181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0064 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  100 
 
 
434 aa  900    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  52.56 
 
 
441 aa  464  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  51.64 
 
 
439 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  50.91 
 
 
435 aa  458  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  48.05 
 
 
442 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  46.22 
 
 
439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  46.5 
 
 
444 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  46.79 
 
 
439 aa  398  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  47.14 
 
 
438 aa  394  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  46.08 
 
 
444 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  47.04 
 
 
440 aa  387  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  46.51 
 
 
435 aa  387  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  45.26 
 
 
440 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  45.26 
 
 
440 aa  384  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  46.04 
 
 
437 aa  384  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  45.26 
 
 
440 aa  384  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  45.26 
 
 
440 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  45.26 
 
 
440 aa  384  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  46.07 
 
 
444 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  43.91 
 
 
450 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  43.91 
 
 
622 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  45.85 
 
 
441 aa  378  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  43.91 
 
 
450 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  43.91 
 
 
450 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  43.91 
 
 
450 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  43.91 
 
 
450 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  45.73 
 
 
446 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  43.44 
 
 
450 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  44.63 
 
 
435 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  46.14 
 
 
446 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  46.14 
 
 
446 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  45.67 
 
 
444 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  45.9 
 
 
446 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  45.67 
 
 
444 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  43.84 
 
 
440 aa  364  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  43.35 
 
 
447 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  41.8 
 
 
446 aa  355  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  45.33 
 
 
440 aa  353  2.9999999999999997e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  44.55 
 
 
445 aa  345  8.999999999999999e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  42.48 
 
 
433 aa  344  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  41.03 
 
 
446 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  41.38 
 
 
435 aa  343  4e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  41.38 
 
 
435 aa  343  4e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  43.02 
 
 
440 aa  342  8e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  40.91 
 
 
445 aa  339  5e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  44.24 
 
 
443 aa  339  5e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  42.13 
 
 
449 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  43.38 
 
 
446 aa  337  2.9999999999999997e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  42.68 
 
 
450 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  43.75 
 
 
380 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  43.64 
 
 
351 aa  291  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  37.74 
 
 
425 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  32.4 
 
 
435 aa  216  5e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  32.93 
 
 
461 aa  192  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  30.44 
 
 
426 aa  178  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  33.33 
 
 
414 aa  177  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  31.13 
 
 
422 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  30.14 
 
 
454 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  29.93 
 
 
480 aa  159  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  30.08 
 
 
411 aa  158  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  27.36 
 
 
427 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1765  protein HipA  42.41 
 
 
176 aa  140  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  28.26 
 
 
382 aa  139  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  27.66 
 
 
427 aa  132  9e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  28.43 
 
 
418 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  29.12 
 
 
422 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0568  hypothetical protein  53.4 
 
 
116 aa  122  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116615  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  27.95 
 
 
433 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  27.95 
 
 
433 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  27.95 
 
 
433 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  30.03 
 
 
449 aa  120  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  28.68 
 
 
435 aa  120  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4031  HipA N-terminal domain protein  49.06 
 
 
222 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  29.87 
 
 
433 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  28.43 
 
 
423 aa  117  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  28.17 
 
 
433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  26.72 
 
 
435 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  27.12 
 
 
460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  25.81 
 
 
433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  28.3 
 
 
433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  29.41 
 
 
416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  28.12 
 
 
430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  26.92 
 
 
434 aa  109  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  26.54 
 
 
434 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  26.54 
 
 
434 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  26.69 
 
 
450 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  26.73 
 
 
419 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  26.98 
 
 
453 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  27.67 
 
 
430 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  28.41 
 
 
434 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  28.41 
 
 
434 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  26.84 
 
 
450 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  29.65 
 
 
451 aa  97.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5936  HipA N-terminal domain protein  26.82 
 
 
456 aa  93.6  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  24.32 
 
 
408 aa  93.6  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0282  HipA domain-containing protein  28.03 
 
 
451 aa  83.6  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  29.14 
 
 
362 aa  83.2  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1825  HipA N-terminal domain protein  24.23 
 
 
415 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  25.48 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  25.32 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0420791 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>