aa  140  6e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  30.89 
 
 		 427 aa  136  9e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  32.04 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  28.29 
 
 		 435 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  34.62 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  29.05 
 
 		 433 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  31.85 
 
 		 434 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  31.85 
 
 		 434 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  31.23 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  26.96 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  33.53 
 
 		 416 aa  123  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  30.96 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  32.73 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  30.88 
 
 		 430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  32.39 
 
 		 434 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  30.38 
 
 		 427 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  32.08 
 
 		 434 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  31.82 
 
 		 435 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  29.75 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  29.95 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  31.29 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  29.73 
 
 		 433 aa  114  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  30.58 
 
 		 423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1765  protein HipA  36.71 
 
 		 176 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  32.82 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  32.32 
 
 		 433 aa  107  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  28.35 
 
 		 450 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  29.73 
 
 		 453 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  26.84 
 
 		 450 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  31.1 
 
 		 460 aa  99.8  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0282  HipA domain-containing protein  29.53 
 
 		 451 aa  97.8  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4031  HipA N-terminal domain protein  43.86 
 
 		 222 aa  94.4  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  31.43 
 
 		 451 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  31.23 
 
 		 419 aa  87.4  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  26.35 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  31.21 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0568  hypothetical protein  40.37 
 
 		 116 aa  82.4  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  30.03 
 
 		 440 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  29.47 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  27.23 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  24.65 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>