158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1916 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  100 
 
 
441 aa  912    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  50.11 
 
 
444 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  50.68 
 
 
444 aa  430  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  50.11 
 
 
444 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  48.31 
 
 
450 aa  424  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  48.31 
 
 
444 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  48.98 
 
 
441 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  49.88 
 
 
450 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  49.88 
 
 
622 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  50 
 
 
446 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  49.88 
 
 
450 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  49.88 
 
 
450 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  49.88 
 
 
450 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  49.88 
 
 
450 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  46.8 
 
 
442 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  46.91 
 
 
444 aa  402  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  48.31 
 
 
446 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  48.31 
 
 
446 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  48.62 
 
 
446 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  47.74 
 
 
439 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  44.47 
 
 
446 aa  388  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  46.45 
 
 
446 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  47.25 
 
 
445 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  46.29 
 
 
447 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  46.08 
 
 
435 aa  382  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  45.85 
 
 
434 aa  378  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  45.48 
 
 
446 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  45.29 
 
 
439 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  44.39 
 
 
449 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  46.65 
 
 
440 aa  370  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  48.67 
 
 
380 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  42.53 
 
 
438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  42.53 
 
 
439 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  42.53 
 
 
435 aa  354  1e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  44.44 
 
 
435 aa  348  8e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  44.44 
 
 
435 aa  348  8e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  45.03 
 
 
445 aa  343  4e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  44.8 
 
 
440 aa  341  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  41.53 
 
 
440 aa  335  1e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  42.86 
 
 
437 aa  333  3e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  44.52 
 
 
440 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  42.76 
 
 
435 aa  310  4e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  40.69 
 
 
433 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  40.37 
 
 
440 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  40.37 
 
 
440 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  40.37 
 
 
440 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  40.37 
 
 
440 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  40.37 
 
 
440 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  42.33 
 
 
443 aa  299  6e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  38.57 
 
 
450 aa  256  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  39.26 
 
 
351 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  31.52 
 
 
435 aa  190  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  32.09 
 
 
425 aa  187  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  32.57 
 
 
426 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  34.2 
 
 
422 aa  151  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  32.93 
 
 
461 aa  150  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  30.23 
 
 
411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  30.61 
 
 
427 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  28.91 
 
 
454 aa  139  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  32.25 
 
 
414 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  28.95 
 
 
480 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  30.42 
 
 
435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  32.13 
 
 
418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  31.75 
 
 
382 aa  123  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  30.72 
 
 
449 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1765  protein HipA  38.82 
 
 
176 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4031  HipA N-terminal domain protein  50.44 
 
 
222 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  30.2 
 
 
433 aa  106  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0568  hypothetical protein  51 
 
 
116 aa  103  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116615  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  30.18 
 
 
422 aa  100  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  27.36 
 
 
427 aa  100  8e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  31.99 
 
 
419 aa  96.7  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  28.61 
 
 
362 aa  96.7  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  26.77 
 
 
408 aa  93.2  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  28.61 
 
 
460 aa  92.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  25.35 
 
 
433 aa  92  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  27.27 
 
 
430 aa  91.3  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  25.81 
 
 
430 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  25 
 
 
435 aa  90.5  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  26.48 
 
 
433 aa  90.1  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  26.2 
 
 
433 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  26.48 
 
 
433 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  28.43 
 
 
440 aa  89.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  27.61 
 
 
409 aa  89  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  25.94 
 
 
423 aa  87.4  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  25.94 
 
 
433 aa  87  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  25.81 
 
 
433 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  25.13 
 
 
434 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  29.89 
 
 
451 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  29.41 
 
 
416 aa  84  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  25.55 
 
 
413 aa  82  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  27.54 
 
 
418 aa  80.1  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2873  HipA N-terminal domain protein  26.42 
 
 
396 aa  76.6  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3446  HipA domain-containing protein  30.31 
 
 
617 aa  76.3  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  25.9 
 
 
418 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  24.82 
 
 
434 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  24.82 
 
 
434 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  25.45 
 
 
450 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  23.94 
 
 
431 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  24.86 
 
 
413 aa  70.9  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0420791 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>