180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2873 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2873  HipA N-terminal domain protein  100 
 
 
396 aa  787    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  47.38 
 
 
409 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  48.77 
 
 
418 aa  303  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  44.03 
 
 
408 aa  291  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  30.87 
 
 
422 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  30.95 
 
 
413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  31 
 
 
413 aa  109  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  31.37 
 
 
418 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  30 
 
 
430 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4901  putative regulator containing a HipA-like domain  31.33 
 
 
433 aa  97.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.460954  normal  0.048459 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  30.51 
 
 
435 aa  97.1  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  28.49 
 
 
435 aa  96.7  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  29.85 
 
 
437 aa  96.3  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  31.88 
 
 
418 aa  95.9  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  29.15 
 
 
425 aa  93.6  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  29.08 
 
 
438 aa  93.6  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  30.19 
 
 
382 aa  93.2  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  28.83 
 
 
437 aa  92.8  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  29.07 
 
 
441 aa  92.4  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0687  HipA-like protein  29.72 
 
 
413 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  31.34 
 
 
449 aa  91.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  28.86 
 
 
454 aa  90.9  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  29.8 
 
 
460 aa  91.3  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  27.07 
 
 
439 aa  90.1  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  25.14 
 
 
418 aa  90.1  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  28.26 
 
 
435 aa  89.7  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  28.5 
 
 
440 aa  89.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  28.46 
 
 
440 aa  89.4  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1775  HipA N-terminal domain protein  29.78 
 
 
404 aa  87.4  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.474256  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  30.43 
 
 
305 aa  87  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  31.35 
 
 
433 aa  86.3  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  30.56 
 
 
443 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  25.93 
 
 
431 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  26.48 
 
 
433 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  27.42 
 
 
450 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  26.33 
 
 
433 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  30.13 
 
 
422 aa  83.2  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  27.59 
 
 
439 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4032  HipA domain-containing protein  29.03 
 
 
444 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.716492 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  27.46 
 
 
450 aa  82.4  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  27.72 
 
 
435 aa  82.4  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  26.35 
 
 
400 aa  81.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3446  HipA domain-containing protein  36.84 
 
 
617 aa  81.6  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  24.39 
 
 
441 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  29.21 
 
 
411 aa  81.3  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  26.58 
 
 
439 aa  81.3  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  25.99 
 
 
433 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  28.91 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  28.32 
 
 
451 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  28.57 
 
 
435 aa  79.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  24.59 
 
 
433 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  28.57 
 
 
435 aa  79.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  27.22 
 
 
440 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  27.22 
 
 
440 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  27.22 
 
 
440 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  25.17 
 
 
435 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  24.93 
 
 
433 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  25.29 
 
 
440 aa  78.2  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  24.59 
 
 
423 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  26.59 
 
 
414 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  32.74 
 
 
318 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  27.22 
 
 
440 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  27.22 
 
 
440 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  25.21 
 
 
433 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  30.41 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  28.86 
 
 
446 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  29.03 
 
 
416 aa  78.2  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  32.93 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  28.4 
 
 
443 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  25.73 
 
 
433 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  24.91 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  26.24 
 
 
395 aa  75.9  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  29.52 
 
 
461 aa  75.9  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  27.08 
 
 
450 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  29.11 
 
 
447 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  25.53 
 
 
435 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  27.42 
 
 
447 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4056  HipA-like  34.97 
 
 
613 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.970389  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  27.56 
 
 
450 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  27.13 
 
 
430 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1825  HipA N-terminal domain protein  27.59 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3103  HipA domain-containing protein  26.93 
 
 
449 aa  73.2  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891938  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  26.3 
 
 
444 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  30.34 
 
 
440 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  27.65 
 
 
430 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  27.46 
 
 
434 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  27.46 
 
 
434 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0556  HipA domain-containing protein  34.31 
 
 
620 aa  70.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0889579  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  28.09 
 
 
434 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  29.45 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  30.23 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  25.62 
 
 
444 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  27.86 
 
 
434 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  29.09 
 
 
407 aa  69.3  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  27.48 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  28.27 
 
 
445 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  23.65 
 
 
420 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  28.48 
 
 
362 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  23.65 
 
 
420 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0242  HipA-like-like  22.76 
 
 
526 aa  68.2  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.430358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>